Cỏc cm gen " ng v#t cú vỳ

Một phần của tài liệu Ebook cytochrome p450 phần 2 PGS TS nguyễn thị ngọc dao (Trang 39 - 43)

- Cỏc sqc t# Cỏc phõn t S b e o v !

5.1.2.Cỏc cm gen " ng v#t cú vỳ

NH NG GEN Cyt-P450 VÀ S BIU HIN C A CHÚNG

5.1.2.Cỏc cm gen " ng v#t cú vỳ

Nh�ng nghiờn c�u nh�m xỏc ��nh v� trớ � NST c�a cỏc gen

��ng v�t cú vỳ �ó ���c t�p trung vào genom c�a ng��i và chu�t nh�t. Trong kho�ng 20 d��i gia �ỡnh Cyt-P450 ��ng v�t cú vỳ, 16 gen �ó ���c xỏc ��nh �nh�ng NST ��c hi�u �ng��i ho�c chu�t (B�ng 5.1). Nh� � b�ng 5.1, cỏc gen CYP �ó phõn tỏn qua nhi�u NST khỏc nhau, �ụi khi t�o thành nh�ng bỳi gen. Cho t�i lỳc này cỏc gen ng��i và chu�t �ó ���c b�n �� húạ Bỳi th� nh�t ��nh v�

trờn nhỏnh dài c�a NST 19 �ng��i, NST 7 �chu�t nh�t và NST 1

� chu�t c�ng và bao g�m kho�ng 10 trỡnh t� gen ho�c t�ơng t�

gen c�a CYP2A, CYP2B và CYP2F (d��i gia �ỡnh). Simmon và Kasper (theo Osamu Gotoh) tỡm th�y s� liờn k�t ch�t ch� gi�a nh�ng bỳi gen này và locus Coh (Coumarin hydroxylase) c�a chu�t nh�t. Sau �ú, Negishi và cs. �ó kh�ng ��nh r�ng gen Coh th�c ra ���c mó húa b�i CYP2A5. Ho�t tớnh th�y phõn coumarin v� trớ s� 7 � ng��i c�ng ���c mó húa b�i 1 gen CYP2Ạ Bỳi gen CYP21A �ng��i ho�c chu�t nh�t bao g�m 1 gen th�t và 1 gi�gen c�a nú. Nh�ng gen (và gi� gen) này ���c s�p x�p m�t cỏch ng�u nhiờn trong h�n h�p phự h�p t� ch�c c�a HLA trờn NST 6P �

Ch ng V. Nh�ng gen Cyt-P450 và s�bi�u hi�n c�a chỳng 119

B ng 5.1. V�trớ trờn NST c�a cỏc gen Cyt-P450 � ��ng v�t cú vỳ

(theo Osamu Gotoh)

Loài Gen S�

thành viờn +1 NST Phương phỏp+2

Ngư�i CYP1A1 1 15q22-q24 SH

Ngư�i CYP1A2 1 15 SH

Ngư�i CYP 2A 19q13.1-13.2 g�n gpi IS

Ngư�i CYP 2B ~4 19q13.1 – 13.2 SH, CL

Ngư�i CYP 2C >7 10q24.1-24.3 SH

Ngư�i CYP 2D ~3 22q11.2-qter LA

Ngư�i CYP 2E 1 10 SH

Ngư�i CYP 2F >2 19q13.1 13.2 SH, LA

Ngư�i CYP 3A ~5 7q21.3-q22.1 SH

Ngư�i CYP 4B >1 1q12-p34 SH

Ngư�i CYP 11A 1 15q23-24 SH, IS

Ngư�i CYP 11B ~2 8q21-22 SH, IS

Ngư�i CYP 17A ~2 10 SH

Ngư�i CYP 19 ~1 15q21.1-21.3 SH, IS

Ngư�i CYP 21 2 6q21.3 trong H2A LA

Ngư�i CYP 27 1 2q33-qter SH

Chu�t nh�t CYP1a2 1 9 c�nh Mpi-1 SH, RI Chu�t nh�t CYP2a >6 7 c�nh Col1, Gpi-1 SH, RI, BC

Chu�t nh�t CYP2c >7 19 c�nh Gol-1 SH, IS Chu�t nh�t CYP2d >5 1517 cm 55 kDa SH, RI

Chu�t nh�t CYP2e 1 17Tyr-1<Int-2 BC,SH

Chu�t nh�t CYP3 6 SH

Chu�t nh�t CYP4a 4 SH (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});

Chu�t nh�t CYP11a 1 9 g�n CYP1 RI

Chu�t nh�t CYP19 1 9 g�n CYP 11a RI

Chu�t nh�t CYP21 2 17 trong h-25 CL

Chu�t nh�t CYP27 1 1 SH

Chu�t c�ng CYP2B >9 1 g�n P BC

Ghi chỳ:

1)S� cỏc thành viờn trong m�i gia �ỡnh ho�c d��i gia �ỡnh. Khụng phõn bi�t cỏc gen và gi�gen. phõn bi�t cỏc gen và gi�gen.

