Luận án tiến sĩ HUS xác định tỉ lệ nhiễm và một số đặc điểm dịch tễ học phân tử của các chủng clostridium difficile mang gen độc tố phân lập được từ bệnh nhân tiêu chảy

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN ĐẶNG THỊ THÙY DƢƠNG XÁC ĐỊNH TỈ LỆ NHIỄM VÀ MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC PHÂN TỬ CỦA CÁC CHỦNG Clostridium difficile MANG GEN ĐỘC TỐ PHÂN LẬP ĐƢỢC TỪ BỆNH NHÂN TIÊU CHẢY SAU DÙNG KHÁNG SINH TẠI BỐN BỆNH VIỆN Ở HÀ NỘI (2013 - 2015) LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC HÀ NỘI - 2018 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN ĐẶNG THỊ THÙY DƢƠNG XÁC ĐỊNH TỈ LỆ NHIỄM VÀ MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC PHÂN TỬ CỦA CÁC CHỦNG Clostridium difficile MANG GEN ĐỘC TỐ PHÂN LẬP ĐƢỢC TỪ BỆNH NHÂN TIÊU CHẢY SAU DÙNG KHÁNG SINH TẠI BỐN BỆNH VIỆN Ở HÀ NỘI (2013 – 2015) CHUYÊN NGÀNH : VI SINH VẬT HỌC MÃ SỐ : 62420107 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Ngƣời hƣớng dẫn khoa học: PGS TS BÙI THỊ VIỆT HÀ TS VŨ THỊ THU HƢỜNG HÀ NỘI - 2018 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi đƣợc thực dƣới hƣớng dẫn tập thể cán hƣớng dẫn Các số liệu luận án phần kết đề tài: “Nghiên cứu vai trò gây bệnh đặc điểm dịch tễ học phân tử vi khuẩn kỵ khí hiếu khí gây hội chứng tiêu chảy liên quan đến kháng sinh số bệnh viện Hà Nội” Quỹ Phát triển Khoa học Công nghệ Quốc gia – NAFOSTED tài trợ, mã số đề tài 106.03-2012.65, TS Vũ Thị Thu Hƣờng chủ nhiệm đề tài mà thành viên Các kết luận án trung thực chƣa đƣợc khác công bố Nghiên cứu sinh Đặng Thị Thùy Dƣơng LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com LỜI CẢM ƠN Luận án khơng thể hồn thành thiếu hƣớng dẫn, hỗ trợ, động viên nhiều cá nhân quan: Lời tơi xin bày tỏ kính trọng lòng biết ơn sâu sắc tới tập thể Cán hƣớng dẫn khoa học: PGS.TS Bùi Thị Việt Hà, Bộ môn Vi sinh vật học, Khoa Sinh học, Trƣờng Đại học khoa học Tự nhiên, truyền thụ cho kiến thức chuyên ngành Vi sinh vật học, tạo điều kiện cho suốt trình học tập, tận tình sửa chữa luận án, đặc biệt cô động viên cho học quý giá giải khó khăn trở ngại học tập nhƣ sống; TS Vũ Thị Thu Hường, Trƣởng phòng Vi khuẩn Kỵ khí, Khoa Vi khuẩn, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ƣơng, chủ nhiệm đề tài “Nghiên cứu vai trò gây bệnh đặc điểm dịch tễ học phân tử vi khuẩn kỵ khí hiếu khí gây hội chứng tiêu chảy sau dùng kháng sinh số bệnh viện Hà Nội” với mã số đề tài 106.03-2012.65 Quỹ Phát triển Khoa học Công nghệ Quốc gia tài trợ, cho phép tham gia đề tài, đƣợc sử dụng phần số liệu đề tài vào luận án, tận tình hƣớng dẫn bảo để tơi nắm vững thao tác kỹ thuật nhƣ kiến thức chuyên sâu đối tƣợng nghiên cứu, tận tình giúp tơi sửa chữa hồn thiện luận án, dẫn dắt bảo trở thành nhà nghiên cứu khoa học Tôi xin trân trọng cảm ơn Ban Giám hiệu, Phòng Đào tạo Sau Đại học Khoa