Đánh giá đa dạng di truyền liên quan đến tính kháng đạo ôn, bạc lá của một số nguồn gen lúa địa phưong miền bắc việt nam

BỘ GIÁO DỤC VÀ ðÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT VIỆN KHOA HỌC NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM -*** - NGUYỄN KIẾN QUỐC ðÁNH GIÁ ðA DẠNG DI TRUYỀN LIÊN QUAN ðẾN TÍNH KHÁNG ðẠO ÔN, BẠC LÁ CỦA MỘT SỐ NGUỒN GEN LÚA ðỊA PHƯƠNG MIỀN BẮC VIỆT NAM Chuyên ngành : Di truyền Chọn giống trồng Mã số : 60 62 01 11 LUẬN VĂN THẠC SĨ NÔNG NGHIỆP Người hướng dẫn khoa học: TS Lã Tuấn Nghĩa HÀ NỘI, 2012 Lời cảm ơn Trước hết, xin gửi lời cảm ơn chân thành sâu sắc tới TS Lã Tuấn Nghĩa, người ñã tận tình hướng dẫn, giúp ñỡ hỗ trợ suốt trình công tác thời gian học tập, nghiên cứu hoàn thành luận văn này; Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn tới quí thầy cô cán công tác Ban ñào tạo Sau ñại học-Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam ñã dạy dỗ tạo ñiều kiện thuận lợi cho suốt trình học tập; Tôi xin chân thành cảm ơn cán anh, chị em Bộ môn ða dạng sinh học Nông nghiệp-Trung tâm Tài nguyên thực vật ñã giúp ñỡ ñộng viên trình công tác nghiên cứu khoa học vừa qua; Cuối xin chân thành cảm ơn gia ñình bạn bè ñã nhiệt tình ñộng viên, giúp ñỡ trình học tập, nghiên cứu khoa học sống Xin chân thành cảm ơn! Hà Nội, ngày 16 tháng 12 năm 2012 Học viên Nguyễn Kiến Quốc Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… i Lời cam ñoan Tôi xin cam ñoan ñã trực tiếp thực nghiên cứu luận văn Kết nghiên cứu ñạt ñược ñều xuất phát từ việc thực nội dung ñề tài luận văn, mang tính khách quan trung thực Tôi xin hoàn toàn chịu trách nhiệm với lời cam ñoan trên! Hà Nội, ngày 16 tháng 12 năm 2012 Học viên Nguyễn Kiến Quốc Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… ii DANH MỤC KÝ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮT ABC ATP-Binding Cassette AFLP Amplification Fragment Length Polymorphism APS Amonium Persulfate CAPs Cleaved Amplification Polymorphism Sequence cs Cộng CTAB Cetyl Trimethyl Amonium Bromide DNA Deoxyribonucleotide Acid dNTPs Deoxy Nucleotide triphosphates EDTA Ethylenediaminetraacetic acid EST Expressed sequence tag I-SSR Inter-Simple Sequence Repeat MAS Marker Assissted Selection MGR Major Gene Resistance PCR Polymerase Chain Reaction PIC Polymorphism Information Content RAPD Random Aplification Polymorphism DNA RGA Resistance Gene Analog RFLP Restriction Fragment Length Polymorphism SNP Single Nucleotide Polymorphism SSR Simple Sequence Repeat STS Sequence-Acetic acid-EDTA Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… iii DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 1.1 Một số giống gen kháng ñạo ôn (Kinoshita cs., 1994; 1995) 14 Bảng 1.2 Một số giống gen kháng bạc (NIAS, 2010) 17 Bảng 2.1 Danh sách mẫu nguồn gen lúa nghiên cứu 43 Bảng 2.2 Danh sách cặp mồi SSR sử dụng 45 Bảng 2.3 Thành phần phản ứng SSR-PCR (thể tích 10µl/tube) 50 Bảng 2.4 Thành phần gel polyacrylamide 6% 50 Bảng 3.1 Kết ñánh giá tính kháng/nhiễm ñạo ôn mẫu 56 nguồn gen lúa Bảng 3.2 Kết ñánh giá tính kháng/nhiễm bạc mẫu 64 nguồn gen lúa Bảng 3.3 Số băng ADN, số loại alen hệ số PIC 30 cặp mồi SSR 73 liên kết với khả kháng ñạo ôn Bảng 3.4 Số băng ADN, số loại alen hệ số PIC 32 cặp mồi SSR 76 liên kết với khả kháng bạc Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… iv DANH MỤC HÌNH VẼ, ðỒ THỊ Trang Hình 1.1 Lịch sử tiến hóa loài lúa trồng (Chang Smorith, 1979) Hình 1.2 Nguyên lý phản ứng PCR 22 Hình 1.3 Nguyên lý kỹ thuật AFLP 28 Hình 3.1 Các nguồn gen lúa trước lây nhiễm 52 Hình 3.2 Kết lây nhiễm nòi H12 & H14 lên mẫu nguồn gen lúa 53 Hình 3.3 Mức ñộ kháng/nhiễm mẫu nguồn gen lúa nghiên cứu với 02 nòi nấm bệnh H12 & H14 Trong ñó R: kháng; MR: kháng trung bình; MS: nhiễm nhẹ; S: nhiễm 54 Hình 3.4 Kết lây nhiễm chủng Is.5 & Is.6 lên mẫu nguồn gen lúa Trong ñó: A: Chiêm nhỡ BN2; B: Lúa cứng Nghệ An; C IRBB5; D: IR24 60 Hình 3.5 Mức ñộ kháng/nhiễm mẫu nguồn gen lúa nghiên cứu với 02 chủng vi khuẩn Is.5 & Is.6 Trong ñó R: kháng; MR: kháng trung bình; MS: nhiễm nhẹ; S: nhiễm 61 Hình 3.6 Hình ảnh nhận dạng ADN tổng số mẫu nguồn gen lúa Trong ñó: Lamda 50ng/µl; 1-58 mẫu giống lúa nghiên cứu (bảng 2.1) 66 Hình 3.7 Kết nhận dạng di truyền mẫu nguồn gen lúa thị SSR RM6612 RM7012 Trong ñó: M DNA 100 ladder; 1-60: thứ tự giống lúa nghiên cứu (bảng 2.1) 67 Hình 3.8 Kết phản ứng PCR mẫu nguồn gen lúa với 30 cặp mồi SSR liên kết với tính kháng ñạo ôn (ô ñen-có alen ghi nhận, ô trắng-không có alen ghi nhận) 68 Hình 3.9 Kết nhận dạng kiểu gen mẫu nguồn gen lúa thị SSR (RM240; RM453; RM2887) liên kết với khả kháng ñạo ôn Trong ñó: M là: DNA 100 ladder; 1-23 thứ tự mẫu giống lúa nghiên cứu (bảng 2.1) 74 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… v Trang Hình 3.10 Kết nhận dạng kiểu gen mẫu nguồn gen lúa thị SSR-RM208 liên kết với khả kháng bạc Trong ñó: M là: Ladder 100; 1-46 thứ tự mẫu giống lúa nghiên cứu (bảng 2.1) 75 Hình 3.11 Kết nhận dạng kiểu gen mẫu nguồn gen lúa thị SSR-RM138 liên kết với khả kháng bạc Trong ñó: M là: Ladder 100; 1-46 thứ tự mẫu giống lúa nghiên cứu (bảng 2.1) (tiếp) 77 Hình 3.12 Cây phân nhóm Euclidean-UPGMA dựa ñặc ñiểm hình thái kháng ñạo ôn mẫu nguồn gen lúa 78 Hình 3.13 Cây phân nhóm SM-UPGMA dựa kiểu gen SSR liên kết với khả kháng ñạo ôn mẫu nguồn gen lúa 80 Hình 3.14 Sơ ñồ phân nhóm Eucledean-UPGMA dựa kiểu hình kháng bạc mẫu nguồn gen lúa 82 Hình 3.15 Sơ ñồ phân nhóm SM-UPGMA dựa kiểu gen kháng bạc mẫu nguồn gen gen lúa 84 Hình 3.16 Mối liên kết biểu kiểu hình kiểu gen kháng ñạo ôn 85 Hình 3.17 Mối liên kết biểu kiểu hình kiểu gen kháng bạc 82 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… vi MỤC LỤC Trang Lời cảm ơn i Lời cam ñoan ii Mục lục vii Danh mục ký hiệu, chữ viết tắt iii Danh mục bảng iv Danh mục hình vẽ, ñồ thị v MỞ ðẦU 1 Tính cấp thiết ñề tài Mục ñích yêu cầu ñề tài 2.1 Mục ñích 2.2 Yêu cầu ñề tài 3 Ý nghĩa khoa học thực tiễn ñề tài 3.1 Ý nghĩa khoa học 3.2 Ý nghĩa thực tiễn 