Những nhân tố bên ngoài hay bên trong cơ thể tác ựộng vào hệ thống nội cảm thụ của ruột, sẽ làm trở ngại tới cơ năng vận ựộng và tiết dịch của ruột tạo ựiều kiện thuận lợi cho những hệ vi sinh vật ựường ruột phát triển, làm tăng cường quá trình lên men và thối rữa trong ruột. Loại vi khuẩn lên men chất bột ựường sinh ra nhiều axit hữu cơ như axit acetic, axit cetoacetic, axit butyric, axit propionic,Ầ và hơi như CH4, CO2, H2,Ầ; loại vi khuẩn phân giải protit sinh ra Indol, scatol, crecol, phenol, H2S, NH3,Ầ và các
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦẦ 28 aminoacid,Ầ Từ sự lên men và thối rữa ựó làm thay ựổi ựộ pH ở trong ruột gây trở ngại về tiêu hóa và hấp thu ở trong ruột.
Trong quá trình phát bệnh những kắch thắch lý hóa trên sẽ gây nên viêm, niêm mạc ruột xung huyết, thoái hóa, cơ năng tiết dịch vị tăng, ựồng thời cộng với dịch thẩm xuất tiết ra trong quá trình viêm làm cho nhu ựộng ruột tăng, con vật sinh tiêu chảy. Do tiêu chảy, con vật rơi vào tình trạng mất nước, máu ựặc lại gây hiện tượng toan huyết và mất chất ựiện giải.
Những chất phân giải trong quá trình lên men ở ruột ngấm vào máu gây nhiễm ựộc, những hơi sản sinh ra trong ruột kắch thắch làm ruột tăng nhu ựộng gây ựau bụng.
Do viêm lâu ngày làm cho ruột thay ựổi về kết cấu: Vách ruột mỏng ra, tuyến ruột bị teo, lớp tế bào thượng bì thoái hóa, tổ chức liên kết tăng sinh, trên mặt niêm mạc ruột bị loét hay thành sẹo, có những vết sạm hay ựỏ nâu. Ruột thường giảm nhu ựộng sinh táo bón. Thức ăn trong ruột tắch lại sẽ lên men kắch thắch vào niêm mạc ruột lại gây tiêu chảy. Vì vậy, con vật bệnh có hiện tượng tiêu chảy xen lẫn táo bón kéo dài có tắnh chu kỳ.