Sinh học, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên tạo điều kiện tốt cho tơi suốt q trình học tập Tôi xin trân trọng cảm ơn Đảng ủy, Hội đồng Trường, Ban Giám hiệu, Labo XNATVSTP, đặc biệt TTND PGS TS Vũ Đình Chính, TS Đinh Thị Diệu Hằng Trường Đại học Kỹ thuật Y tế Hải Dương tạo điều kiện tốt cho học hồn thành luận án Tơi xin trân trọng cảm ơn Ban Giám đốc Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương tạo điều kiện cho q trình tơi làm nghiên cứu đề tài Viện Tôi xin chân thành cảm ơn ThS Tăng Thị Nga, CN Lê Thị Trang, CN Phạm Thị Hồng Thủy, BS Phùng Thu Hằng giúp đỡ việc thu thập mẫu, thực kỹ thuật thời gian tơi làm việc phịng Vi khuẩn Kỵ khí Tơi xin chân thành cảm ơn thầy cô giáo Bộ môn Vi sinh vật học, Trường ĐH Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội bạn đồng nghiệp trường ĐH Kỹ thuật Y tế Hải Dương nhiệt tình giúp đỡ, ủng hộ, động viên tơi suốt q trình học tập Cuối cùng, tơi xin gửi lời cảm ơn đến Bố, Mẹ, Chồng, con, người thân yêu động viên hỗ trợ nhiều thời gian, vật chất tinh thần để tơi vƣợt qua khó khăn q trình học tập nghiên cứu Hà Nội, ngày tháng năm 2018 ĐẶNG THỊ THÙY DƢƠNG LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN LỜI CẢM ƠN DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT .5 DANH MỤC HÌNH DANH MỤC BẢNG ……………………………………………………………… MỞ ĐẦU 10 TÍNH CẤP THIẾT CỦA ĐỀ TÀI 10 MỤC TIÊU CỦA ĐỀ TÀI 11 Ý NGHĨA KHOA HỌC VÀ THỰC TIỄN CỦA ĐỀ TÀI 11 3.1 Ý nghĩa khoa học 11 3.2 Ý nghĩa thực tiễn 12 PHẠM VI NGHIÊN CỨU CỦA LUẬN ÁN 12 NHỮNG ĐÓNG GÓP MỚI CỦA LUẬN ÁN 13 CHƢƠNG TỔNG QUAN CÁC VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 14 1.1 TIÊU CHẢY SAU DÙNG KHÁNG SINH 14 1.1.1 Định nghĩa 14 1.1.2 Các tác nhân gây tiêu chảy sau dùng kháng sinh 14 1.2 VI KHUẨN Clostridium difficile 16 1.2.1 Đặc điểm sinh học 16 1.2.1.1 Lịch sử 16 1.2.1.2 Hình thể 16 1.2.1.3 Nuôi cấy 16 1.2.1.4 Tính chất sinh hóa 18 1.2.1.5 Sức đề kháng 18 1.2.2 Độc tố C difficile 18 1.2.2.1 Độc tố TcdA TcdB 18 1.2.2.2 Độc tố kép CDT 23 1.2.3 Cơ chế gây bệnh 23 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 1.2.4 Các bệnh C difficile gây 24 1.2.5 Các yếu tố nguy nhiễm trùng C difficile 26 1.3 TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU TRONG VÀ NGỒI NƢỚC 27 1.3.1 Trên giới 27 1.3.1.1 Tình hình nhiễm trùng C difficile 27 1.3.1.2 Dịch tễ học phân tử chủng C difficile gây bệnh 29 1.3.2 Trong nƣớc 31 1.4 CÁC PHƢƠNG PHÁP CHẨN ĐOÁN NHIỄM TRÙNG DO Clostridium difficile 34 1.4.1 Phƣơng pháp nuôi cấy phân lập C difficile sinh độc tố 35 1.4.1.1 Nuôi cấy phân lập C difficile từ bệnh phẩm 35 1.4.1.2 Xác định chủng vi khuẩn C difficile sinh độc tố 37 1.4.1.3 Ƣu, nhƣợc điểm 37 1.4.2 Phƣơng pháp khuếch đại gen phát gen độc tố trực tiếp từ mẫu phân 38 1.4.2.1 Các gen đích 38 1.4.2.2 Các phƣơng pháp khuếch đại gen 38 1.4.2.3 Ƣu nhƣợc điểm phƣơng