4 ðối tượng phạm vi nghiên cứu ñề tài 4.1 ðối tượng nghiên cứu 4.2 Phạm vi nghiên cứu CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 CÂY LÚA VIỆT NAM 1.1.1 Nguồn gốc, phân loại Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… vii Trang 1.1.2 Tài nguyên di truyền lúa Việt Nam 1.1.2.1 Tài nguyên lúa hoang dại 1.1.2.2 Tài nguyên lúa trồng 1.2 BỆNH HẠI CHÍNH TRÊN LÚA 11 1.2.1 Bệnh ñạo ôn hại lúa 11 1.2.2 Bệnh bạc hại lúa 12 1.3 GEN KHÁNG ðẠO ÔN, BẠC LÁ 13 1.3.1 Gen kháng ñạo ôn 13 1.3.2 Gen kháng bạc 15 1.4 CHỈ THỊ TRONG ðÁNH GIÁ ðA DẠNG DI TRUYỀN LÚA 18 1.4.1 Chỉ thị hình thái 19 1.4.2 Chỉ thị sinh hóa 20 1.4.3 Chỉ thị ADN 21 1.4.3.1 Chỉ thị phân tử dựa sở lai ADN 24 1.4.3.2 Chỉ thị phân tử dựa sở PCR 26 1.4.3.2.1 Chỉ thị RAPD 27 1.4.3.2.2 Chỉ thị AFLP 27 1.4.3.2.3 Chỉ thị STS 29 1.4.3.2.4 Chỉ thị RGA 30 1.4.3.2.5 Chỉ thị phân tử SSR 30 1.4.3.2.6 Chỉ thị phân tử I-SSR 31 1.4.3.2.7 Chỉ thị ADN dựa trình tự lặp 32 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… viii Trang 1.5 THÀNH TỰU TRONG NGHIÊN CỨU ðA DẠNG DI TRUYỀN NGUỒN GEN LÚA 33 1.5.1 Nghiên cứu ña dạng nguồn gen lúa thị hình thái 33 1.5.2 Nghiên cứu ña dạng di truyền thị ADN 34 1.5.3 Nghiên cứu ña dạng di truyền liên quan ñến tính kháng bệnh ñạo ôn, bạc 39 1.5.3.1 ða dạng di truyền liên quan ñến tính kháng ñạo ôn 39 1.5.3.2 ða dạng di truyền liên quan ñến tính kháng bạc 40 CHƯƠNG 2: VẬT LIỆU, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 42 2.2 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 42 2.1 NỘI DUNG NGHIÊN CỨU 44 2.1.1 ðánh giá tính kháng ñạo ôn, bạc 44 2.1.2 ðánh giá ña dạng di truyền nguồn gen lúa 44 2.1.3 Xác ñịnh mối liên kết kiểu hình kiểu gen kháng 45 2.1.4 Xác ñịnh alen kháng 45 2.3 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.3.1 ðánh giá tính kháng ñạo ôn 45 45 2.3.1.1 Phương pháp xác ñịnh nòi có ñộc tính cao 45 2.3.1.2 Phương pháp lây nhiễm bệnh 45 2.3.1.3 ðánh giá phản ứng bệnh 46 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… ix DungheuHoaBinh ChienchauSonTay LuacungNgheAn NepvoiHoaBinh HiendoHaiPhong DauHaiDuong HomgiayND GienuocmuonPT GietronHaiDuong GieThanhHoa GiedaVinhPhuc GiedoVinhPhuc GiebacPhuTho GielunHaDong Tetep BalaNgheAn BalaKienAn Bau Bau1 Bau8 BauHaDong BaudauPhuTho BauThanhHoa Bauquai ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi ChiemNganSon ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn 1,000 0,645 0,702 0,669 0,589 0,669 0,750 0,702 0,782 0,621 0,589 0,823 0,605 0,629 0,742 0,661 0,629 0,790 0,774 0,694 0,871 0,742 0,645 0,806 0,589 0,863 0,710 0,661 0,605 0,637 0,565 0,653 0,710 0,806 0,613 0,718 0,702 0,653 0,734 0,637 0,645 0,629 0,798 0,790 0,839 1,000 0,782 0,653 0,734 0,621 0,653 0,621 0,573 0,702 0,718 0,645 0,766 0,806 0,726 0,774 0,726 0,597 0,726 0,790 0,629 0,661 0,710 0,677 0,702 0,589 0,661 0,694 0,702 0,718 0,774 0,750 0,742 0,629 0,734 0,669 0,798 0,685 0,734 0,685 0,710 0,726 0,815 0,629 0,661 1,000 0,645 0,839 0,645 0,694 0,661 0,597 0,774 0,806 0,685 0,742 0,734 0,831 0,782 0,637 0,573 0,879 0,669 0,702 0,637 0,669 0,669 0,774 0,661 0,718 0,637 0,823 0,742 0,734 0,677 0,766 0,782 0,823 0,597 0,774 0,742 0,710 0,629 0,621 0,798 0,710 0,718 0,734 1,000 0,710 0,903 0,597 0,935 0,677 0,661 0,726 0,621 0,694 0,685 0,702 0,669 0,621 0,573 0,621 0,653 0,685 0,605 0,589 0,734 0,774 0,726 0,637 0,589 0,726 0,790 0,685 0,645 0,718 0,669 0,694 0,613 0,645 0,742 0,661 0,629 0,605 0,669 0,661 0,782 0,653 1,000 0,742 0,581 0,758 0,677 0,726 0,855 0,540 0,774 0,734 0,702 0,766 0,605 0,524 0,750 0,621 0,573 0,573 0,589 0,621 0,887 0,565 0,605 0,589 0,855 0,823 0,734 0,645 0,702 0,653 0,935 0,548 0,710 0,806 0,613 0,581 0,589 0,734 0,677 0,605 0,605 1,000 0,565 0,935 0,710 0,645 0,710 0,589 0,694 0,621 0,669 0,589 0,589 0,556 0,589 0,605 0,637 0,605 0,573 0,734 0,790 0,694 0,621 0,573 0,710 0,806 0,621 0,629 0,702 0,621 0,710 0,565 0,581 0,790 0,629 0,597 0,589 0,669 0,629 0,782 0,637 1,000 0,613 0,710 0,613 0,597 0,831 0,629 0,653 0,766 0,621 0,669 0,685 0,766 0,685 0,718 0,831 0,669 0,702 0,548 0,694 0,831 0,653 0,597 0,597 0,653 0,677 0,702 0,718 0,621 0,726 0,629 0,597 0,758 0,758 0,685 0,621 0,645 0,702 0,782 1,000 0,742 0,661 0,710 0,605 0,710 0,685 0,685 0,637 0,621 0,605 0,621 0,621 0,669 0,621 0,605 0,734 0,806 0,726 0,653 0,605 0,726 0,806 0,653 0,645 0,718 0,669 0,726 0,613 0,613 0,790 0,645 0,613 0,605 0,685 0,661 0,798 0,653 1,000 0,548 0,645 0,750 0,661 0,653 0,621 0,621 0,605 0,798 0,637 0,637 0,734 0,798 0,573 0,766 0,677 0,694 0,734 0,637 0,661 0,726 0,621 0,629 0,718 0,669 0,669 0,742 0,645 0,742 0,645 0,661 0,621 0,573 0,742 0,653 0,798 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,758 0,605 0,629 0,621 0,815 0,766 0,669 0,637 0,766 0,653 0,621 0,605 0,685 0,589 0,742 0,565 0,605 0,685 0,774 0,758 0,621 0,694 0,766 0,702 0,758 0,581 0,694 0,742 0,597 0,694 0,750 0,944 0,645 0,669 0,605 1,000 0,589 0,839 0,734 0,734 0,798 0,637 0,540 0,782 0,653 0,621 0,589 0,621 0,653 0,823 0,581 0,637 0,621 0,968 0,855 0,750 0,677 0,750 0,685 0,839 0,565 0,726 0,823 0,645 0,629 0,621 0,766 0,645 0,637 0,621 GiedoVinhPhuc GiedaVinhPhuc GieThanhHoa GietronHaiDuong GienuocmuonPT HomgiayND DauHaiDuong HiendoHaiPhong NepvoiHoaBinh LuacungNgheAn ChienchauSonTay DungheuHoaBinh Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,605 0,597 0,742 0,645 0,645 0,758 0,758 0,694 0,806 0,855 0,645 0,694 0,556 0,734 0,823 0,677 0,589 0,621 0,548 0,669 0,710 0,790 0,581 0,831 0,718 0,637 0,798 0,766 0,661 0,629 0,702 0,726 0,855 90 1,000 0,742 0,677 0,629 0,871 0,694 0,742 0,677 0,677 0,645 0,766 0,702 0,726 0,645 0,766 0,798 0,661 0,702 0,823 0,790 0,742 0,621 0,685 1,000 0,661 0,597 0,823 0,774 0,661 0,661 0,629 0,645 0,702 0,621 0,645 0,661 0,798 0,734 0,758 0,685 0,742 0,742 0,774 0,734 0,798 1,000 0,726 0,645 0,823 0,629 0,694 0,887 0,645 0,605 0,589 0,758 0,887 0,637 0,653 0,677 0,944 0,661 0,645 0,637 0,685 0,605 1,000 0,645 0,661 0,758 