2) Cỏc ph�ơng phỏp: BC: backcross; CL: cloning; LA: linkage analysis; IS: Lai in situ; RI: recombinant inbred-tỏi t�h�p t�nhiờn; SH: analysis; IS: Lai in situ; RI: recombinant inbred-tỏi t�h�p t�nhiờn; SH: somatic cell hybrid-lai t�bào Somạ

Nguy�n Th�Ng�c Dao

120

CYP21A mó húa cho enzyme 21-hydroxylasẹ B�nh c��ng th��ng th�n b�m sinh do thi�u h�t gen này, là m�t trong nh�ng b�nh di truy�n th��ng g�p nh�t. Gen h�c phõn t� c�a b�nh này �ó

���c nghiờn c�u r�t tớch c�c.

Locus CYP2D là bỳi gen khỏc c�ng ���c nghiờn c�u k� trong m�i liờn quan v�i s� �a d�ng di truy�n trong chuy�n húa thu�c. 5- 10% ng��i Caucasian là khụng cú kh� n�ng chuy�n húa debrisoquin, spartein, bufulralol và nh�ng thu�c khỏc. Tớnh tr�ng NST l�n này �i kốm v�i nh�ng s� thi�u h�t trong 1 gen CYP2D. M�t gen th�t và 2 gi� gen �ó ���c tỡm th�y trong bú gen CYP2D ng��i �NST 22. 5 gen CYP2D ho�t ��ng ���c s�p x�p m�t cỏch ng�u nhiờn trong genom chu�t c�ng, và m�t trong chỳng là gen c�a enzyme debrisoquine hydroxylasẹ Chu�t nh�t c�ng cú ớt nh�t 5 gen cyp2d trờn NST 15. M�t gen mó húa cho enzyme th�y phõn 16 - steroid, nh�ng ng��i ta khụng bi�t li�u cú gen mó húa cho enzym th�y phõn debrisoquin hay khụng. Nh�ng nghiờn c�u di truy�n phõn t�m�i�õy v�n ch�a làm rừ ���c cơs�phõn t�c�a tớnh l��ng hỡnh trong s� chuy�n húa debrisoquine � ng��i và chu�t c�ng. Nh�ng

��t bi�n�a d�ng�ó���c tỡm th�y là nguyờn nhõn c�a s�thi�u h�t chuy�n húa nàỵ

Kớch th��c c�a cỏc exon (bp) Kớch th��c c�a cỏc intron (bp)

Hỡnh 5.1. Bi�u�� d�ng c�t c�a exon (A) và intron (B) (cỏc kớch c�c�a gen Cyt-P450 � ��ng v�t cú vỳ)

(A) Bi�u ��d�ng c�t thu ���c t�t�ng s� 65 exon riờng bi�t trong 8 gia �ỡnh gen P-450 ��ng v�t cú vỳ. ���ng g�ch n�i��ch�t�nsuất c�a cỏc kớch th��c exon ���c mong đợi t� s� phõn b� ng�u nhiờn c�a cỏc liờn k�t exon-intron theo m�t trỡnh t� mó húạ (B) bi�u �� d�ng c�t thu ���c t�t�ng s�112 cỏc intron tiờu bi�u trong nh�ng gen P450 ��ng v�t cú vỳ khỏc nhaụ.