pháp khuếch đại gen 40 1.4.3 Các phƣơng pháp khác 40 1.4.3.1 Trung hòa độc tố tế bào (CCCNA – cell culture cytotoxicity neutralization assay) 40 1.4.3.2 Phƣơng pháp miễn dịch hấp phụ enzym (EIAs ELISA) 41 1.5 CÁC PHƢƠNG PHÁP PHÂN LOẠI PHÂN TỬ CÁC CHỦNG Clostridium difficile MANG GEN ĐỘC TỐ 42 1.5.1 Phƣơng pháp PCR ribotyping 42 1.5.2 Phƣơng pháp giải trình tự gen slpA 43 1.5.3 Các phƣơng pháp khác 44 CHƢƠNG ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 47 2.1 ĐỐI TƢỢNG NGHIÊN CỨU 47 2.2 CỠ MẪU, THỜI GIAN VÀ ĐỊA ĐIỂM NGHIÊN CỨU 47 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 2.3 THIẾT KẾ NGHIÊN CỨU 48 2.4 CÁC BIẾN SỐ NGHIÊN CỨU 48 2.4.1 Mẫu bệnh phẩm 48 2.4.2 Thông tin bệnh nhân 49 2.5 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 50 2.5.1 Chủng vi khuẩn 50 2.5.2 Sinh phẩm 51 2.5.3 Môi trƣờng nuôi cấy 52 2.5.4 Thiết bị, dụng cụ 53 2.6 NỘI DUNG VÀ CÁC KỸ THUẬT SỬ DỤNG TRONG NGHIÊN CỨU 54 2.6.1 Đánh giá hiệu xác định giới hạn phát môi trƣờng CCMA 54 2.6.2 Nuôi cấy phân lập C difficile mang gen độc tố 56 2.6.2.1 Nuôi cấy phân lập C difficile từ mẫu phân 56 2.6.2 Xác định chủng vi khuẩn C difficile phân loại độc tố 57 2.6.3 Phƣơng pháp nested PCR 59 2.6.4 Phƣơng pháp PCR ribotyping 60 2.6.5 Phƣơng pháp giải trình tự gen slpA 62 2.7 ĐẠO ĐỨC TRONG NGHIÊN CỨU 64 2.8 PHƢƠNG PHÁP XỬ LÝ VÀ PHÂN TÍCH SỐ LIỆU 65 CHƢƠNG KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN 66 3.1 TỈ LỆ NHIỄM C difficile MANG GEN ĐỘC TỐ Ở BỆNH NHÂN TIÊU CHẢY SAU DÙNG KHÁNG SINH 66 3.1.1 Kết đánh giá hiệu xác định giới hạn phát môi trƣờng CCMA 66 3.1.1.1 Tính suất 66 3.1.1.2 Tính chọn lọc 66 3.1.1.3 Giới hạn phát môi trƣờng CCMA 67 3.1.2 So sánh phƣơng pháp nested PCR với phƣơng pháp nuôi cấy C difficile mang gen độc tố 70 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 3.1.3 Tỉ lệ nhiễm C difficile mang gen độc tố bệnh nhân tiêu chảy sau dùng kháng sinh 75 3.1.3.1 Tỉ lệ nhiễm C difficile mang gen độc tố (C difficile MGĐT) 75 3.1.3.2 Tỉ lệ nhiễm C difficile MGĐT theo kiểu độc tố 79 3.1.3.3 Tỉ lệ nhiễm C difficile MGĐT theo đặc điểm nhân học 83 3.1.3.4 Tỉ lệ nhiễm C difficile MGĐT theo tiền sử sử dụng kháng sinh 89 3.1.3.5 Tỉ lệ nhiễm C difficile MGĐT theo tiền sử bệnh lý kèm theo 95 3.1.3.6 Tỉ lệ nhiễm C difficile MGĐT theo khoa bệnh viện 97 3.2 ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC PHÂN TỬ CỦA CÁC CHỦNG Clostridium difficile MANG GEN ĐỘC TỐ 99 3.2.1 Đặc điểm dịch tễ học phân tử C difficile MGĐT theo phƣơng pháp phân loại PCR ribotyping 99 3.2.1.1 Kết phân loại 99 3.2.1.2 Sự phân bố ribotype 102 3.2.1.3 Sự phân bố ribotype C difficile lƣu hành bệnh viện Hà Nội so với số nƣớc giới 107 3.2.2 Đặc điểm dịch tễ học phân tử chủng C difficile MGĐT theo phƣơng pháp giải trình tự gen slpA 109 3.2.2.1 Kết phân loại 109 3.2.2.2 Mối quan hệ di truyền gen slpA chủng