... lượng thị ít, khơng đáp ứng cho nghiên cứu sâu rộng -Chỉ thịphântử :phân tích khác cá thể mức độ phântử (DNA, protein) SSCP, SSR, RAPD, AFLP… Các phươngpháp nghiên cứu tính đa dạng ditruyền ... với kích thước khác nhận biết điện di Một primer tạo nên đahình DNA cá thể đoạn đahình dùng marker để xác định đa dạng ditruyền RAPD xem phươngpháp tạo đahình DNA nhanh hữu hiệu Các kit primer ... phươngpháp RAPD-PCR để nghiên cứu đa dạng ditruyền Đánh giá đa dạng ditruyền xuất xứ lim xanh thị RAPD AND lục lạp (Nông nghiệp PTNT, 2005, 15, 80-8) Nguyễn Hoàng Nghĩa CS Sử dụng phương pháp...
... 37 Hình 3.6 Phân bố góc quay amino acid mơ hình cấu trúc 3D qua phântích Ramachandran Plot 38 Hình 3.7 Cấu trúc phântử amino acid đahình vị trí 53 253 39 Hình 3.8 Cấu trúc phântử ... chạy điện di sản phẩm cắt enzyme cắt giới hạn [72].Sự khác băng DNA sau chạy điện di cho biết đahình đoạn DNA phântíchHình 1.4.Phƣơng pháp RFLP-PCR sử dụng nghiên cứu ditruyềnphântử [79] ... Brachypodium distachyon XP_003560515.1 BdHKT4 Brachypodium distachyon XP_003581628.1 BdHKT6 Brachypodium distachyon XP_003570995.1 BdHKT8 Brachypodium distachyon XP_003564102.1 BdHKT9 Brachypodium distachyon...
... 37 Hình 3.6 Phân bố góc quay amino acid mơ hình cấu trúc 3D qua phântích Ramachandran Plot 38 Hình 3.7 Cấu trúc phântử amino acid đahình vị trí 53 253 39 Hình 3.8 Cấu trúc phântử ... cứu đahìnhditruyền Phƣơng pháp sử dụng phản ứng PCR nhằm khuếch đại có chọn lọc đoạn trình tự DNA, sau tiến hành phân cắt đoạn DNA enzyme cắt giới hạn Đahìnhditruyền mẫu DNA đƣợc phântích ... chạy điện di sản phẩm cắt enzyme cắt giới hạn [72].Sự khác băng DNA sau chạy điện di cho biết đahình đoạn DNA phântíchHình 1.4.Phƣơng pháp RFLP-PCR sử dụng nghiên cứu ditruyềnphântử [79]...
... 37 Hình 3.6 Phân bố góc quay amino acid mơ hình cấu trúc 3D qua phântích Ramachandran Plot 38 Hình 3.7 Cấu trúc phântử amino acid đahình vị trí 53 253 39 Hình 3.8 Cấu trúc phântử ... chạy điện di sản phẩm cắt enzyme cắt giới hạn [72].Sự khác băng DNA sau chạy điện di cho biết đahình đoạn DNA phântíchHình 1.4.Phƣơng pháp RFLP-PCR sử dụng nghiên cứu ditruyềnphântử [79] ... thấp (Hình 3.3.) Hình 3.3.Kết giải trình tự đƣợc phântíchphần mềm Bioedit QH.2014.T.CH - 60420121 32 Luận văn thạc sĩ khoa học Nguyễn Tiến Đạt 3.1.4 Phântíchđahình genOsHKT2;4 Đahình nucleotide...
... chọn tạo giống So với thịtruyền thống (chỉ thịhình thái, thị izozym), thị ADN có số ưu điểm bật sau: 1) Dễ thực điều kiện phòng thí nghiệm, đặc biệt thị RAPD-PCR phép phântích nhanh, đơn giản, ... thuật sinh học phântử hóa phântích giúp phát triển hệ thống kiểm định dược liệu cách toàn di n ứng dụng quy trình sản xuất công nghiệp 1.2.3 Chỉthị ADN nghiên cứu đa dạng ditruyền thuốc Có ... al, 2002) Kiểu hìnhthị ADN dùng để xác định mối quan hệ ditruyền kiểu hình hóa học khác lồi Acorus calamus phântích thành phần tinh dầu (Joshi, 2004) Chỉthị RAPD-PCR dùng để phân biệt dòng...
... ñiện di gel polyacrylamide có độ phân giải cao, đahình xác định có mặt hay vắng mặt phântử ñoạn DNA Kỹ thuật AFLP có ưu điểm phântíchđahìnhditruyền thời gian ngắn, lượng DNA dài đahình ... nhược ñiểm phươngpháp chọn giống truyền thống hiệu sàng lọc cao, nhanh tin cậy Trong số phươngpháp kể RAPD phươngpháp sử dụng rộng rãi ñây phươngpháp dễ thực chi phí thấp Chỉthịphântử hữu ... giống 2.2.2 Cơ sở khoa học việc ứng dụng thịphântử ñể ñánh giá ña dạng ditruyềnChỉthịphântử trình tự DNA đặc trưng cho cá thể Việc sử dụng thịphântử ñã cung cấp hội khơng việc nghiên cứu...
