Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Quản lý Thuế có hiệu lực từ ngày 01/07/2014 quy định tất cả các loại hình hàng hóa nhập khẩu phải nộp thuế ngay trừ loại hình nhập nguyên liệu để sản xuất hàng xuất khẩu vẫn được ân hạn 275 ngày. Thời hạn
ân hạn thuế 275 ngày đối với nguyên liệu vật tư nhập khẩu để sản xuất hàng hóa xuất khẩu vẫn còn nhưng điều kiện hưởng chính sách này có thay đổi và trong số các điều kiện có yêu cầu phải thực hiện thanh toán qua ngân hàng. Doanh nghiệp bắt buộc phải nộp thuế hoặc được bảo lãnh bởi ngân hàng thì mới được thông quan hoặc giải phóng hàng hóa. Không như trước đây doanh nghiệp có thể thông quan hoặc giải phóng hàng hóa trước rồi mới nộp thuế sau.
Chính sách ân hạn thuế mới thật sự là vấn đề đối với doanh nghiệp trong việc chuẩn bị nguồn tài chính đóng thuế. Do đó, ngân hàng cần hỗ trợ tài chính cho doanh nghiệp, giúp doanh nghiệp tháo gỡ khó khăn này.
Hiện tại đối với các NHTM đã ký Thỏa thuận hợp tác tổ chức phối hợp thu NSNN, bảo lãnh thuế đối với hàng hóa XNK bằng phương thức điện tử với TCHQ, các NHTM này đều cung cấp 02 dịch vụ: thu NSNN và bảo lãnh thuế. Tuy nhiên hiện tại dịch vụ thu NSNN mới được phát triển mạnh, còn dịch vụ bảo lãnh thuế thì chưa được các NHTM và doanh nghiệp quan tâm chú ý. Nguyên nhân chính là thủ tục cấp bảo lãnh hiện nay còn khá phức tạp, mất thời gian ở khâu xét duyệt hồ sơ trong khi yêu cầu phải thông quan hàng hóa nhanh chóng dẫn đến việc doanh nghiệp không mặn mà với dịch vụ này. Mặt khác việc quy định điều kiện được bảo lãnh của cơ quan hải quan cũng khiến nhiều doanh nghiệp thực sự có nhu cầu sử dụng dịch vụ bảo lãnh cũng không thực hiện được do không đáp ứng quy định tại điểm a khoản 2 điều 21 Thông tư số 128/2013/TT-BTC. Ngoài ra phí bảo lãnh cũng là nguyên nhân khiến khách hàng ít quan tâm đến dịch vụ này.
Do đó để thúc đẩy nghiệp vụ bảo lãnh thuế hải quan phát triển, các NHTM cần nghiên cứu lại quy trình cấp bảo lãnh tín dụng theo hướng vừa giảm thiểu rủi ro vừa nhanh chóng. Đồng thời có ưu đãi về phí khi doanh nghiệp sử dụng dịch vụ bảo lãnh, có chính sách ưu đãi phí đối với doanh nghiệp mới tham gia dịch vụ hoặc doanh nghiệp thân thiết, sử dụng dịch vụ thường xuyên. Các NHTM cũng cần kiến nghị Bộ Tài chính, TCHQ sửa đổi quy định về người nộp thuế được áp dụng bảo lãnh theo hướng nếu doanh nghiệp có yêu cầu và NHTM chấp thuận bảo lãnh thì cơ quan Hải quan vẫn chấp thuận
bảo lãnh của ngân hàng. Trường hợp doanh nghiệp không nộp thuế sau thời gian bảo lãnh, NHTM sẽ thực hiện nộp thuế cho doanh nghiệp.