Nagasaki lại là cửa ngõ chính của Nhật Bản đi ra bên ngoài. Quan trọng hơn, chặng buôn bán Ma Cao – Nagasaki đƣợc hỗ trợ bởi các tuyến thƣơng mại khác gắn kết với những trung tâm thƣơng mại quan trọng của khu vực, cùng với đó là những đội ngũ doanh thƣơng giàu kinh nghiệm [34, 163].
Tuy nhiên, nhiều khi lƣợng hàng hóa mà các tàu này chuyên chở còn có đƣợc lợi nhuận lớn hơn rất nhiều. Tàu buôn Bồ Đào Nha thƣờng đƣa đến nhiều mặt hàng mà ngƣời Nhật thèm muốn, đặc biệt là tơ lụa Trung Hoa. Những loại tơ lụa hảo hạng đã đem lại lợi nhuận rất cao, có khi lên đến 100% cho thƣơng nhân Bồ. Trong những năm cuối thế kỷ XVI, trung bình hàng năm có khoảng 1.600 picul lụa đƣợc nhập vào Nhật Bản. Vào thời gian đó, 1 picul lụa mua ở thị trƣờng Trung Quốc là 90
ducat bạc và bán ở Nhật Bản là 140 ducat. Nếu trừ đi khoảng 10% thuế hàng hóa và 3% các khoản phụ chi khác thì 1 picul lụa bán đƣợc 121 ducat. Tức là chỉ riêng tơ lụa, thông qua buôn bán chính thức, hàng năm các thƣơng nhân Bồ Đào Nha đã thu đƣợc một khoản lãi là 49.600 ducat bạc. Đồng thời họ cũng thu đƣợc món lợi lớn qua việc nhập vào Nhật Bản súng trƣờng, thuốc súng, đại bác và mua bạc ở Nhật Bản để bán lại trên thị trƣờng thế giới. Theo ƣớc tính, lƣợng bạc hàng năm ngƣời Bồ Đào Nha đem về Ma Cao có giá trị khoảng hơn nửa triệu ducat thông qua việc trao đổi hàng hóa mà tàu của họ chở đến [37, 103-104].
Các con tàu của Bồ Đào Nha đã có mặt ở hầu hết các tụ điểm thƣơng mại mà ngƣời Bồ xây dựng đƣợc trƣớc đó. Các con tàu này thƣờng xuất phát từ Goa, chở theo nhiều mặt hàng đƣợc sản xuất ở châu Âu nhƣ: Lông thú, nhung, pha lê, thủy tinh, đồng hồ, ống nhòm, la bàn, thuốc lá, rƣợu Bồ Đào Nha và cả một số sản phẩm từ Trung - Nam Á nhƣ thủy tinh, vải hoa Ấn Độ. Khi đến Malacca, một số lƣợng hàng nhất định trong số hàng này đƣợc sử dụng để đổi lấy hƣơng liệu và thổ sản địa phƣơng. Khi đến Ma Cao, hàng hóa lại tiếp tục để đổi lấy vàng, tơ lụa mà các thƣơng nhân, viên chức của thƣơng điếm Bồ Đào Nha đã chuẩn bị sẵn. Tàu nhổ neo đến Nhật Bản vào khoảng tháng 7 hay tháng 8 tùy theo gió mùa Tây - Nam. Vào cuối thế kỷ XVI, để đi từ Ma Cao đến Nagasaki phải mất trung bình 14 ngày, tùy