Công tác đánh giá viên chức còn một số hạn chế, với những nguyên nhân sau: chƣa quy định đánh giá viên chức cho từng cấp độ nên khó phân loại; Việc đánh giá vẫn mang nhiều tính hình thức. Viên chức chƣa thực sự quan tâm đến công tác đánh giá, vì kết quả đánh giá chƣa ảnh hƣởng tích cực đến mỗi một viên chức đƣợc đánh giá về mặt quyền lợi cũng nhƣ trách nhiệm; Các tiêu chí đánh giá đối với viên chức hiện nay khá chung chung, rất khó làm cơ sở để đánh giá viên chức; Việc tự đánh giá kết quả công tác theo nhiệm vụ đƣợc giao chƣa có cơ sở rõ ràng nên chƣa thực sự mang lại hiệu quả tƣơng xứng; Đánh giá viên chức hàng năm chƣa đồng bộ và trong quá trình thực hiện chƣa thật sự chú trọng phát huy nguyên tắc tập trung dân chủ.
2.5.3.1. Nguyên nhân chủ quan
- Đội ngũ viên chức đƣợc hình thành qua nhiều giai đoạn, Viện KHTCNN tiền thân là Trung tâm Nghiên cứu Khoa học và Thông tin (thành lập năm 1990) của Ban Tổ chức - Cán bộ Chính phủ, còn mang nặng cung cách làm việc của
59 cán bộ, công chức, việc đánh giá hàng năm còn mang tính chung chung, chƣa sát với những nội dung công việc, lãnh đạo, đồng nghiệp đánh giá còn cả nể, ngại va chạm.
- Chất lƣợng viên chức không đồng đều, còn tình trạng một số cán bộ lớn tuổi ngại sử dụng các công cụ hiện đại nhƣ máy vi tính, máy in, máy laptop trong thực hiện nhiệm vụ.
- Đội ngũ lãnh đạo còn ngại thay đổi, chƣa mạnh rạn trong việc gắn công tác đánh giá với việc kết quả hoạt động của viên chức, chƣa mạnh rạn có những hình thức khen thƣởng và kỷ luật đối với kết quả đánh giá của viên chức tại đơn vị, còn cả nể.
- Chƣa phân định cách đánh giá giữa các viên chức là lãnh đạo, quản lý, viên chức hoạt động chuyên môn và viên chức phục vụ, việc đánh giá còn chung chung, mang nặng tính cào bằng.
2.5.3.2. Nguyên nhân khách quan
- Trong suốt thời gian dài, việc nhận thức đầy đủ về tính lao động đặc thù của cán bộ làm công tác nghiên cứu khoa học, chƣa có chính sách hữu hiệu về công tác đánh giá đội ngũ viên chức khoa học công nghệ.
- Bên cạnh đó, việc nhận thức chƣa đúng, thiếu thống nhất ngay trong cách hiểu những khái niệm cốt lõi nhƣ “cán bộ”, “công chức”, “viên chức” đã dẫn đến việc lẫn lộn giữa các cách đánh giá.
- Đối với đơn vị nghiên cứu cơ bản việc tự chủ theo quy định còn khó khăn do các sản phẩm của nghiên cứu không tạo ra giá trị kinh tế, do đó, việc lấy cơ chế tài chính để khuyến khích những nhà nghiên cứu, những viên chức khoa học và công nghệ là khó khăn đối với đơn vị.