... 2004 Giới thiệu kỹthuậtgiảitrìnhtựgen và Real - Time PCR Lê Văn Phủng* Trờng Đại học Y Hà Nội 1. Kỹthuậtgiảitrìnhtựgen Giải trìnhtựgen là tìm ra trìnhtự sắp xếp của các ... việc giảitrìnhtự gen ngày một cao; ngời ta có thể giải một trình tự dài hàng nghìn cặp base chỉ trong vòng vài tiếng đồng hồ, điều mà trớc đây phải làm hàng tuần. Có nhiều kỹthuậtgiảitrình ... nghiên cứu khoa học). Kỹ thuậtgiảitrìnhtựgen đợc công bố năm 1975 bởi Sanger (nguyên lý enzym) và Maxam - Gilbert năm 1977 (nguyên lý phân giải hoá học). Hiện nay, các kỹthuật này đà đợc cải...
... kỹthuậtgiảitrìnhtự chuỗi để xác định kiểu gen virus viêm gan B Những tiến bộ của kỹthuật sinh học phân tử vào những năm cuối thế kỹ 20 đã giúp khám phá ra sự đa dạng trong trìnhtự ... xác định được thứ tự các Nu gắn kết với nhau dọc theo chiều dài của bộ gen (DNA) gọi là việc giảitrìnhtự chuỗi (Sequencing), và trìnhtự gắn kết nhau của các Nu gọi là trìnhtự chuỗi (Sequence). ... phương pháp giải trìnhtự chuỗi có thể xem như có nhiều ưu điểm nổi bật vì bên cạnh việc xác định được trìnhtự chuỗi các Nucleotids trong bộ gen của HBV để từ đó so sánh với thư viện gen và xác...
... gan. Với việc thực hiện kỹthuậtgiảitrìnhtự chuỗi trên hệ thống Trugene, sau khi có trình tự chuỗi thì máy sẽ tự động so sánh trìnhtự chuỗi của mẫu với thư viện gen có sẵn trong máy, từ ... ưu. CẤU TẠO GEN P VÀ VÙNG RT 3, QUI TRÌNH THỰC HIỆN GIẢITRÌNHTỰ CHUỖI TRÊN HỆ THỐNG SEQUENCING TRUGENE Để thực hiện được kỹthuậtgiảitrìnhtự chuỗi, chúng ta phải thực hiện 3 bước ... DNA này đủ để ta làm phản ứng cắt cho giảitrìnhtự chuỗi. XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VI RÚT VIÊM GAN B VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC BẰNG KỸ THUẬTGIẢITRÌNHTỰ CHUỖI I, NHỮNG TIẾN BỘ CỦA XÉT NGHIỆM...
... two genotypes of HBV: genotype B and genotype C, in which 76 cases are genotypes B (62.3%) and 46 cases are genotype C (37.7%). ỨNG DỤNG KỸTHUẬTGIẢITRÌNHTỰ CHUỖI ĐỂ XÁC ĐỊNH KIỂU GEN ... bộ gen của HBV và phân HBV thành 8 loại đặt tên từ A đến H dựa vào sự khác nhau trên 8% của toàn bộ bộ gen của HBV. Có nhiều kỹthuật dùng để xác định kiểu gen HBV như kỹthuậtgiảitrìnhtự ... gắn men (Enzyme-linked immunoassay) Kỹthuật chúng tôi dùng để xác định kiểu gen của HBV là kỹthuậtgiảitrìnhtự chuỗi vì bên cạnh việc xác định được kiểu gen của HBV chúng tôi còn tìm được...
... ngắn. Kỹthuật PCR còn được dùng để nhân ADN từ khuôn RNA sau khi đã được chuyển thành cDNA sau phản ứng phiên mã ngược (RT). Phương pháp này nhanh Nhân gene và kỹthuậtgiảitrìnhtự ADN Kỹ ... đủ ADN cho các kỹthuật lai hay định typ. Khó khăn này được khắc phục bằng cách làm tăng nguồn ADN đích một cách nhanh chóng bằng kỹthuật nhân gene PCR. a. Kỹthuật nhân gene PCR (Polymerase ... trong hệ gene người có kích thước gấp 100 000 lần. Mặt khác khi dùng kỹthuật miễn dịch với kháng thể thì phải cần tới 8 ngày mới có đáp ứng miễn dịch trong máu, trong khi đó với kỹthuật PCR...