0,774 0,726 0,726 0,524 0,685 0,694 0,758 0,556 0,573 0,516 0,702 0,661 0,677 0,565 0,734 0,637 1,000 0,710 0,758 0,694 0,694 0,694 0,685 0,702 0,710 0,677 0,782 0,702 0,661 0,685 0,790 0,839 0,774 0,637 0,766 1,000 0,661 0,710 0,806 0,661 0,605 0,637 0,758 0,790 0,653 0,637 0,774 0,863 0,661 0,677 0,645 0,831 0,702 1,000 0,726 0,629 0,806 0,589 0,863 0,694 0,661 0,621 0,637 0,581 0,653 0,710 0,903 0,613 0,669 0,702 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,645 0,774 0,573 0,653 0,855 0,710 0,605 0,621 0,645 0,702 0,774 0,726 0,597 0,831 0,685 0,621 0,911 0,935 0,589 0,573 0,718 0,685 0,653 0,726 0,685 0,637 0,774 0,685 0,597 0,831 1,000 0,613 0,573 0,589 0,742 0,935 0,621 0,589 0,677 0,927 0,613 0,645 0,621 0,653 0,589 GiedoVinhPhuc 0,774 0,581 0,605 0,758 0,726 0,645 0,613 0,758 0,718 0,806 0,645 0,653 0,677 0,815 0,613 Bauquai GiedaVinhPhuc GieThanhHoa 0,685 0,750 0,758 0,589 0,637 0,911 0,798 0,702 0,597 0,685 0,637 0,887 0,524 0,613 0,750 BauThanhHoa 0,653 0,718 0,694 0,734 0,782 0,605 0,573 0,653 0,790 0,750 0,669 0,597 0,734 0,742 0,718 BaudauPhuTho GietronHaiDuong GienuocmuonPT 0,589 0,750 0,758 0,637 0,589 0,685 0,637 0,750 0,742 0,637 0,637 0,613 0,702 0,661 0,831 BauHaDong 0,815 0,621 0,613 0,782 0,702 0,669 0,685 0,734 0,694 0,669 0,653 0,661 0,653 0,742 0,621 Bau8 HomgiayND DauHaiDuong 0,556 0,734 0,726 0,589 0,540 0,669 0,605 0,718 0,726 0,605 0,589 0,597 0,702 0,629 0,815 Bau1 0,589 0,895 0,887 0,573 0,556 0,685 0,702 0,621 0,710 0,637 0,637 0,742 0,669 0,565 0,879 Bau HiendoHaiPhong NepvoiHoaBinh LuacungNgheAn ChienchauSonTay 1,000 0,645 0,774 0,677 0,565 0,661 0,790 0,597 0,629 0,661 0,629 0,734 0,605 0,677 0,661 0,734 0,718 0,903 0,702 0,661 0,613 0,710 0,702 0,734 0,589 0,702 0,742 0,637 0,573 0,685 0,637 0,734 0,694 0,685 0,621 0,597 0,653 0,645 0,782 BalaKienAn 1,000 0,863 0,669 0,685 0,685 0,573 0,685 0,718 0,621 0,621 0,685 0,653 0,790 0,613 0,669 0,685 0,839 0,758 0,847 0,726 0,669 0,621 0,766 0,613 0,710 0,669 0,815 0,806 0,669 0,573 0,734 0,734 0,750 0,645 0,685 0,621 0,790 0,589 0,710 0,766 BalaNgheAn GiebacPhuTho GielunHaDong Tetep BalaNgheAn BalaKienAn Bau Bau1 Bau8 BauHaDong BaudauPhuTho BauThanhHoa Bauquai ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi ChiemNganSon ChiemNgheAn 0,694 0,710 0,734 0,613 0,613 0,726 0,806 0,645 0,605 0,694 0,694 0,718 0,629 0,653 0,710 Tetep 0,661 0,613 0,605 0,839 0,742 0,677 0,629 0,790 0,637 0,726 0,645 0,653 0,645 0,895 0,629 GiebacPhuTho Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 Co39 C101LAC GielunHaDong DungheuHoaBinh Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,589 0,766 0,677 0,661 0,637 0,653 0,677 0,669 0,806 0,726 0,605 0,653 0,685 91 1,000 0,726 0,653 0,653 0,645 0,766 0,694 0,694 0,629 0,798 0,653 0,637 0,782 0,798 0,758 1,000 0,621 0,589 0,677 0,927 0,661 0,661 0,637 0,702 0,653 0,589 0,798 0,798 0,855 1,000 0,855 0,750 0,677 0,750 0,718 0,839 0,581 0,726 0,839 0,629 0,629 0,621 1,000 0,718 0,661 0,847 0,653 0,806 0,597 0,661 0,952 0,645 0,645 0,621 1,000 0,734 0,710 0,597 0,718 0,637 0,685 0,702 0,685 0,605 0,677 1,000 0,669 0,669 0,661 0,710 0,629 0,645 0,839 0,823 0,879 1,000 0,726 0,702 0,669 0,750 0,831 0,685 0,669 0,645 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,677 0,685 0,766 0,653 0,734 0,653 0,661 0,589 0,815 0,815 0,855 0,726 0,589 0,645 0,694 0,839 0,629 0,621 0,629 0,758 0,677 0,774 0,694 0,702 0,629 0,839 0,685 0,629 0,637 0,629 1,000 0,540 0,734 0,790 0,613 0,613 0,629 Bauquai 0,653 0,685 0,653 0,645 0,613 0,734 0,742 0,758 0,613 0,645 0,669 0,823 0,742 0,629 0,645 0,694 0,605 0,694 0,661 0,653 0,677 0,815 0,645 ChiemNganSon BauThanhHoa BaudauPhuTho 0,637 0,702 0,798 0,710 0,629 0,718 0,661 0,790 0,774 0,597 0,605 0,710 0,742 0,677 0,661 0,694 0,750 0,790 0,677 0,653 0,694 0,734 0,613 Chiemtuthoi 0,621 0,734 0,653 0,645 0,629 0,750 0,758 0,823 0,677 0,597 0,637 0,919 0,742 0,661 0,645 0,855 0,605 0,742 0,629 0,653 0,694 0,960 0,613 ChiemtiachanTN BauHaDong Bau8 0,637 0,815 0,718 0,839 0,645 0,702 0,645 0,694 0,758 0,645 0,653 0,645 0,661 0,694 0,742 0,694 0,718 0,790 0,790 0,653 0,677 0,685 0,661 Chiemtiachan 0,718 0,750 0,637 0,661 0,790 0,685 0,726 0,774 0,710 0,790 0,782 0,758 0,629 0,758 0,694 0,774 0,621 0,710 0,613 0,831 0,629 0,766 0,758 Chiemtrangchan Bau1 Bau 0,589 0,637 0,798 0,710 0,677 0,734 0,645 0,806 0,742 0,548 0,556 0,742 0,919 0,677 0,629 0,661 0,653 0,742 0,774 0,653 0,581 0,766 0,565 ChiemtrangvoHP 0,621 0,798 0,815 0,871 0,677 0,621 0,677 0,694 0,774 0,629 0,653 0,645 0,758 0,726 0,806 0,661 0,685 0,661 0,871 0,685 0,645 0,637 0,629 Chiemtrang BalaKienAn BalaNgheAn Tetep GielunHaDong 1,000 0,685 0,556 0,597 0,613 0,556 0,597 0,621 0,782 0,573 0,613 0,613 0,629 0,710 0,581 0,605 0,702 0,653 0,621 0,677 0,758 0,750 0,629 0,677 0,629 0,790 0,815 0,629 0,613 0,758 0,726 0,645 0,605 0,823 0,613 0,798 0,613 0,669 0,758 Chiemxiem 1,000 0,581 0,605 0,573 0,839 0,935 0,750 0,629 0,782 0,621 0,871 0,548 0,661 0,919 0,597 0,581 0,573 0,782 0,734 0,669 0,677 0,823 0,685 0,806 0,758 0,726 0,742 0,750 0,742 0,613 0,855 0,710 0,806 0,621 0,645 0,613 0,766 0,581 0,734 0,790 Chiemrau ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi ChiemNganSon ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho 0,702 0,685 0,621 0,677 0,629 0,750 0,613 0,629 0,661 0,758 0,750 0,581 0,581 0,645 0,774 0,629 0,685 0,694 0,694 0,637 0,710 0,621 0,726 ChiemnhoBN3 0,774 0,710 0,613 0,685 0,669 0,694 0,653 0,637 0,685 0,798 0,790 0,589 0,573 0,653 0,782 0,653 0,742 0,605 0,685 0,677 0,782 0,629 0,798 ChiemnhoBN1 ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 Co39 C101LAC ChiemnhoBN2 GiebacPhuTho Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,710 0,629 0,742 0,742 0,702 92 1,000 0,710 0,815 0,637 0,645 0,750 0,798 0,750 0,637 0,661 0,734 0,653 0,637 0,734 0,750 0,694 0,702 0,782 1,000 0,782 0,718 0,613 0,621 0,734 0,847 0,605 0,645 0,637 0,847 0,702 0,718 0,653 