... di phát triển (Desmond Nicholl, 1994) 2.5.5.1 Tách phântử điện di gel Do phântử DNA tích điện âm nên đặt phântử DNA điện trường phântử DNA di chuyển phía điện cực dương Tốc độ di chuyển phân ... nhập thực khuẩn thể nhân tố lạ ditruyềnTừ kiểu hìnhphân lập đầu tiên, hệ thống R- M sẵn sàng cho phântíchditruyền có hiệu Hệ thống R-M vi khuẩn phá hủy phântử DNA lạ xâm nhập vào tế bào ... phântử DNA tùy thuộc vào hình dạng tỉ lệ điện tích/ khối lượng chúng Tuy nhiên, hầu hết phântử DNA có hình dạng giống tỉ lệ điện tích/ khối lượng gần nên tách phântử DNA kỹ thuật điện di chuẩn...
... này, sử dụng phươngpháp RFLP – PCR để phântích tính đa dạng ditruyền quần thể nấm C cassiicola Lai Khê, Bến Cát, tỉnh Bình Dương Nơi dung nghiên cứu: - Phân lập tách đơn bào tử dòng nấm Corynespora ... liệu phươngpháp 22 3.3.1 Phân lập, tách đơn bào tử thu sinh khối 22 3.3.1.1 Dụng cụ, hóa chất thí nghiệm 22 3.3.1.2 Phươngpháp lấy mẫu 23 3.3.1.3 Phươngphápphân ... 3.3.1.4 Phươngpháp tách đơn bào tử 23 3.3.1.5 Phươngpháp nhân sinh khối 24 3.3.2 Phươngpháp tách chiết DNA nấm 24 3.3.2.1 Hóa chất dụng cụ thí nghiệm 24 3.3.2.2 Phương pháp...
... này, sử dụng phươngpháp RFLP – PCR để phântích tính đa dạng ditruyền quần thể nấm C cassiicola Lai Khê, Bến Cát, tỉnh Bình Dương Nơi dung nghiên cứu: - Phân lập tách đơn bào tử dòng nấm Corynespora ... liệu phươngpháp 22 3.3.1 Phân lập, tách đơn bào tử thu sinh khối 22 3.3.1.1 Dụng cụ, hóa chất thí nghiệm 22 3.3.1.2 Phươngpháp lấy mẫu 23 3.3.1.3 Phươngphápphân ... 3.3.1.4 Phươngpháp tách đơn bào tử 23 3.3.1.5 Phươngpháp nhân sinh khối 24 3.3.2 Phươngpháp tách chiết DNA nấm 24 3.3.2.1 Hóa chất dụng cụ thí nghiệm 24 3.3.2.2 Phương pháp...
... 10 phút 4.4 Phântích RFLP vùng ITS dòng nấm Corynespora cassiicola Để phântích khác mặt ditruyền có nhiều phươngpháp RAPD, RFLP, AFLP… Trong đó, để nghiên cứu tính đa dạng ditruyền dòng ... dụng phươngpháp RFLP nguyên phải trải qua bước Southern blot tạp, để nghiên cứu tính đa dạng ditruyền thường sử dụng phươngpháp RFLP – PCR Về phươngpháp RFLP – PCR không khác nhiều so với phương ... thường sử dụng phươngpháp RFLP để phântích Đối với phươngpháp RFLP thơng thường phải trải qua bước quan trọng Southern blot, nguyên tắc phươngpháp sử dụng enzyme cắt giới hạn để phân cắt gene...
... nghiên cứu Phân lập tách đơn bào tử nấm Corynespora cassiicola Sử dụng PCR khuếch đại vùng ITS Phântíchđa dạng ditruyền nấm C cassiicola kỹ thuật RFLP – PCR 3.3 Vật liệu phƣơng pháp 3.3.1 Phân lập, ... cách điện di gel agarose 1% - 1,5%, phântíchđa dạng ditruyền dòng nấm PHẦN KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 4.1 Phân lập tách đơn bào tử nấm Corynespora cassiicola số dòng vơ tính cao su 4.1.1 Di n biến ... thuật RAPD phântích RFLP vùng ITS 32 dòng nấm Ơng khơng tìm thấy đahình nghiên cứu kỹ thuật RFLP –PCR, với kỹ thuật RAPD phân 32 dòng nấm thành nhóm ditruyền PHẦN VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP 3.1...