... mà chúng tôi dự đoán, là từ 190bp đến < 200bp. BÀN LUẬN Định genotype HCV bằng kỹthuậtgiảitrìnhtự của Trugene hay kỹthuật InoLIPA lai trên vạch của Bayer đều dựa trên một đoạn nucleotide ... quả định genotype bằng kỹthuậtgiảitrìnhtự của Trugene vì đoạn trìnhtự đích của phương pháp của chúng tôi và đoạn trìnhtự đích của phương pháp Trugen gần như phù hợp nhau hoàn toàn. Sở ... pháp lai trên vạch dò đặc hiệu genotype C (HCV-InoLIPA)(Error! Reference source not found.) và phương pháp giảitrìnhtự với hệ thống giảitrìnhtự kín của Trugene(Error! Reference source...
... tính HiDi Giải trình ọc trìnhtự genegenPhân tích trìnhtự genegen - CS ứng dụng cho xác định kiểu gen của HBV trên 52 mẫu lâm sàng phát hiện được 11 mẫu là kiểu B và 41 mẫu là kiểu gen C. ... thích hợp cchoủa kỹthuật PCR - RFLP xác định kiểu gen HBV.2. Đánh giá độ đặc hiệu và sự phù hợp của kỹthuật PCR - RFLP xác định kiểu gen HBV so với kỹ thuật đọc trìnhtự gen. CHƯƠNG 1TỔNG ... có 3 mẫu là kiểu gen A, 11 mẫu kiểu gen B và 37 mẫu kiểu gen C. Kết quả đọc trìnhtự và phân tích loài cho thấy chỉ có 1 mẫu là kiểu gen A, 14 mẫu kiểu gen B và 37 mẫu kiểu gen C. Như vậy độ...
... cho kỹthuậtgiảitrìnhtự ADN – Phương pháp 1 Phương pháp 1: Tinh sạch Plasmid cho giảitrìnhtự ADN. Hiện nay có nhiều kỹthuật tinh sạch plasmid khác nhau, phương pháp được trình ... phải giảitrìnhtự một cách thủ công và các cán bộ nghiên cứu đã tìm ra nhiều phương pháp tinh sạch khác nhau để thu nhận ADN đạt độ sạch cần thiết, thậm chí có thể dùng cho giảitrìnhtự ADN tự ... là phương pháp thu được plasmid có độ tinh sạch cao, có thể dùng cho cả giảitrìnhtự ADN thủ công và tự động hóa. Quá trình này là cải tiến phương pháp sử dụng dịch kiềm làm tan tế bào, sau...
... được giảitrìnhtự trực tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử. Kết quả được trình bầy ở hình 2 A và B. Gen HP1125 của Việt Nam đã được đệ trình vào quĩ gen và có số mã là AY513613. GIẢITRÌNH ... Trình tự của toàn bộ gen HP1125 vừa được giải mã được so sánh với gen tương ứng của các chủng nước ngoài bằng chương trình Blast. Nhìn chung, gen của Việt nam có sự tương đồng khá cao với gen ... ng/àl được sử dụng để giảitrìnhtự tại ADN Core, trường đại học tổng hợp Michigan (Mỹ) theo phương pháp giảitrình của Hultman (6a) Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trên trang...
... trên một số trìnhtự của gen HP1125 đã được Kết quả giảitrìnhtự Sản phẩm PCR, sau khi làm sạch được giảitrìnhtự trực tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử. Kết quả được trình bầy ... Trình tự của toàn bộ gen HP1125 vừa được giải mã được so sánh với gen tương ứng của các chủng nước ngoài bằng chương trình Blast. Nhìn chung, gen của Việt nam có sự tương đồng khá cao với gen ... Hai trong những giải pháp tốt nhất để chống vi khuẩn dạ Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trên trang Web được sử dụng để phân tích trìnhtự cũng như protein cuar gen. KẾT QUẢ...
... Reaction MixSANGER DIDEOXY SEQUENCINGPhóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng hợp trong mỗi ống phản ứng.Đoạn ADN cần giảitrình tự Đoạn ADN cần giảitrình tự 3 CCTATGGAATGC-3 CCTATGGAATGC-55..********************ống ... SangerFred Sanger Các phơng pháp giảitrìnhtự gen Có 2 phơng pháp chính:Phơng pháp hoá học Maxam Gilbert: đây là phơng pháp đợc sử dụng đầu tiên để xác định trình tựgen nhng hiện nay không còn ... định trìnhtự các nucleotide. Ưu điểm của phơng pháp cải tiếnTạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá.Giảm giá thành phản ứngTăng tốc độ phản ứng=> Nhiều trung tâm giảitrìnhtự gen...