0,726 0,734 0,782 1,000 0,726 0,621 0,613 0,677 0,806 0,613 0,637 0,645 0,726 0,790 0,871 0,645 0,669 0,661 0,839 1,000 0,653 0,710 0,629 0,710 0,774 0,766 0,597 0,661 0,871 0,758 0,726 0,621 0,677 0,661 1,000 0,669 0,782 0,605 0,637 0,645 0,718 0,702 0,685 0,702 0,669 0,613 0,750 0,621 1,000 0,758 0,661 0,645 0,637 0,742 0,597 0,694 0,629 0,855 0,637 0,645 0,645 1,000 0,742 0,629 0,637 0,806 0,790 0,661 0,645 0,742 0,685 0,758 0,661 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,613 0,621 0,677 0,758 0,677 0,758 0,694 0,734 0,694 0,774 0,766 0,669 0,605 0,597 0,645 0,879 0,871 0,605 0,589 0,726 0,734 0,637 0,710 0,653 0,621 0,790 0,677 0,605 0,871 1,000 0,960 0,581 0,581 0,710 0,677 0,661 0,782 0,661 0,629 ChiemNganSon 0,605 0,742 0,637 0,750 0,702 0,573 0,581 0,637 0,702 0,621 0,605 0,653 0,758 0,863 0,685 0,613 0,669 0,694 0,605 Tep2 Chiemtuthoi ChiemtiachanTN 0,710 0,685 0,758 0,774 0,677 0,694 0,718 0,839 0,661 0,694 0,661 0,855 0,605 0,774 0,629 0,734 0,694 0,879 0,645 Tep1 0,790 0,718 0,742 0,694 0,613 0,742 0,766 0,694 0,645 0,806 0,677 0,742 0,637 0,710 0,661 0,750 0,645 0,702 0,790 Techao Chiemtiachan Chiemtrangchan 0,702 0,645 0,669 0,718 0,798 0,669 0,677 0,653 0,766 0,718 0,815 0,685 0,726 0,685 0,863 0,710 0,685 0,661 0,669 ChiemlocNgheAn 0,629 0,685 0,629 0,597 0,677 0,742 0,750 0,597 0,548 0,629 0,790 0,629 0,685 0,677 0,677 0,637 0,694 0,573 0,710 Chiemthongnhat2 ChiemtrangvoHP Chiemtrang 0,766 0,661 0,718 0,637 0,589 0,879 0,903 0,589 0,573 0,798 0,669 0,718 0,774 0,653 0,637 0,694 0,718 0,613 0,895 Chiemthongnhat1 0,782 0,645 0,653 0,637 0,621 0,927 0,935 0,589 0,573 0,734 0,685 0,669 0,742 0,685 0,637 0,790 0,685 0,613 0,831 Chiemtrang Chiemxiem Chiemrau ChiemnhoBN3 ChiemnhoBN2 1,000 0,645 0,613 0,605 0,782 0,645 0,734 0,621 0,573 0,879 0,855 0,589 0,573 0,766 0,637 0,750 0,774 0,637 0,621 0,710 0,653 0,629 0,710 0,806 0,629 0,621 0,661 0,806 0,661 0,774 0,661 0,702 0,694 0,855 0,734 0,694 0,669 0,629 Chiemcho 1,000 0,661 0,661 0,629 0,621 0,718 0,855 0,621 0,669 0,605 0,718 0,742 0,637 0,621 0,669 0,702 0,653 0,597 0,798 0,621 0,629 0,653 0,694 0,790 0,839 0,645 0,653 0,677 0,677 0,677 0,677 0,710 0,831 0,710 0,742 0,637 0,677 0,718 0,661 Chiemcuom ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 0,573 0,694 0,782 0,766 0,605 0,589 0,597 0,831 0,637 0,637 0,589 0,831 0,613 0,637 0,589 0,565 0,653 0,887 0,621 ChiemcoNgheAn 0,750 0,661 0,685 0,589 0,573 0,863 0,855 0,540 0,524 0,750 0,685 0,702 0,758 0,605 0,589 0,677 0,685 0,565 0,911 ChiemNgheAn Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 Co39 C101LAC ChiemPhuXuyen ChiemnhoBN1 Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,605 0,589 0,734 0,702 0,653 0,758 0,702 0,653 93 1,000 0,839 0,726 0,621 0,645 0,645 0,847 0,565 0,653 0,774 1,000 0,661 0,621 0,645 0,726 0,815 0,629 0,637 0,677 1,000 0,685 0,710 0,629 0,669 0,694 0,847 0,710 1,000 0,702 0,702 0,613 0,782 0,597 0,750 1,000 0,661 0,702 0,613 0,718 0,613 1,000 0,637 0,677 0,637 0,629 0,798 0,742 0,605 0,887 Tep2 0,790 0,718 0,613 0,863 C101LAC Tep1 Techao 0,685 0,677 0,669 0,629 Co39 0,653 0,629 0,847 0,645 Teptrang76 ChiemlocNgheAn Chiemthongnhat2 0,637 0,645 0,766 0,710 TepHaiPhong 0,677 0,621 0,774 0,653 TepHaiDuong2 Chiemthongnhat1 Chiemtrang 0,879 0,565 0,621 0,790 TepHaiDuong1 0,734 0,645 0,653 0,629 TepThaiBinh Chiemcho Chiemcuom ChiemcoNgheAn ChiemPhuXuyen 1,000 0,645 0,661 0,629 0,621 0,742 0,774 0,669 0,597 0,750 0,565 0,661 0,637 0,645 0,605 TepNgheAn 1,000 0,774 0,629 0,645 0,806 0,556 0,677 0,645 0,653 0,677 0,927 0,581 0,645 0,685 0,742 0,669 Tepdong Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 Co39 C101LAC 0,710 0,750 0,629 0,911 Tepnai60 0,774 0,637 0,710 0,685 Tep4 TepHaiPhong Teptrang76 Co39 C101LAC Tep6 ChiemNgheAn Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,621 1,000 0,661 0,718 1,000 0,750 0,742 0,621 1,000 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 94 DungheuHoaBinh ChienchauSonTay LuacungNgheAn NepvoiHoaBinh HiendoHaiPhong DauHaiDuong HomgiayND GienuocmuonPT GietronHaiDuong GieThanhHoa GiedaVinhPhuc GiedoVinhPhuc GiebacPhuTho GielunHaDong Tetep BalaNgheAn BalaKienAn Bau Bau1 Bau8 BauHaDong BaudauPhuTho BauThanhHoa Bauquai ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi ChiemNganSon ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 1,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,333 0,333 1,000 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 1,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 1,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 1,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 GiedoVinhPhuc GiedaVinhPhuc GieThanhHoa GietronHaiDuong GienuocmuonPT HomgiayND DauHaiDuong HiendoHaiPhong NepvoiHoaBinh LuacungNgheAn ChienchauSonTay DungheuHoaBinh Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền Euclidean (kiểu hình kháng bạc lá) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 95 GiedoVinhPhuc GiedaVinhPhuc GieThanhHoa GietronHaiDuong GienuocmuonPT HomgiayND DauHaiDuong HiendoHaiPhong NepvoiHoaBinh LuacungNgheAn ChienchauSonTay DungheuHoaBinh Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền Euclidean (kiểu hình kháng bạc lá) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 GiebacPhuTho GielunHaDong Tetep BalaNgheAn BalaKienAn Bau Bau1 Bau8 BauHaDong BaudauPhuTho BauThanhHoa Bauquai ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 1,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 1,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,333 0,000 1,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 1,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,333 0,333 1,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… Bauquai 0,333 0,000 0,333 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 BauThanhHoa 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 BaudauPhuTho 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 