8 Hút 10µl sản phẩm PCR chạy điện di gel bằng agarose 1,5% sau đó phân tích và giải thích kết quả
4.2.TỶ LỆ MANG GEN magA, rmpA; SEROTYPE CỦA MỘT SỐ CHỦNG K PNEUMONIAE PHÂN LẬP ĐƯỢC THEO BỆNH PHẨM
CHỦNG K. PNEUMONIAE PHÂN LẬP ĐƯỢC THEO BỆNH PHẨM 4.2.1. Tỷ lệ mang gen magA, rmpA của các chủng K. pneumoniae phân lập được theo bệnh phẩm
4.2.1.1. Tỷ lệ mang gen magA, rmpA của các chủng K. pneumoniae phân lập được lập được
K. pneumoniae là một loài vi khuẩn Gram âm thuộc họ
Enterobacteriaceae. Tuy nhiên, có sự khác biệt giữa K. pneumoniae và
Enterobacteriaceae khác là sự hiện diện của lớp vỏ polysaccharide dày, được cho là yếu tố độc lực quan trọng giúp K. pneumoniae tránh được hiện tượng thực bào [8], [15].
Qua nghiên cứu của các tác giả nước ngoài cho thấy nhiễm khuẩn K. pneumoniae rất đa dạng. Sự đa dạng của nhiễm khuẩn có K. pneumoniae liên qua đến địa lý, kinh tế xã hội, giữa các dân tộc và các quốc gia khác nhau thì biểu hiện nhiễm khuẩn K. pneumoniae cũng khác nhau. Vì vậy các nhà khoa học trên thế giới đã tiến hành nghiên cứu kiểu hình và kiểu gen của K. pneumoniae ở các quốc gia khác nhau [99].
Gần đây một số nhà khoa học trên thế giới đã nghiên cứu các yếu tố độc lực của K. pneumoniae, bao gồm gen magA và rmpA, serotype K1, K2 và kiểu hình chất nhày [37], [51], [67], [100]. Các nhà khoa học Đài Loan đã giải trình tự bộ gene của chủng NTUH-K2044 phân lập từ trường hợp áp xe gan đầu tiên do K. pneumoniae phát hiện ở Đài Loan [65]. Các nghiên cứu cũng cho thấy magA và rmpA liên quan đến kiểu hình chất nhày, thường hay gặp trong nhiễm khuẩn mủ áp xe [105].
Gen magA (gen liên quan đến chất nhày) gần đây đã được xác định trong các chủng K. pneumoniae gây áp xe gan ở bệnh nhân không chỉ ở Đài Loan mà còn các nước khác trên thế giới. Chủng K. pneumoniae mang gen
magA thì độc lực tăng và có khả năng gây bệnh nặng dẫn đến tỷ lệ tử vong cao đối với người bệnh [37], [77]. Nghiên cứu về K. pneumoniae tại Đài Loan cho thấy, sự kết hợp của gen magA với kiểu gen chất nhày có liên quan đến sinh bệnh học của thể áp xe gan. Gen rmpA được biết đến với chức năng chịu trách nhiệm tổng hợp vỏ ngoài polysaccharide của kiểu hình chất nhày. Ngoài magA thì rmpA cũng có thể đóng vai trò quan trọng trong biểu hiện của kiểu hình chất nhày [93].
Theo báo cáo của Xianfeng Z. tại Đài Loan, tỷ lệ các chủng K. pneumoniae mang gen magA là 48%, rmpA là 38% [104]. Một nghiên cứu khác của tác giả Kuo-Ming Y. ở Singapore và Đài Loan cũng cho thấy tỷ lệ mang gen magA là 46,6%, rmpA là 67,1% [67]. Sự phổ biến gen magA
(42,3%) và rmpA (57,7%) của các chủng K. pneumoniae cũng thấy trong nghiên cứu của Susan Shin-Jung Lee [90]. Một nghiên cứu khác tại Đài Loan năm 2008 của tác giả Chen-Hsiang L. cho biết, tỷ lệ K. pneumoniae mang gen
magA là 8,8% và rmpA là 38,5% [39].
Nghiên cứu của tác giả Hadis A. tại Iran năm 2012 cho thấy, tỷ lệ K. pneumoniae mang gen magA là 2,31% [58]. Theo nghiên cứu khác của tác giả Majid H. cũng tại Iran năm 2012-2013 thì tỷ lệ K. pneumoniae mang gen
rmpA là 27,5% [72].
Trong nghiên cứu của chúng tôi tổng số chủng là 537 nhưng do kinh phí có hạn nên chúng tôi lấy 213 chủng K. pneumoniae chủ yếu là mẫu bệnh phẩm từ các tổ chức tổn thương kín như: bệnh phẩm máu, mủ áp xe, dịch não tủy, dịch màng bụng, đồng thời chúng tôi cũng lấy thêm một số chủng K.
pneumoniae phân lập từ mẫu bệnh phẩm nước tiểu, đờm và dịch họng. Chúng tôi đã sử dụng kỹ thuật PCR với cặp mồi magA và rmpA để xác định gen
magA và rmpA. Kết quả cho thấy, có 18,7% số chủng K. pneumoniae mang gen magA và 55,4% số chủng mang gen rmpA (bảng 3.14, trang 79). Tỷ lệ K. pneumoniae mang gen magA trong nghiên cứu của chúng tôi thấp hơn so với nghiên cứu của một số tác giả nước ngoài nhưng lại cao hơn so với nghiên cứu tại Iran [58], [67], [90]. Tỷ lệ K. pneumoniae mang rmpA lại tương đối phù hợp với nghiên cứu của một số tác giả nước ngoài [90].