Ngân hàng TMCP Quân đội Chi nhánh Long Biên được thành lập trên cơ sở nâng cấp phòng giao dịch 3 (491A Nguyễn Văn Cừ), đi vào hoạt động từ ngày 16/03/2000 theo quyết định số 0113016533 của Sở kế hoạch và đầu tư TP Hà Nội, là một trong những cơ sở tiên phong đi đầu trong hệ thống ngân hàng TMCP Quân đội chú trọng triển khai nghiệp vụ ngân hàng bán lẻ, lấy phát triển dịch vụ và đem lại tiện ích cho khách hàng làm nền tảng, hoạt động theo mô hình một cửa với quy trình nghiệp vụ ngân hàng hiện đại và công nghệ tiên tiến, theo đúng dự án hiện đại hoá ngân hàng Việt Nam hiện nay.
Việc thành lập Ngân hàng TMCP Quân đội Chi nhánh Long Biên phù hợp với tiến trình thực hiện chương trình cơ cấu lại, gắn liền với đổi mới toàn diện và phát triển vững chắc với nhịp độ tăng trưởng cao, đa dạng hoá khách hàng thuộc mọi thành phần kinh tế, phát triển và nâng cao chất lượng sản phẩm và dịch vụ ngân hàng, nâng cao hiệu quả an toàn hệ thống theo đòi hỏi của cơ chế thị trường và lộ trình hội nhập quốc tế.
Sau hơn mười một năm thành lập đến nay Chi nhánh đã bắt kịp với sự phát triển của thị trường, trụ sở chính đặt trên đường Ngô Gia Tự cùng với 2 điểm giao dịch rất thuận tiện để cung cấp các sản phẩm ngân hàng tới từng người dân.
Về cơ sở vật chất kỹ thuật trang thiết bị, được ngân hàng đã thực hiện xong chương trình hiện đại hóa, đưa phần mềm mới T24 vào sử dụng, đây là chương trình có nhiều tiện ích online trên cả nước rất thuận tiện cho công tác thanh toán trên toàn quốc, chuyển tiền trong nước và quốc tế.
Được sự thành công như hiện nay phải kể đến sự lãnh đạo của Ban giám đốc, cùng đội ngũ cán bộ, nhân viên trong Chi nhánh, với tuổi đời trung bình không quá 26, kinh nghiệm còn thiếu, vừa làm vừa học hỏi bước đầu gặp không ít khó khăn nhưng cả thầy và trò đều cùng nhau nỗ lực vượt qua.