BauHaDong 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 Bau8 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 Bau1 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Bau 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 BalaKienAn 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 BalaNgheAn 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Tetep 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 GielunHaDong 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 GiebacPhuTho ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 96 Bauquai BauThanhHoa BaudauPhuTho BauHaDong Bau8 Bau1 Bau BalaKienAn BalaNgheAn Tetep GielunHaDong GiebacPhuTho Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền Euclidean (kiểu hình kháng bạc lá) mẫu nguồn gen lúa 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi ChiemNganSon ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn 1,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 1,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 1,000 1,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 1,000 1,000 1,000 0,000 0,000 0,000 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… ChiemNganSon 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 Chiemtuthoi 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 ChiemtiachanTN 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 Chiemtiachan 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 Chiemtrangchan 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 ChiemtrangvoHP 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 Chiemtrang 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Chiemxiem 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Chiemrau 0,000 0,000 0,333 0,333 1,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 ChiemnhoBN3 0,000 0,000 1,000 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 ChiemnhoBN2 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 ChiemnhoBN1 ChiemNganSon ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 97 ChiemNganSon Chiemtuthoi ChiemtiachanTN Chiemtiachan Chiemtrangchan ChiemtrangvoHP Chiemtrang Chiemxiem Chiemrau ChiemnhoBN3 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN1 Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền Euclidean (kiểu hình kháng bạc lá) mẫu nguồn gen lúa 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 1,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,333 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 1,000 0,333 1,000 0,333 1,000 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 1,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… Tep2 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 Tep1 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Techao 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 ChiemlocNgheAn 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 Chiemthongnhat2 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Chiemthongnhat1 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 Chiemtrang 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Chiemcho 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 Chiemcuom 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,333 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 ChiemcoNgheAn 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,333 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 ChiemPhuXuyen 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,000 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,333 ChiemNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 98 Tep2 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,333 0,333 0,333 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,333 1,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 1,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 1,000 1,000 0,000 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 1,000 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… IRBB5 0,000 0,000 0,000 0,000 1,000 0,000 IR24 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Teptrang76 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 TepHaiPhong 0,000 0,333 0,000 0,000 0,333 0,000 TepHaiDuong2 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 TepHaiDuong1 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 TepThaiBinh 0,000 0,000 0,333 0,333 0,000 0,000 TepNgheAn 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 Tepdong 0,333 0,000 1,000 1,000 0,000 0,000 Tepnai60 0,000 1,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Tep6 TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 Tep4 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 0,000 Tep1 Techao ChiemlocNgheAn Chiemthongnhat2 Chiemthongnhat1 Chiemtrang Chiemcho Chiemcuom ChiemcoNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemNgheAn Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền Euclidean (kiểu hình kháng bạc lá) mẫu nguồn gen lúa 99 DungheuHoaBinh ChienchauSonTay LuacungNgheAn NepvoiHoaBinh HiendoHaiPhong DauHaiDuong HomgiayND GienuocmuonPT GietronHaiDuong GieThanhHoa GiedaVinhPhuc GiedoVinhPhuc GiebacPhuTho GielunHaDong Tetep BalaNgheAn BalaKienAn Bau Bau1 Bau8 BauHaDong BaudauPhuTho BauThanhHoa Bauquai ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi ChiemNganSon ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn 1,000 0,644 0,681 0,622 0,637 0,652 0,689 0,652 0,733 0,637 0,556 0,741 0,630 0,600 0,726 0,733 0,681 0,711 0,756 0,726 0,807 0,800 0,652 0,741 0,644 0,881 0,770 0,674 0,622 0,615 0,607 0,667 0,637 0,741 0,659 0,659 0,637 0,652 0,659 0,600 0,719 0,622 0,719 0,785 0,800 1,000 0,800 0,622 0,770 0,607 0,659 0,622 0,585 0,756 0,674 0,622 0,807 0,778 0,756 0,748 0,681 0,593 0,770 0,815 0,600 0,637 0,741 0,637 0,763 0,600 0,667 0,733 0,756 0,704 0,830 0,770 0,711 0,667 0,778 0,659 0,741 0,726 0,733 0,644 0,704 0,756 0,778 0,681 0,681 1,000 0,644 0,867 0,644 0,711 0,674 0,622 0,822 