Ch ng V. Nh�ng gen Cyt-P450 và s�bi�u hi�n c�a chỳng 121 Bỳi gen cu�i cựng n�m trờn NST 15 ng��i và NST s� 9 �

chu�t, bờn c�nh locus c�a MPI/mpi – I (mannose phosphate isomerase). Bỳi này ch�a 3 gia �ỡnh gen P450 khỏc nhau (CYP1A, CYP11A và CYP19). � NST chu�t nh�t, nh�ng gen này liờn k�t ch�t ch�trong m�t vựng kho�ng 1 centi Morgan. Gia �ỡnh (d��i gia

�ỡnh) P450 này bao g�m 1 ho�c 2 thành viờn (B�ng 5.1), khụng nhi�u nh� �d��i gia �ỡnh CYP2A/2B �ó d�n�trờn. M�t gi�thuy�t thỳ v� là s�s�p x�p cỏc gen cú liờn quan t�i m�t s�cơch� �i�u hũa quan tr�ng, nh� là s� �i�u hũa phỏt tri�n ���c tỡm th�y trong bỳi gen globin. M�i �õy Kawajj và cs �ó th�y r�ng m�t MspI RFLP �

vựng flanking 3’ c�a CYP1A1 �ng��i cú th� �i kốm v�i nguy cơb�

ung th�ph�i d�ng carcinomas phỏt sinh do khúi thu�c lỏ.

A B

Hỡnh 5.2. Bi�u�� d�ng c�t c�a hàm lư�ng G+C �v�trớ codon th�3��i v�i 52 gen Cyt-P450 loài g�m nh�m (A) và 52 gen Cyt-P450 ��ng v�t cú

vỳ khỏc (B).

Tr�c tung c�a bi�u��bi�u th� t�n s�(frequency)

Tr�c hoành bi�u th�t�l�ph�n tr�m (%) G+C �v�trớ codon th�3

5.1.3. C(u t*o c,b.n c/a cỏc gen Cyt-P450 0 "ng v#t cú vỳ

B�ng 5.1 t�p h�p cỏc gen Cyt-P450 ��ng v�t cú vỳ mà nh�ng gen này �ó���c bi�t rừ v�c�u trỳc cơb�n. Kớch th��c c�a cỏc gen Cyt-P450 ��ng v�t cú vỳ thay ��i trong kho�ng t� kho�ng 3 kb (kilo base) ��i v�i gen steroid 21-hydroxylase (CYP21A) c�a ng��i, chu�t, bũ ��n hơn 70 kb ��i v�i gen aromatase ng��i (CYP19A). Vỡ m�i gen Cyt-P450 mó húa cho m�t kớch th��c th�ng nh�t c�a m�t protein cú kho�ng 500 acid amin, s� bi�n ��i trong

Nguy�n Th�Ng�c Dao (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});

122

kớch th��c c�a gen Cyt-P450 ���c cho là do vựng khụng mó húa, ch� y�u là cỏc intron và ��i v�i m�t s� ớt gen là do nh�ng vựng khụng ���c d�ch mó. T�t c� nh�ng gen Cyt-P450 ��ng v�t cú vỳ

���c tỡm th�y là b� tr��t ��n m�t s� vựng b�i cỏc intron xen vàọ Gen cholesterol 7 –hydroxylase (CYP7A) cú s� l��ng nh� cỏc exon (kho�ng 6 exon) trong khi gen -hydroxylase thu�phõn v� trớ c�a axit lauric chu�t c�ng (CYP4A1) và gen testosterone 6 - hydroxylase chu�t c�ng (CYP3A2) cú t�i 13 exon m�i lo�ị

Exon dài nh�t mó húa cho trỡnh t�protein �ó���c quan sỏt cho t�i nay là exon 2, exon mó húa ��u tiờn c�a gen CYP1A1 (kho�ng 830bp) trong khi ng�n nh�t là exon 3 CYP4A2 (36bp). �� dài cỏc intron c�a gen Cyt-P450 l�n hơn c�a cỏc exon. Intron 3 c�a CYP2D2 cú �� dài 73 bp là intron kớch th��c nh� nh�t ���c tỡm th�y trong gen P450 cho t�i naỵ Cơch� tr��t ch�c là khụng �ỳng

��i v�i nh�ng exon và intron quỏ ng�n. Nh�phỏt hi�n m�i�õy, c�u t�o exon-intron ���c duy trỡ m�t cỏch cơ b�n trong m�t gia �ỡnh gen, m�t khỏc cỏc gen c�a nh�ng gia �ỡnh khỏc nhau th� hi�n s�

khụng gi�ng nhau trong c�u t�o c�u trỳc c�a chỳng, lo�i tr� tr��ng h�p cỏ bi�t c�a c�p gen CYP17 và CYP21.

Một phần của tài liệu Ebook cytochrome p450 phần 2 PGS TS nguyễn thị ngọc dao (Trang 39 - 43)