nghiên cứu chủng giới 113 KẾT LUẬN 119 KIẾN NGHỊ 120 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH CỦA TÁC GIẢ ĐÃ CƠNG BỐ CĨ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN 121 TÀI LIỆU THAM KHẢO 122 PHỤ LỤC LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT ADN Axit DeoxyRibonucleic ARN Axit Ribonucleic bp Base pair BHI Brain heart Infusion (Canh thang não tim) CCMA Cyclocerine – Cefoxitin – Manitol – Agar CCFA Cyclocerine – Cefoxitin – Fructose – Agar CCMB Cyclocerine – Cefoxitin – Manitol – Broth CDC Centers for Disease Control and Prevention (Trung tâm phòng ngừa kiểm sốt bệnh, Mỹ) CFU Colony form unit (Đơn vị hình thành khuẩn lạc) CI Confidence Interval (khoảng tin cậy) C difficile MGĐT C difficile mang gen độc tố Elisa Enzym linked – immusorbent assay (Thử nghiệm hấp phụ miễn dịch gắn enzym) GAM-HT GAM – Horse Taurocholate kb Kilobase kDa Kilodalton MIC Minimal Inhibitory Concentration (Nồng độ ức chế tối thiểu) MLVA Multilocus Variable-number tandem-repeat Analysis (Phân tích trình tự lặp lại ngẫu nhiên) MLST Multilocus sequence typing (Phân tích trình tự đa locus) MRSA Methicillin Resistant Staphylococcus aureus LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com OR Odd Ratio (tỉ suất chênh) PCR Polymerase Chain Reaction PFGE Pulsed Field Gel Electrophoresis (Điện di xung trƣờng) pg Picrogam REA Endonuclease Restriction Analysis (Phân tích đoạn nhờ enzym giới hạn) SHEA/IDSA Society for Healthcare Epidemiology of America and the Infectious Diseases Society of America (Hiệp hội nghiên cứu dịch tễ học Mỹ/ bệnh truyền nhiễm Mỹ) slpAST slpA Sequence Typing (Phƣơng pháp phân loại giải trình tự gen slpA) UK United Kingdom (Vƣơng quốc liên hợp Anh Bắc Ireland) US United States (Hợp chủng quốc Hoa Kỳ) LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com PHỤ LỤC Trang thiết bị dụng cụ sử dụng nghiên cứu  Trang thiết bị Trang thiết bị Hãng Tủ an toàn sinh học cấp II Esco Tủ Clean Beach Esco Tủ ấm Sanyo Máy khuếch đại gen ABI, Eppendorf Bể nguồn điện di Enduro TM Máy soi chụp gel Eppendorf Hệ thống phân tích di truyền 3500 ABI, Eppendorf Máy đo mật độ ADN Eppendorf Máy ly tâm Eppendorf Nồi hấp ƣớt tiệt trùng Hyrayama Kính hiển vi quang học Olympus Tủ lạnh 4oC Panasonic Tủ lạnh – 20oC Sanyo Tủ lạnh - 80oC Hitachi  Dụng cụ − Dụng cụ lấy mẫu: hộp đựng mẫu phân có gắn mái chèo, hộp nhựa có nắp vặn chặt − Dụng cụ thí nghiệm: túi ủ kỵ khí Gaspak EZ hãng BD, giấy thị oxi hãng BD, dụng cụ cần thiết khác LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com PHỤ LỤC 3.1 Kết xét nghiệm mẫu phân dƣơng tính với phƣơng pháp TT Mã số Nested PCR phát gen tcdA Nuôi cấy phân lập C difficile sinh độc tố CCMA A+B+ A-B+ A-B- 1 - + + - - 2 + + - + - 17 + + + - - 90 + + - + - 278 + - - - - 280 + - - - - 301 + - - - - 308 + + - + - 311 + + - + - 10 312 + + - + - 11 