Vaccine phải gây ựược ựáp ứng miễn dịch: dịch thể hoặc trung gian tế bào.
a. Vaccine bất hoạt
đây là loại vaccine phổ biến dùng cho cá, có thể sử dụng phương pháp ngâm hoặc tiêm có bổ sung nhũ dầu cho cá. Vaccine bất hoạt chủ yếu là vaccine phòng các bệnh do vi khuẩn, không có vaccine phòng bệnh KST, và rất ắt vaccine phòng bệnh do vi rút. Chi phắ ứng dụng trong sản xuất thường cao, hiệu quả thấp và ắt ựược ứng dụng cho cá nhỏ.
Thường gây bất hoạt vi khuẩn bằng nhiệt ựộ hoặc formalin ựể làm vaccine.
Vaccine bất hoạt thường gây 1 ựáp ứng miễn dịch dịch thể và ắt gây ựáp ứng miễn dịch trung gian tế bào hay ựáp ứng mucosal.
Các loại vaccine bất hoạt rất thành công: V. anguillarum, V. ordalii, A. salmonicida
và Y. ruckerii
b. Vaccine sống nhược ựộc
Tác nhân vẫn sống sót, phát triển trong ký chủ nhưng ựã bị biến ựổi và hiện tại không còn khả năng gây bệnh, chúng gây ựáp ứng miễn dịch lâu dài ựặc biệt kắch thắch miễn dịch tế bào và gây ựáp ứng nhớ.
Tuy nhiên vaccine nhược ựộc có thể trở lại ựộc lực.
c. Vaccine là thành phần của tế bào: ngoại ựộc tố, giáp mô, nha bào, vaccine tái tổ hợp (IPN: infectious pancreatic necrosis, Norway - Vaccine phòng bệnh hoại từ gan tụy truyền nhiễm trên cá), DNA vaccine (IHN = infectious hepatopoietic necrosis - vaccine phòng bệnh hoại tử tế bào tạo máu truyền nhiễm; VHS = viral hemorrhagic septicemia - virus nhiễm trùng huyết).
DNA vaccine dễ dùng, dễ dự trữ, sản xuất rẻ và không ựộc lực trở lại
DNA có thể cho một ựáp ứng miễn dịch ựặc hiệu thông qua kháng thể, Th, Tc Tuy nhiên việc xin giấy phép cho DNA vaccine là khó, hiện chưa có DNA vaccine nào ựược dùng cho người, thú y.