0,770 0,659 0,756 0,726 0,822 0,770 0,615 0,585 0,881 0,704 0,667 0,659 0,704 0,689 0,830 0,667 0,704 0,681 0,867 0,756 0,822 0,704 0,793 0,822 0,859 0,607 0,733 0,807 0,681 0,622 0,622 0,822 0,667 0,733 0,733 1,000 0,689 0,837 0,578 0,867 0,681 0,659 0,726 0,704 0,696 0,681 0,674 0,622 0,526 0,570 0,644 0,659 0,726 0,570 0,570 0,763 0,756 0,667 0,585 0,578 0,719 0,815 0,704 0,615 0,733 0,644 0,696 0,578 0,674 0,719 0,696 0,637 0,563 0,659 0,607 0,778 0,689 1,000 0,689 0,607 0,704 0,667 0,793 0,859 0,570 0,815 0,726 0,778 0,785 0,630 0,541 0,822 0,704 0,622 0,585 0,689 0,630 0,919 0,607 0,615 0,681 0,911 0,844 0,807 0,719 0,719 0,719 0,933 0,563 0,689 0,822 0,622 0,622 0,607 0,793 0,637 0,704 0,659 1,000 0,696 0,970 0,830 0,644 0,637 0,615 0,711 0,770 0,674 0,578 0,526 0,704 0,630 0,630 0,622 0,600 0,570 0,689 0,756 0,667 0,600 0,593 0,719 0,726 0,659 0,615 0,659 0,644 0,696 0,681 0,556 0,748 0,607 0,533 0,563 0,659 0,711 0,807 0,704 1,000 0,696 0,748 0,622 0,556 0,770 0,659 0,733 0,726 0,600 0,593 0,756 0,756 0,711 0,674 0,800 0,667 0,696 0,600 0,674 0,756 0,674 0,622 0,570 0,696 0,667 0,667 0,726 0,674 0,793 0,607 0,637 0,719 0,674 0,659 0,622 0,719 0,711 0,770 1,000 0,815 0,674 0,637 0,615 0,726 0,785 0,674 0,607 0,541 0,704 0,659 0,644 0,637 0,600 0,600 0,689 0,770 0,681 0,615 0,607 0,733 0,726 0,689 0,630 0,659 0,659 0,711 0,681 0,570 0,748 0,607 0,548 0,578 0,689 0,711 0,807 0,704 1,000 0,578 0,600 0,741 0,689 0,763 0,622 0,600 0,533 0,874 0,667 0,667 0,704 0,726 0,578 0,711 0,689 0,689 0,667 0,644 0,681 0,659 0,637 0,622 0,637 0,667 0,689 0,793 0,607 0,711 0,630 0,585 0,600 0,593 0,793 0,681 0,830 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,726 0,615 0,667 0,637 0,837 0,756 0,644 0,615 0,807 0,689 0,622 0,615 0,689 0,600 0,815 0,593 0,600 0,696 0,822 0,770 0,704 0,719 0,763 0,748 0,815 0,622 0,704 0,778 0,607 0,652 0,711 0,896 0,637 0,719 0,659 1,000 0,622 0,748 0,644 0,726 0,704 0,593 0,489 0,741 0,637 0,674 0,533 0,607 0,681 0,793 0,526 0,548 0,630 0,889 0,852 0,711 0,652 0,770 0,667 0,807 0,511 0,726 0,770 0,674 0,689 0,541 0,741 0,570 0,652 0,607 GiedoVinhPhuc GiedaVinhPhuc GieThanhHoa GietronHaiDuong GienuocmuonPT HomgiayND DauHaiDuong HiendoHaiPhong NepvoiHoaBinh LuacungNgheAn ChienchauSonTay DungheuHoaBinh Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,607 0,622 0,704 0,607 0,556 0,733 0,748 0,704 0,815 0,793 0,630 0,748 0,593 0,681 0,748 0,667 0,600 0,667 0,585 0,644 0,733 0,733 0,622 0,756 0,733 0,615 0,800 0,756 0,622 0,615 0,652 0,704 0,837 100 1,000 0,711 0,659 0,630 0,837 0,733 0,726 0,659 0,733 0,630 0,830 0,667 0,674 0,711 0,793 0,800 0,704 0,733 0,793 0,793 0,770 0,622 0,659 1,000 0,652 0,563 0,844 0,741 0,615 0,711 0,622 0,607 0,733 0,704 0,681 0,644 0,785 0,689 0,741 0,652 0,667 0,711 0,807 0,659 0,726 1,000 0,630 0,615 0,793 0,563 0,689 0,852 0,556 0,622 0,607 0,733 0,859 0,615 0,593 0,674 0,896 0,570 0,600 0,622 0,593 0,496 1,000 0,659 0,659 0,711 0,719 0,659 0,689 0,563 0,652 0,630 0,711 0,570 0,533 0,556 0,674 0,600 0,659 0,607 0,770 0,585 1,000 0,748 0,741 0,704 0,719 0,704 0,770 0,711 0,704 0,711 0,822 0,726 0,719 0,704 0,763 0,837 0,859 0,667 0,763 1,000 0,696 0,719 0,822 0,674 0,681 0,652 0,748 0,830 0,689 0,652 0,793 0,881 0,644 0,704 0,711 0,800 0,689 1,000 0,681 0,637 0,844 0,630 0,778 0,637 0,674 0,622 0,689 0,607 0,652 0,726 0,815 0,644 0,630 0,726 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,630 0,719 0,607 0,741 0,852 0,696 0,615 0,578 0,674 0,674 0,704 0,733 0,637 0,770 0,630 0,615 0,844 0,904 0,541 0,548 0,637 0,600 0,630 0,681 0,719 0,563 0,726 0,681 0,578 0,800 1,000 0,600 0,667 0,593 0,704 0,933 0,659 0,622 0,733 0,941 0,600 0,674 0,681 0,637 0,556 GiedoVinhPhuc 0,741 0,615 0,630 0,726 0,674 0,556 0,578 0,696 0,689 0,844 0,600 0,600 0,644 0,807 0,585 Bauquai GiedaVinhPhuc GieThanhHoa 0,696 0,793 0,733 0,607 0,615 0,852 0,770 0,726 0,644 0,696 0,600 0,867 0,570 0,659 0,778 BauThanhHoa 0,630 0,711 0,607 0,807 0,815 0,533 0,556 0,644 0,741 0,719 0,726 0,578 0,696 0,785 0,681 BaudauPhuTho GietronHaiDuong GienuocmuonPT 0,593 0,748 0,659 0,741 0,659 0,600 0,607 0,726 0,704 0,622 0,689 0,585 0,659 0,704 0,748 BauHaDong 0,778 0,652 0,548 0,807 0,756 0,578 0,644 0,689 0,681 0,659 0,726 0,622 0,667 0,741 0,622 Bau8 HomgiayND DauHaiDuong 0,563 0,733 0,630 0,741 0,659 0,585 0,578 0,696 0,689 0,607 0,689 0,556 0,674 0,704 0,733 Bau1 0,667 0,941 0,852 0,593 0,600 0,689 0,711 0,681 0,748 0,667 0,630 0,778 0,719 0,630 0,867 Bau HiendoHaiPhong NepvoiHoaBinh LuacungNgheAn ChienchauSonTay 1,000 0,652 0,704 0,593 0,681 0,696 0,770 0,585 0,622 0,652 0,622 0,719 0,600 0,637 0,674 0,711 0,644 0,844 0,681 0,622 0,622 0,733 0,748 0,681 0,578 0,719 0,748 0,637 0,541 0,585 0,593 0,696 0,674 0,741 0,570 0,556 0,630 0,674 0,719 BalaKienAn 1,000 0,822 0,681 0,704 0,637 0,593 0,756 0,756 0,630 0,637 0,711 0,667 0,807 0,659 0,696 0,704 0,830 0,733 0,844 0,726 0,652 0,652 0,822 0,615 0,681 0,711 0,852 0,778 0,652 0,585 0,704 0,711 0,741 0,689 0,696 0,615 0,793 0,630 0,719 0,793 BalaNgheAn GiebacPhuTho GielunHaDong Tetep BalaNgheAn BalaKienAn Bau Bau1 Bau8 BauHaDong BaudauPhuTho BauThanhHoa Bauquai ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi ChiemNganSon ChiemNgheAn 0,733 0,756 0,681 0,615 0,607 0,681 0,763 0,674 0,652 0,674 0,696 0,726 0,667 0,681 0,741 Tetep 0,659 0,667 0,533 0,748 0,711 0,681 0,704 0,719 0,622 0,689 0,578 0,622 0,652 0,844 0,622 GiebacPhuTho Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 GielunHaDong DungheuHoaBinh Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,622 0,741 0,615 0,652 0,644 0,696 0,704 0,644 0,822 0,733 0,652 0,622 0,719 101 1,000 0,696 0,644 0,593 0,644 0,719 0,600 0,659 0,652 0,726 0,600 0,615 0,756 0,681 0,800 1,000 0,667 0,615 0,741 0,948 0,652 0,696 0,689 0,689 0,622 0,622 0,778 0,763 0,793 1,000 0,830 0,793 0,704 0,748 0,763 0,889 0,593 0,704 0,837 0,637 0,622 0,622 1,000 0,726 0,667 0,874 0,652 0,807 