Theo quy định tại Điều 319 Bộ luật thương mại, thời hiệu khởi kiện ỏp dụng đối với cỏc tranh chấp thương mại là hai năm, kể từ thời điểm quyền và lợi ớch hợp phỏp bị xõm phạm, trừ trường hợp trong thời hạn chớn thỏng sau khi bị khiếu nại, thương nhõn kinh doanh dịch vụ logistics khụng nhận được thụng bỏo về việc bị kiện tại Trọng tài hoặc Tũa ỏn trong, kể từ ngày giao hàng.
Tuy nhiờn, trong quy định của Bộ luật hàng hải thỡ cú nhiều thời hiệu khởi kiện đối với từng hoạt động như vận chuyển hàng hoỏ, vận chuyển hành khỏch, thuờ tàu... Đa số cỏc thời hiệu khởi kiện là 2 năm. Tuy nhiờn, Bộ luật Hàng hải cũng quy định một số thời hiệu khởi kiện là 1 năm như thời hiệu khởi kiện về hư hỏng, mất mỏt hàng hoỏ (điều 97), Thời hiệu khởi kiện về việc đũi hoàn trả số tiền quỏ mức quy định (điều 211 khoản 2).
Hiện nay, cả phỏp luật nội dung và phỏp luật tố tụng đều quy định về thời hiệu khởi kiện. Khoản 1 Điều 159 BLTTDS quy định “Thời hiệu khởi kiện là thời hạn mà chủ thể được quyền khởi kiện để yờu cầu Tũa ỏn giải quyết vụ ỏn dõn sự bảo vệ quyền và lợi ớch hợp phỏp bị xõm phạm; nếu thời hạn đú kết thỳc thỡ mất quyền khởi kiện, trừ trường hợp phỏp luật cú quy định khỏc”. Như vậy, trong trường hợp phỏp luật nội dung cú quy định về thời hiệu khởi kiện thỡ sẽ ỏp dụng thời hiệu khởi kiện trong luật nội dung. Vớ dụ cụng ty vận chuyển nước ngoài A trong quỏ trỡnh vận chuyển hàng húa từ Singapore về Việt Nam làm hư hỏng hàng húa của doanh nghiệp B, sau 15 thỏng khụng thỏa thuận được về số tiền bồi thường, doanh nghiệp B khởi kiện ra Tũa ỏn thỡ theo Điều 97, Bộ luật Hàng hải, thời gian khởi kiện đó quỏ 1 năm của thời hiệu khởi kiện nờn Tũa ỏn khụng thụ lý giải quyết, mặc dự theo quy định của BLTTDS thỡ thời hiệu khởi kiện là 2 năm.
Với cỏc quy định và thực tế xột xử tranh chấp thương mại của Việt Nam hiện nay, thường cỏc bờn khụng mong muốn đưa tranh chấp ra giải quyết bằng Tũa ỏn vỡ chi phớ giải quyết tranh chấp tốn kộm, thủ tục giải quyết phức tạp, kộo dài, gõy phiền hà cho doanh nghiệp. Dẫn đến rất nhiều vụ tranh chấp đến khi khụng cũn giải phỏp nào “đành phải” khởi kiện ra Tũa ỏn thỡ thời hiệu đó hết. Cỏc doanh nghiệp phải chịu thiệt hại trong kinh doanh.
WTO khụng quy định thời hạn khiếu nại, thời hiệu khiếu kiện. Việc khiếu kiện tựy thuộc vào sự cõn nhắc của bờn khiếu kiện xem liệu việc khiếu kiện cú đạt kết quả hay khụng. Trong tranh chấp thương mại cú nhiều biện phỏp để giải quyết, việc đưa ra giải quyết tranh chấp tại WTO nhằm đạt được một giải phỏp tớch cực cho cỏc bờn. Nếu cỏc bờn khụng nhất trớ về một giải phỏp thỡ WTO cũng phải bảo
đảm cỏc bờn rỳt lại những biện phỏp được cho là khụng phự hợp với cỏc Hiệp định của WTO. Rừ ràng là, nếu vụ tranh chấp càng để lõu thỡ việc giải quyết sẽ càng khú khăn. Do đú, giả sử khụng cú quy định về thời hạn khiếu nại, thời hiệu khởi kiện thỡ cỏc bờn cũng luụn mong muốn tỡm được giải phỏp giải quyết tranh chấp nhanh nhất mà biện phỏp cuối cựng là khởi kiện ra Tũa ỏn hay WTO.