... sau: Tris HCl 50mM, EDTA 50mM, SDS 3%, - mercaptoethanol 1% - Cho vào becher thể tích nước siêu gần với thể tích dung dich buffer mong muốn - Lần lượt cho thành phần khác: Tris HCl, EDTA SDS vào ... leaf fall disease of Hevea brassiliensis, Medan, Indonesia 16 – 17, Dec, 1996 18 Jayashinge, C.K and W.P.K, Silva and Wettasinghe D S., 2000 Corynespora cassiicola: a fungal pathogen with diverse ... workshop on Corynespora leaf fall disease of Hevea brassiliensis, Kuala Lumpur, Malaysia and Medan, Indonesia, – 15, June, 2000 21 Jayasinghe, C.K., 1997 Leaf fall disease: a threat to world NR industry...
... blot Do vậy, phântíchđa dạng ditruyền lồi nấm, đặc biệt phântíchđa dạng ditruyền loài, phươngpháp RFLP – PCR ứng dụng phổ biến Kỹ thuật có nghĩa sử dụng RE để phân cắt sản phẩm PCR đoạn gen ... chọn tương lai 4.4 Phântíchđa dạng vùng ITS nấm C cassiicola RFLP kỹ thuật ứng dụng rộng rãi phântíchđa dạng ditruyền Trong kỹ thuật chủ yếu ứng dụng enzyme cắt giới hạn nhằm phân cắt đoạn DNA ... mặt ditruyềnphân cắt RE tạo thành đoạn DNA có kích thước giống nhau, số đoạn DNA tạo thành giống Phươngpháp RFLP 43 nguyên đòi hỏi phải trải qua giai đoạn Southern blot Do vậy, phântích đa...
... cắt giới hạn (RE) Sản phẩm PCR thu phântích enzyme cắt giới hạn để xem xét có khác biệt ditruyền mẫu phântích hay khơng 3.2.3.1 Hóa chất dụng cụ dùng phântích RFLP sản phẩm PCR - Các enzyme ... hành máy điện di hiệu điện 50V Sau hồn tất q trình điện di, gel lấy khỏi bồn điện di nhuộm dung dịch ethidium bromide khoảng 15 – 20 phút chụp ảnh gel máy chụp gel (Biorad) 3.2.3 Phântích sản phẩm ... Colletotrichum gloeosporioidies, phân biệt dễ dàng bào tử (hình 4.4) Qua tiến trình phân lập chúng tơi thu nhận mẫu nấm C cassiicola từ dòng vơ tính cao su khác nhau, đại di n cho biểu triệu chứng...
... Nghiên cứu biến dịditruyền 42 isolates nấm C cassiicola ký chủ khác phươngpháp RAPD – PCR Silva cộng (1995) cho thấy, có nhóm ditruyền xác định, điều có nghĩa có khác biệt ditruyền đáng kể isolates ... cộng sự, 2003) Những khác biệt ditruyền nấm bệnh C cassiicola ký chủ khác nghiên cứu phântíchđahình RFLP vùng ITS (internal transcribed spacer) ribosome DNA đahình đoạn DNA khuếch đại từ DNA ... đặc biệt tia tử ngoại ánh sáng mặt trời Sử dụng phươngphápphân lập thu nhận nguồn nấm C cassiicola đơn bào tử Tuy nhiên, cần lưu ý phươngpháp thực nấm C cassiicola kích thước bào tử nấm C cassiicola...
... di phát triển (Desmond Nicholl, 1994) 2.5.5.1 Tách phântử điện di gel Do phântử DNA tích điện âm nên đặt phântử DNA điện trường phântử DNA di chuyển phía điện cực dương Tốc độ di chuyển phân ... nhập thực khuẩn thể nhân tố lạ ditruyềnTừ kiểu hìnhphân lập đầu tiên, hệ thống R- M sẵn sàng cho phântíchditruyền có hiệu Hệ thống R-M vi khuẩn phá hủy phântử DNA lạ xâm nhập vào tế bào ... phântử DNA tùy thuộc vào hình dạng tỉ lệ điện tích/ khối lượng chúng Tuy nhiên, hầu hết phântử DNA có hình dạng giống tỉ lệ điện tích/ khối lượng gần nên tách phântử DNA kỹ thuật điện di chuẩn...
... C cassiicola cao su có phân hóa ditruyền (CFC/INRO Project Proposal, 1999; Safia Noor Hisham, 2003) Do vậy, việc xác định đa dạng sinh học, đặc biệt đa dạng mức độ phântử C cassiicola việc cần ... từ vấn đề trên, thực đề tài Phântíchđa dạng ditruyền số mẫu nấm Corynespora cassiicola (Berk & Curt.) Wei gây bệnh cao su (Hevea brasliensis Muell Arg) phƣơng pháp RFLP – PCR” 1.2.Mục đích ... tử dạng đơn hay kết thành chuỗi, biến thiên kích thước hình dạng Nấm dễ dàng phát triển môi trường nhân tạo khó hình thành bào tử Sử dụng mơi trường PDA cải thiện đáng kể khả hình thành bào tử...