319 + + + - - 12 322 + + - + - 13 328 + + - - + 14 329 - + - + - 15 340 + + + - - 16 370 + + + - - 17 375 + + + - - 18 409 - + - + - 19 421 + + + - - 20 440 + + + - - 21 443 + + - + - LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 22 446 + + - + - 23 460 + + - + - 24 461 + - - - - 25 503 + - - - - 26 504 + + + - - 27 1004 + + - - + 28 1005 + + + - - 29 1010 + + + - - 30 1011 - + - + - 31 1020 + + + + + 32 1021 + + - - + 33 1056 + + - + - 34 1091 + + + - - 35 1092 + - - - - 36 1095 + + + - - 37 1098 + + + - - 38 1102 + + + - - 39 1131 + - - - - 40 1137 - + - + - 41 1144 + + + - - 42 1147 - + - + - 43 1149 + + + - - 44 1150 + + - + - 45 1152 - + - + - 46 1155 + - - - - LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 47 1184 + + - + - 48 1187 + - - - - 49 1198 + + - + - 50 1202 + + + - - 51 1208 + - - - - 52 1214 + + + - - 53 1218 + - - - - 54 1225 + + - - + 55 1231 + - - - - 56 1233 + + + - - 57 1235 + + + - - 58 1253 + + - - + 59 1269 + + + - - 60 1278 - + + - - 61 1296 + + - + - 62 1311 - + + + - 63 1314 + + - + - 64 1351 + + - + + 65 1361 + + - + - 66 1372 + - - - - 67 1376 + - - - - 68 1380 + - - - - 69 1385 + + - + - 70 1386 + + - + - 71 1393 + + - + - LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 72 1415 + - - - - 73 1431 - + + - - 74 1432 + + + - - 75 1454 + - - - - 76 1475 + + - + - 77 1476 + + - + - 78 1483 + - - - - 79 1484 + + - + - 80 1515 + + - + - 81 1521 + - - - - 82 1523 + + - + - 83 1536 + + + - - 84 1546 + - - - - 85 1547 + + - + - 86 1550 + + - + - 87 1551 + - - - - 88 1555 + + + - - 89 1579 + + + + - 90 1592 + + + - + 91 1629 + - - - - 92 21056 + + - + - 93 21476 + + - + - 94 31476 + + - + - 95 41476 + - - - - 85 99 31 39 35 Tổng LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 3.2 Kết giải trình tự gen từ sản phẩm nested PCR Mẫu 1415 Mẫu 1483 3.3 Kết phân loại phân tử 65 chủng C difficile sinh độc tố Mã số Năm thu thập mẫu Kiểu độc tố Phân loại theo ribotype Phân loại theo trình tự gen slpA 2014 A-B+ trf fr-01 312 2014 A-B+ trf fr-01 322 2013 A-B+ trf fr-01 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 446 2015 A-B+ trf fr-01 1056 2014 A-B+ trf fr-01 1152 2014 A-B+ trf fr-01 1184 2014 A-B+ trf fr-01 1198 2014 A-B+ trf fr-01 1296 2015 A-B+ trf fr-01 1314 2014 A-B+ trf fr-01 1351 2014 A-B+ trf fr-23 1361 2014 A-B+ trf fr-23 1385 2014 A-B+ trf fr-01 1386 2015 A-B+ trf fr-01 1476 2015 A-B+ trf fr-01 1484 2015 A-B+ trf fr-01 1523 2015 A-B+ trf fr-01 21056 2014 A-B+ trf fr-01 21476 2015 A-B+ trf fr-01 90 2014 A-B+ 017 fr-01 308 2013 A-B+ 017 fr-01 311 2013 A-B+ 017 fr-01 329 2014 A-B+ 017 fr-01 409 2013 A-B+ 017 fr-01 443 2014 A-B+ 017 fr-01 460 2015 A-B+ 017 fr-01 1011 2014 A-B+ 017 fr-01 1137 2013 A-B+ 017 fr-01 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 1147 2013 A-B+ 017 fr-01 1150 2013 A-B+ 017 fr-01 1393 