HAPHARCO là tên giao dịch và gọi tắt của Công ty cổ phần Dược phẩm Thiết bị y tế Hà Nội. Công ty được thành lập ngày 06/05/1955 trên cơ sở các cửa hàng thuốc tách khỏi Công ty Bách Hóa.
Năm 1958, mạng lưới Công ty mở rộng thêm 5 cửa hàng bán lẻ. Thực hiện 3 năm khôi phục kinh tế Công ty đã tiếp thu các nhà thuốc tây, các nhà thuốc đông y sau đó phát triển thành mạng lưới quốc doanh dược phẩm bao gồm: các hiệu thuốc tây, phòng pha chế 2 Hàng Bài, Cửa Nam, 21 Quán Thánh.
Năm 1983, Ủy ban nhân dân thành phố Hà Nội quyết định sáp nhập xí nghiệp Dược phẩm Hà Nội với quốc doanh dược phẩm thành xí nghiệp liên hợp dược Hà Nội.
Từ năm 1993 đến nay, do nhu cầu phát triển kinh tế, yêu cầu chuyên sâu trong hoạt động, vì vậy chủ trương của thành phố tách xí nghiệp liên hợp dược Hà Nội thành 3 doanh nghiệp nhà nước, khối kinh doanh của xí nghiệp sáp nhập với trang thiết bị y tế, các Công ty huyện thành Công ty Dược phẩm, thiết bị y tế Hà Nội.
Ngày 16/04/2003, theo quyết định số 2050/ QĐ- UB ngày 06/04/2003 của Uỷ ban nhân dân thành phố Hà Nội thực hiện chủ trương cổ phần hóa của Nhà nước, Công ty chuyển thành Công ty cổ phần Dược phẩm thiết bị y tế Hà Nội hoạt động theo giấy phép kinh doanh số 0103002235 cấp ngày 15/05/2003 của sở kế hoạchđầu tư thành phố Hà Nội với tên viết tắt là HAPHARCO.
Công ty hoạt động theo luật doanh nghiệp, vốn điều lệ 12,6 tỷ trong đó vốn sở hữu Nhà nước chiếm 51%, vốn cổ đông chiếm 49%.
Để ghi nhận những đóng góp của Công ty trong quá trình hoạt động phục vụ nhân dân, ngày 12 tháng 9 năm 2003 Công ty cổ phần dược phẩm thiết bị Y tế Hà Nội đã vinh dự đón nhận huân chương lao động hạng nhì và ra mắt Công ty.