- Nội dung kiểm soát: Quản lý dòng tiền vào, ra khỏi Quỹ và tồn ngân quỹ hiện còn tại từng thời điểm, gồm:
2.3.1. Những thành tựu
Một là, việc quản lý, kiểm soát các nghiệp vụ nhập, xuất các quỹ TCNN ngoài ngân sách đãphần nào đã hạn chế việc thất thoát và lạm dụng công quỹ
(do các cơ quan, đơn vị không được phép cất giữ tiền mặt tại cơ quan, đơn vị hay gửi tại các Ngân hàng thương mại để sử dụng không đúng mục đích gây những hậu quả tiêu cực).
Hai là, một số Quỹ có qui chế quản lý, kiểm soát chi đã được Chính phủ, Bộ Tài chính qui định tương đối đầy đủ, đồng bộ, rõ ràng thì việc thực hiện quản lý, kiểm soát chi của cơ quan Kho bạc mang lại "ít nhiều" hiệu quả.
Một số Qui chế quản lý tài chính Quỹ có sự phân biệt rõ rệt giữa chi đầu tư, và chi phí quản lý quỹ (chi thường xuyên), đồng thời thực hiện thủ tục chi và kiểm soát chi tương ứng với từng loại chi theo Luật NSNN, việc kiểm soát chi của cơ quan Kho bạc có đủ căn cứ pháp lý và kỹ thuật sẵn có nên hiệu quả kiểm soát tương đối rõ nét. Ví dụ, Quỹ sắp xếp lại, xử lý nhà, đất thuộc sở hữu nhà nước, qui định:
đối với dự án đầu tư thực hiện quy chế quản lý vốn đầu tư xây dựng cơ bản thuộc nguồn vốn ngân sách nhà nước; Bộ Tài chính làm chủ tài khoản đối với cơ quan, đơn vị thuộc Trung ương quản lý; Sở Tài chính làm chủ tài khoản đối với cơ quan, đơn vị thuộc địa phương quản lý; Kho bạc thực hiện kiểm soát, thanh toán theo qui trình kiểm soát, thanh toán vốn đầu tư do Bộ tài chính qui định. Với qui định trên, hiệu quả kiểm soát, thanh toán không có sự khác biệt so với các dựán đầu tư bằng nguồn vốn NSNN.
Ba là, việc tập trung toàn bộ các Quỹ ngoài ngân sách vào Kho bạc đã góp phần tăng khả năng tài trợ thiếu hụt ngân sách của cơ quan Kho bạc.
Tất cả các hoạt động thu, chi các Quỹ thông qua tài khoản tiền gửi tại Kho bạc, số tiền tạm thời nhàn rỗi của các Quỹ làm gia tăng tổng số tiền nhàn rỗi của Kho bạc, nhờ đó, việc tài trợ thiếu hụt tạm thời của ngân sách được giải quyết có hiệu quả (giải quyết kịp thời các khoản thiếu hụt ngân sách nhờ thủ tục tạm ứng đơn giản, nhất là giảm đáng kể các chi phí vay mượn của ngân sách)