0,556 0,681 0,874 0,689 0,689 0,570 1,000 0,778 0,733 0,704 0,785 0,637 0,674 0,763 0,711 0,622 0,696 1,000 0,644 0,689 0,696 0,681 0,585 0,659 0,800 0,800 0,830 1,000 0,733 0,711 0,607 0,748 0,837 0,711 0,681 0,578 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,726 0,667 0,719 0,733 0,681 0,637 0,637 0,615 0,785 0,770 0,785 0,719 0,563 0,704 0,719 0,830 0,689 0,615 0,622 0,733 0,644 0,756 0,711 0,733 0,622 0,763 0,704 0,689 0,659 0,674 1,000 0,585 0,726 0,800 0,644 0,615 0,659 Bauquai 0,674 0,741 0,667 0,607 0,600 0,667 0,733 0,748 0,593 0,674 0,674 0,756 0,704 0,541 0,607 0,667 0,600 0,756 0,615 0,615 0,659 0,807 0,630 ChiemNganSon BauThanhHoa BaudauPhuTho 0,659 0,667 0,696 0,756 0,615 0,652 0,674 0,763 0,726 0,630 0,526 0,652 0,689 0,674 0,711 0,667 0,719 0,741 0,630 0,615 0,674 0,733 0,600 Chiemtuthoi 0,607 0,748 0,689 0,600 0,607 0,689 0,770 0,785 0,659 0,637 0,637 0,822 0,726 0,563 0,600 0,763 0,593 0,793 0,578 0,607 0,681 0,889 0,593 ChiemtiachanTN BauHaDong Bau8 0,659 0,815 0,711 0,830 0,659 0,696 0,733 0,748 0,770 0,719 0,615 0,667 0,704 0,630 0,741 0,681 0,719 0,770 0,778 0,644 0,719 0,733 0,674 Chiemtiachan 0,748 0,741 0,622 0,681 0,822 0,696 0,748 0,807 0,741 0,867 0,763 0,741 0,659 0,719 0,726 0,756 0,659 0,741 0,630 0,837 0,659 0,793 0,793 Chiemtrangchan Bau1 Bau 0,585 0,607 0,667 0,637 0,644 0,770 0,674 0,822 0,681 0,585 0,496 0,830 0,911 0,570 0,593 0,622 0,615 0,696 0,778 0,615 0,570 0,793 0,556 ChiemtrangvoHP 0,615 0,696 0,756 0,844 0,659 0,519 0,674 0,644 0,756 0,615 0,570 0,563 0,689 0,719 0,785 0,637 0,674 0,578 0,748 0,644 0,659 0,585 0,615 Chiemtrang BalaKienAn BalaNgheAn Tetep GielunHaDong 1,000 0,741 0,570 0,622 0,600 0,622 0,593 0,593 0,741 0,630 0,600 0,578 0,652 0,644 0,526 0,674 0,681 0,615 0,541 0,719 0,741 0,689 0,652 0,681 0,630 0,815 0,726 0,600 0,578 0,756 0,778 0,630 0,607 0,748 0,563 0,756 0,593 0,667 0,741 Chiemxiem 1,000 0,630 0,622 0,659 0,874 0,926 0,800 0,696 0,800 0,696 0,881 0,585 0,652 0,904 0,615 0,615 0,600 0,793 0,696 0,667 0,652 0,822 0,667 0,822 0,763 0,726 0,778 0,719 0,696 0,644 0,807 0,681 0,785 0,659 0,652 0,600 0,763 0,659 0,733 0,807 Chiemrau ChiemnhoBN1 ChiemnhoBN2 ChiemnhoBN3 Chiemrau Chiemxiem Chiemtrang ChiemtrangvoHP Chiemtrangchan Chiemtiachan ChiemtiachanTN Chiemtuthoi ChiemNganSon ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho 0,667 0,674 0,556 0,644 0,637 0,793 0,667 0,696 0,659 0,741 0,652 0,704 0,652 0,563 0,719 0,615 0,652 0,659 0,756 0,607 0,681 0,681 0,711 ChiemnhoBN3 0,741 0,733 0,585 0,704 0,681 0,704 0,696 0,696 0,719 0,830 0,726 0,615 0,593 0,622 0,778 0,674 0,741 0,630 0,711 0,667 0,741 0,681 0,800 ChiemnhoBN1 ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 ChiemnhoBN2 GiebacPhuTho Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,667 0,607 0,689 0,644 0,689 102 1,000 0,719 0,778 0,607 0,630 0,726 0,770 0,733 0,667 0,667 0,674 0,622 0,548 0,689 0,689 0,681 0,763 0,756 1,000 0,659 0,696 0,526 0,637 0,681 0,807 0,607 0,681 0,570 0,741 0,637 0,630 0,659 0,726 0,733 0,652 1,000 0,637 0,585 0,637 0,681 0,748 0,637 0,548 0,615 0,652 0,756 0,881 0,615 0,652 0,630 0,756 1,000 0,622 0,719 0,674 0,756 0,807 0,807 0,607 0,615 0,852 0,711 0,800 0,719 0,667 0,600 1,000 0,681 0,756 0,585 0,652 0,548 0,763 0,741 0,578 0,630 0,630 0,593 0,704 0,681 1,000 0,793 0,681 0,733 0,615 0,726 0,659 0,659 0,652 0,830 0,674 0,681 0,659 1,000 0,756 0,704 0,615 0,815 0,778 0,615 0,652 0,726 0,704 0,756 0,659 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 1,000 0,667 0,652 0,659 0,696 0,696 0,748 0,763 0,800 0,674 0,711 0,815 0,674 0,696 0,681 0,704 0,933 0,830 0,659 0,637 0,711 0,763 0,689 0,741 0,704 0,652 0,815 0,681 0,681 0,844 1,000 0,867 0,622 0,615 0,689 0,711 0,696 0,763 0,696 0,644 ChiemNganSon 0,578 0,778 0,652 0,741 0,674 0,607 0,504 0,704 0,741 0,548 0,585 0,630 0,726 0,778 0,726 0,578 0,637 0,696 0,578 Tep2 Chiemtuthoi ChiemtiachanTN 0,748 0,652 0,763 0,763 0,726 0,733 0,689 0,770 0,644 0,659 0,637 0,830 0,659 0,756 0,600 0,748 0,719 0,837 0,689 Tep1 0,763 0,637 0,719 0,674 0,593 0,733 0,763 0,607 0,585 0,704 0,607 0,711 0,630 0,741 0,585 0,704 0,630 0,674 0,763 Techao Chiemtiachan Chiemtrangchan 0,704 0,607 0,719 0,733 0,800 0,704 0,630 0,637 0,763 0,659 0,770 0,681 0,733 0,667 0,807 0,689 0,719 0,674 0,674 ChiemlocNgheAn 0,689 0,681 0,689 0,674 0,726 0,778 0,719 0,607 0,585 0,630 0,785 0,681 0,719 0,681 0,689 0,674 0,719 0,644 0,763 Chiemthongnhat2 ChiemtrangvoHP Chiemtrang 0,770 0,600 0,741 0,637 0,615 0,844 0,859 0,556 0,548 0,726 0,630 0,719 0,726 0,704 0,578 0,681 0,667 0,607 0,859 Chiemthongnhat1 0,807 0,637 0,704 0,689 0,667 0,926 0,867 0,607 0,585 0,704 0,681 0,696 0,748 0,696 0,630 0,793 0,689 0,659 0,852 Chiemtrang Chiemxiem Chiemrau ChiemnhoBN3 ChiemnhoBN2 1,000 0,622 0,637 0,593 0,822 0,622 0,748 0,659 0,652 0,837 0,793 0,593 0,570 0,763 0,622 0,800 0,778 0,637 0,600 0,696 0,630 0,696 0,741 0,793 0,681 0,593 0,659 0,785 0,622 0,748 0,674 0,726 0,689 0,785 0,726 0,741 0,696 0,652 Chiemcho 1,000 0,615 0,696 0,622 0,607 0,659 0,770 0,615 0,659 0,578 0,719 0,719 0,593 0,570 0,570 0,637 0,607 0,570 0,830 0,570 0,600 0,622 0,689 0,763 0,770 0,659 0,556 0,622 0,615 0,659 0,711 0,667 0,778 0,652 0,704 0,585 0,644 0,704 0,630 Chiemcuom ChiemNgheAn ChiemPhuXuyen ChiemcoNgheAn Chiemcuom Chiemcho Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 0,593 0,659 0,770 0,756 0,630 0,652 0,548 0,763 0,622 0,652 0,674 0,763 0,622 0,630 0,563 0,563 0,637 0,844 0,622 ChiemcoNgheAn 0,815 0,659 0,770 0,667 0,659 0,889 0,800 0,585 0,578 0,756 0,704 0,763 0,770 0,644 0,607 0,726 0,696 0,637 0,904 ChiemNgheAn Chiemtrang Chiemthongnhat1 Chiemthongnhat2 ChiemlocNgheAn Techao Tep1 Tep2 Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 ChiemPhuXuyen ChiemnhoBN1 Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,548 0,511 0,704 0,622 0,696 0,748 0,711 0,556 103 1,000 0,815 0,741 0,659 0,563 0,541 0,837 0,600 0,600 0,807 1,000 