2015 A-B+ 017 fr-01 1515 2015 A-B+ 017 fr-01 1547 2015 A-B+ 017 fr-01 1311 2014 A-B+ 017 fr-01 1550 2015 A-B+ 017 fr-24 2014 A+B+ og39 og39-01 319 2014 A+B+ og39 og39-01 421 2013 A+B+ og39 og39-01 440 2014 A+B+ og39 og39-01 1005 2013 A+B+ og39 og39-01 1010 2014 A+B+ og39 og39-01 1020 2013 A+B+ og39 og39-01 1098 2013 A+B+ og39 og39-01 1102 2013 A+B+ og39 og39-01 1233 2014 A+B+ og39 og39-01 1592 2015 A+B+ og39 t-25-01 17 2013 A+B+ okz gr-02 340 2014 A+B+ cc835 kr-03.1 370 2014 A+B+ cc835 kr-03.1 375 2014 A+B+ cc835 kr-03.1 504 2014 A+B+ cc835 kr-03.1 1144 2013 A+B+ cc835 kr-03.1 1149 2013 A+B+ cc835 kr-03.1 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 1202 2013 A+B+ cc835 kr-03.1 1214 2014 A+B+ cc835 kr-03.1 1278 2015 A+B+ cc835 kr-03.1 1431 2015 A+B+ cc835 kr-03.1 1536 2015 A+B+ cc835 kr-03.1 1555 2015 A+B+ cc835 kr-03.1 1579 2015 A+B+ cc835 kr-03.1 1235 2014 A+B+ 001 gr-01 1091 2013 A+B+ 001 gr-01 1095 2013 A+B+ cr cr-01 1432 2015 A+B+ cr cr-01 1269 2014 A+B+ 014 hr-02 Xác nhận chủ nhiệm đề tài TS Vũ Thị Thu Hƣờng LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com PHỤ LỤC Danh sách kết phân tích Ribotype chủng gửi sang Nhật Bản TT Mã số Kết phân loại Kết phân loại chủng Viện truyền nhiễm Nhật Bản nghiên cứu Kiểu độc tố Ribotype Kiểu độc tố Ribotype 17 A+B+ okz A+B+ okz 308 A-B+ 017 A-B+ 017 311 A-B+ 017 A-B+ 017 322 A-B+ trf A-B+ trf 409 A-B+ 017 A-B+ 017 421 A+B+ og39 A+B+ og39 1005 A+B+ og39 A+B+ og39 1020 A+B+ og39 A+B+ og39 1091 A+B+ 001 A+B+ 001 10 1095 A+B+ cr A+B+ cr 11 1098 A+B+ og39 A+B+ og39 12 1102 A+B+ og39 A+B+ og39 13 1137 A-B+ 017 A-B+ 017 14 1144 A+B+ cc835 A+B+ cc835 15 1147 A-B+ 017 A-B+ 017 16 1149 A+B+ cc835 A+B+ cc835 17 1150 A-B+ 017 A-B+ 017 18 1202 A+B+ cc835 A+B+ cc835 Xác nhận chủ nhiệm đề tài TS Vũ Thị Thu Hƣờng LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com PHỤ LỤC Kết hàng trình tự nucleotit gen slpA 10 chủng đại diện cho 10 phân nhóm slpAST Mã chủng Phân nhóm 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 312 1361 1550 1536 421 1235 17 1432 1269 1592 Chú thích: Nucleotit đƣợc khoanh tròn nucleotit khác so với phân nhóm cịn lại nhóm LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com ... tế trên, tiến hành đề tài ? ?Xác định tỉ lệ nhiễm số đặc điểm dịch tễ học phân tử chủng Clostridium difficile mang gen độc tố phân lập đƣợc từ bệnh nhân tiêu chảy sau dùng kháng sinh bốn bệnh viện... HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN ĐẶNG THỊ THÙY DƢƠNG XÁC ĐỊNH TỈ LỆ NHIỄM VÀ MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC PHÂN TỬ CỦA CÁC CHỦNG Clostridium difficile MANG GEN ĐỘC TỐ PHÂN LẬP... nƣớc ta 2) Phân tích đƣợc số đặc điểm dịch tễ học phân tử chủng C difficile mang gen độc tố Để thực mục tiêu này, chủng C difficile mang gen độc tố phân lập từ phân đƣợc phân loại phân tử hai phƣơng