2.2.2.1. Bộ rễ
- Bộ rễ cây cà phê bao gồm rễ cọc, rễ chính, rễ phụ và rễ tơ. Trong năm đầu các rễ này đều phát triển và đạt tới độ sâu 25-30cm, trong năm thứ hai các loại rễ này tiếp tục phát triển
và đạt tới độ sâu 30-40cm, năm thứ ba rễ cọc đã ăn sâu tới 50-60cm. Các rễ làm nhiệm vụ hút nước, dinh dưỡng. Cà phê kinh doanh bộ rễ có thể hút nước ở độ sâu 3,5m.
- Rễ tơ nằm ở lớp đất mặt từ 0-20cm. Nhiệm vụ chính của nó là hút nước và các chất dinh dưỡng khoáng.
2.2.2.2. Thân, cành
* Thân chính
Thân chính của cây cà phê có nhiều đốt thân, trên mỗi đốt có một cặp lá. Trên mỗi nách lá có nhiều chồi ngủ. Một chồi trên cùng phát triển thành cành cơ bản, tất cả cành phía dưới phát triển thành chồi vượt.
* Cành ngang
Cành ngang cơ bản mọc ra từ hai phía của thân chính, trên cành ngang hình thành các đốt cành (đốt và lóng đốt). Ở mỗi đốt cành có 2 lá đối xứng. Tại mỗi nách lá có 5 chồi. Và trên mỗi chồi hình thành 4 nụ hoa và sẽ cho 4 quả sau này. Trong năm đầu tiên cành phát triển và hình thành các cặp lá. Trong năm thứ hai trên những đốt đã có lá sẽ cho quả và cành cứ tiếp tục sinh trưởng để hình thành những đốt mới (đốt dự trữ).
2.2.2.3. Hoa, quả, hạt
- Hoa cà phê màu trắng, có năm cánh, thường nở thành chùm đôi hoặc chùm ba. Màu hoa và hương hoa dễ làm ta liên tưởng tới hoa nhài. Hoa chỉ nở trong vòng 3 đến 4 ngày và thời gian thụ phấn chỉ vài ba tiếng. Một cây cà phê trưởng thành có từ 30.000 đến 40.000 bông hoa..
- Thông thường một quả cà phê chứa hai hạt. Mỗi hạt còn được bảo vệ bởi hai lớp màng mỏng: một lớp màu trắng, bám chặt lấy vỏ hạt; một lớp màu vàng rời rạc hơn bọc ở bên ngoài. Hạt có thể có hình tròn hoặc dài, lúc còn tươi có màu xám vàng, xám xanh hoặc xanh.