Thuận lợi:
Với địa hình tương đối bằng phẳng, đất đai màu mỡ và không có đồi núi, cộng thêm nguồn cung cấp nước dồi dào của sông Hồng, có thể nói huyện Khoái Châu có đầy đủ những nhân tố để phát triển bền vững về nông nghiệp. Hệ thống kênh mương trên địa bàn đã được xây dựng tương đối hoàn thiện kèm theo sự cung ứng, điều tiết nước trực tiếp từ hệ thống sông Bắc Hưng Hải tạo điều kiện vô cùng thuận lợi cho việc điều tiết nước theo điều kiện thời tiết cũng như mùa vụ.
Nằm trong vùng chịu ảnh hưởng trực tiếp của khí hậu nhiệt đới gió mùa, việc phân chia mùa mưa, mùa khô rõ rệt và mang tính quy luật nhờ đó công tác tưới tiêu cũng như công tác duy tu sửa chữa công trình được chuẩn bị một cách kỹ lưỡng.
Khó khăn:
Bên cạnh những thuận lợi do thiên nhiên ban tặng thì công tác thuỷ lợi của huyện cũng gặp không ít khó khăn vấp phải:
- Khoái Châu có hệ thống kênh mương chằng chịt, tưới tiêu xen kẽ và rất phức tạp, có những công trình phục vụ cho nhiều xã, nhiều loại cây trồng nên rất khó khăn cho công tác quản lý và điều hành. Bên cạnh đó, hiện nay các công trình thủy lợi trên địa bàn Huyện nhiều công trình đã và đang xuống cấp nghiêm trọng cần phải được đầu tư nâng cấp.
- Trình độ quản lý công trình của cán bộ trạm thuỷ nông Huyện cũng như cán bộ xã và HTXDVNN còn nhiều hạn chế và bất cập, chưa có sự chuyên sâu về chuyên môn cũng như được huấn luyện xử lý trong những tình huống khẩn cấp.
- Chưa huy động tối đa sự tham gia quản lý và bảo vệ các công trình thủy lợi của cộng đồng hưởng lợi địa phương, người dân chưa có ý thức trong việc bảo vệ các công trình thủy lợi, ý thức người dân kém nên thường xuyên và liên tục xảy ra các vụ vứt rác thải gây ách tắc dòng chảy cũng như các vụ lấn chiếm hành lang của các công trình thủy lợi.