Hàng năm, nhà trường tổ chức tuyển sinh đầu vào lớp 6, tuyển chọn HS có hạnh kiểm tốt, học lực giỏi và tuyển những học sinh lớp 6, 7, 8 đã đạt giải
Nhất, Nhì, Ba trong kỳ thi HSG cấp huyện ở tất cả các trường THCS trong toàn huyện.
Lãnh đạo nhà trường phân công mỗi đội tuyển HSG cấp huyện có một GV tham gia bồi dưỡng và mỗi đội tuyển HSG cấp Tỉnh có hai GV tham gia, trong đó có một GV phụ trách chính. GV phụ trách đội tuyển có nhiệm vụ chỉ đạo và hỗ trợ GV khác thực hiện đúng thời lượng, nội dung chương trình đề ra, theo dõi, kiểm tra, đánh giá quá trình học tập của HS và chịu trách nhiệm trước lãnh đạo nhà trường.
Hai tuần một lần, tổ trưởng chuyên môn tiến hành họp tổ, kiểm tra giáo án của các GV dạy đội tuyển nhằm đánh giá chất lượng giảng dạy và điều chỉnh kịp thời nội dung kiến thức, thời lượng theo đúng kế hoạch đã đề ra. Sau khi kiểm tra, tổ trưởng chuyên môn báo cáo với lãnh đạo nhà trường kết quả kiểm tra, từ đó lãnh đạo nhà trường quản lý được việc thực hiện kế hoạch của mỗi GV, chỉ đạo để các GV có sự điều chỉnh kế hoạch phù hợp nhằm đạt được mục tiêu giảng dạy. Qua các lần kiểm tra đó, các GV có ý thức, trách nhiệm trong việc xây dựng chương trình, nội dung giảng dạy theo đúng kế hoạch được phân công và đầu tư thời gian, công sức, trí tuệ cho các chuyên đề bồi dưỡng HSG.
Đối với đội tuyển HSG lớp 9, hàng tháng, lãnh đạo nhà trường trực tiếp gặp mặt HS đội tuyển tìm hiểu tâm tư, nguyện vọng của HS, động viên, khích lệ đồng thời tư vấn giúp HS tiếp tục định hướng đúng đắn mục tiêu học tập. Sau đó, lãnh đạo nhà trường góp ý với GV dạy đội tuyển thực hiện việc đổi mới phương pháp giảng dạy, điều chỉnh nội dung giảng dạy tạo sự hứng thú, tính tích cực và sáng tạo của HS trong quá trình học tập. Đối với các môn Ngữ văn, Toán học, Lịch sử và Tiếng Anh, GV thường xuyên giao bài tập cho HS và HS chủ động làm bài tập ở nhà, dành nhiều thời gian cho việc tự học. Một số GV đội tuyển đã sử dụng nguồn học liệu mở trên mạng để bồi dưỡng
HSG, qua đó đã tự bồi dưỡng nâng cao kiến thức chuyên môn, và nâng cao khả năng ứng dụng công nghệ thông tin trong giảng dạy.
Năm học 2011-2012, thực hiện chủ đề năm học” Tiếp tục đổi mới quản lý nâng cao chất lượng giáo dục”, nhà trường thực hiện một số nội dung đổi mới quản lý trong đó có nội dung “ Đổi mới quản lý hoạt động bồi dưỡng HSG”. Nhà trường đã tham mưu với phòng GD&ĐT tổ chức bồi dưỡng HSG môn Tin học, Tiếng Anh, Lịch sử, Địa lý lớp 9 ở trường THCS Yên Trung và Yên Đồng nhằm bổ sung HSG vào đội tuyển HSG của huyện tham dự kỳ thi HSG cấp Tỉnh do số HSG ở các đội tuyển này của nhà trường không đủ về số lượng theo yêu cầu của Sở GD&ĐT.