0,644 0,622 0,615 0,667 0,756 0,607 0,637 0,667 1,000 0,770 0,689 0,593 0,741 0,756 0,800 0,800 1,000 0,681 0,674 0,704 0,807 0,630 0,822 1,000 0,622 0,667 0,607 0,726 0,607 1,000 0,585 0,644 0,630 0,600 0,807 0,719 0,674 0,881 Tep2 0,807 0,689 0,585 0,867 IRBB5 Tep1 Techao 0,741 0,741 0,696 0,711 IR24 0,659 0,659 0,881 0,674 Teptrang76 ChiemlocNgheAn Chiemthongnhat2 0,630 0,689 0,793 0,719 TepHaiPhong 0,622 0,593 0,756 0,622 TepHaiDuong2 Chiemthongnhat1 Chiemtrang 0,881 0,630 0,659 0,852 TepHaiDuong1 0,667 0,622 0,652 0,607 TepThaiBinh Chiemcho Chiemcuom ChiemcoNgheAn ChiemPhuXuyen 1,000 0,556 0,622 0,607 0,600 0,696 0,778 0,630 0,615 0,748 0,556 0,652 0,681 0,607 0,622 TepNgheAn 1,000 0,830 0,548 0,615 0,733 0,563 0,659 0,696 0,622 0,652 0,904 0,578 0,593 0,652 0,711 0,622 Tepdong Tep4 Tep6 Tepnai60 Tepdong TepNgheAn TepThaiBinh TepHaiDuong1 TepHaiDuong2 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 0,733 0,733 0,659 0,911 Tepnai60 0,704 0,585 0,689 0,630 Tep4 TepHaiPhong Teptrang76 IR24 IRBB5 Tep6 ChiemNgheAn Phụ lục Ma trận khoảng cách di truyền MS (kiểu gen kháng ñạo ôn) mẫu nguồn gen lúa 1,000 0,674 1,000 0,659 0,719 1,000 0,807 0,778 0,644 1,000 Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… 104 [...]... tạo giống lúa kháng bệnh ñạo ôn, bạc lá ở nước ta 2 Mục ñích và yêu cầu của ñề tài 2.1 Mục ñích ðánh giá, phân tích và xác ñịnh ñược một số mẫu nguồn gen có khả năng kháng/ nhiễm ñạo ôn, bạc lá 2.2 Yêu cầu của ñề tài ðánh giá khả năng kháng; phân tích ña dạng di truyền; xác ñịnh alen kháng ñạo ôn, bạc lá và mối liên kết giữa kiểu hình và kiểu gen kháng ñạo ôn, bạc lá của 58 mẫu nguồn gen lúa ñịa phương... 3.1 TÍNH KHÁNG ðẠO ÔN, BẠC LÁ 52 3.1.1 Khả năng kháng ñạo ôn 52 3.1.2 Khả năng kháng bạc lá 58 3.2 ðA DẠNG DI TRUYỀN CÁC NGUỒN GEN LÚA 66 3.2 1 Tách chiết ADN tổng số 66 3.2.2 Nhận dạng di truyền các giống lúa bằng chỉ thị SSR 66 3.2.3 ða dạng di truyền liên quan ñến khả năng kháng ñạo ôn 72 3.2.3.1 Số băng ADN và số loại alen thể hiện 72 3.2.3.2 Hệ số PIC của các mồi SSR liên quan ñến khả năng 72 kháng. .. là hai trong số những loại bệnh hại phổ biến và rất nghiêm trọng ñối với sản xuất lúa; việc phân tích, ñánh giá và xác ñịnh các gen kháng ñạo ôn, bạc lá trong lúa là việc làm rất cần thiết và có ý nghĩa khoa học cũng như thực tiễn cao Vì vậy, "ðánh giá ña dạng di truyền liên quan ñến tính kháng bệnh ñạo ôn, bạc lá của một số nguồn gen lúa ñịa phương miền Bắc Việt Nam" , ñể xác ñịnh những nguồn vật liệu... tạo giống kháng ñạo ôn, bạc lá thông qua Ngân hàng gen Cây trồng Quốc gia tại Trung tâm Tài nguyên thực vật, An Khánh, Hoài ðức, Hà Nội; 3.2 Ý nghĩa thực tiễn Kết quả ñánh giá khả năng kháng/ nhiễm; phân tích ña dạng di truyền và xác ñịnh alen kháng ñạo ôn, bạc lá của 58 mẫu nguồn gen lúa là cơ sở khoa học ñể giới thiệu các nguồn gen lúa ñịa phương mang alen kháng như là nguồn vật liệu di truyền mới... chỉ có thể kháng với một hoặc vài loài nấm gây bệnh Thông thường mỗi giống lúa kháng chỉ mang một gen kháng Vì vậy, khả năng kháng thấp, muốn giống kháng tốt, bền vững thì giống phải quy tụ ñược nhiều gen kháng Gen kháng ñạo ôn ở lúa chia thành: gen kháng chính và gen kháng phụ Gen kháng chính biểu hiện thông qua hiệu quả chất lượng, di truyền ñơn giản và ñặc thù chủng Gen kháng phụ là những gen mà hoạt... sản Lúa chiêm chỉ còn tồn tại ít trong sản xuất nhưng giá trị nguồn gen của lúa chiêm là vô cùng quý giá Lúa Tám thơm là một trong ba nhóm giống lúa thơm chính trên thế giới; - Nhóm giống Việt- Kh'mer mang ñặc tính quảng canh của vùng ñồng bằng sông Cửu Long Tài nguyên di truyền lúa thuộc nhóm này có các nguồn gen ñặc trưng là lúa nổi, lúa chịu nước sâu, lúa chịu ñất chua phèn, lúa chịu mặn, lúa có dạng. .. 3.2.4 ða dạng di truyền liên quan ñến khả năng kháng bạc lá 74 3.2.4.1 Số băng ADN và số loại alen thể hiện 75 3.2.4.2 Hệ số PIC của các mồi SSR liên quan ñến khả năng 75 kháng bạc lá Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp …………………… x Trang 3.3 MỐI LIÊN KẾT GIỮA KIỂU HÌNH VÀ KIỂU GEN KHÁNG 77 3.3.1 Mối liên kết giữa kiểu hình và kiểu gen kháng ñạo ôn 77 3.3.2 Mối liên. .. giống kháng ñạo ôn, bạc lá 4 ðối tượng và phạm vi nghiên cứu của ñề tài 4.1 ðối tượng nghiên cứu 58 mẫu nguồn gen lúa thu thập ở miền Bắc Việt Nam và ñược bảo quản trong Ngân hàng gen Cây trồng Quốc gia tại Trung tâm Tài nguyên thực vật, An Khánh, Hoài ðức, Hà Nội 4.2 Phạm vi nghiên cứu Giới hạn của ñề tài là ñánh giá khả năng kháng/ nhiễm; phân tích ña dạng di truyền và xác ñịnh alen kháng ñạo ôn, bạc lá. .. nguyên di truyền lúa Việt Nam như: lúa Chiêm, lúa Tám thơm Lúa Chiêm có những nguồn gen quý nổi tiếng thế giới như gen kháng ñạo ôn, gen chịu ñất chua phèn, chịu ñất nghèo lân, chịu rét thời kỳ mạ và thời kỳ lúa trỗ Nguồn gen kháng ñạo ôn của bộ giống lúa chiêm Tẻ tép ñược Viện nghiên cứu lúa Quốc tế và nhiều quốc gia trồng lúa khác sử dụng rộng rãi trong ñầu thập kỷ 58 ñể lai tạo nhiều giống lúa cao... xứ của cây lúa trồng châu Á [20] Theo ðào Thế Tuấn (1996), cho biết trên lãnh thổ Việt Nam tồn tại ba nhóm giống lúa cổ truyền có ñặc tính di truyền khác nhau [17]: - Nhóm giống lúa Việt Thái ở vùng núi phía Bắc, chủ yếu là lúa nương ðây là một trong những nhóm giống lúa có sự ña dạng di truyền cao nhất thế giới; - Nhóm giống lúa Việt mang ñặc tính thâm canh ở vùng ñồng bằng sông Hồng ðây là nhóm lúa ... ñạo ôn, bạc lúa việc làm cần thiết có ý nghĩa khoa học thực tiễn cao Vì vậy, "ðánh giá ña dạng di truyền liên quan ñến tính kháng bệnh ñạo ôn, bạc số nguồn gen lúa ñịa phương miền Bắc Việt Nam" ,... ðA DẠNG DI TRUYỀN NGUỒN GEN LÚA 33 1.5.1 Nghiên cứu ña dạng nguồn gen lúa thị hình thái 33 1.5.2 Nghiên cứu ña dạng di truyền thị ADN 34 1.5.3 Nghiên cứu ña dạng di truyền liên quan ñến tính kháng. .. 3.1 TÍNH KHÁNG ðẠO ÔN, BẠC LÁ 52 3.1.1 Khả kháng ñạo ôn 52 3.1.2 Khả kháng bạc 58 3.2 ðA DẠNG DI TRUYỀN CÁC NGUỒN GEN LÚA 66 3.2 Tách chiết ADN tổng số 66 3.2.2 Nhận dạng di truyền giống lúa