Vị trớ, cấu trỳc, chức năng của gen H-FABP

Một phần của tài liệu nghiên cứu khả năng sản xuất, chất lượng thịt và phân tích đa hình gen di truyền của gen h-fabp bằng phương pháp pcr-rflp trên đàn lợn mẹo nuôi tại huyện pác nặm - tỉnh bắc kạn (Trang 36 - 39)

3. í nghĩa của đề tài

1.1.7.4.1.Vị trớ, cấu trỳc, chức năng của gen H-FABP

Gen H-FABP là gen mó hoỏ cho protein gắn acid bộo ở cơ, nằm trờn

nhiễm sắc thể số 6 ở lợn, tại vị trớ 6q21 → 6q26 [40], tƣơng ứng vị trớ gen H- FABP ở ngƣời là 1p32→1p33, ở chuột nằm trờn nhiễm sắc thể số 4. Đú là vựng cú tớnh bảo thủ cao trong quỏ trỡnh tiến hoỏ. Khi tiến hành nghiờn cứu bản đồ liờn kết của 7 microsatellites trờn nhiễm sắc thể số 6, Ovilo đó xỏc định đƣợc gen H-FABP nằm trong khoảng giữa marker SW316 và SO228 (SW316 - 3,4cM - H-FABP - 12,5cM - SO228)[52,53].

Hỡnh 1.2. Vị trớ gen mó hoỏ H-FABP trờn nhiễm sắc thể số 6 ở lợn

Cấu trỳc gen H-FABP gồm: 4 exon mó hoỏ lần lƣợt cho cỏc đoạn polipeptide gồm 24, 58, 34, 17 acid amine và 3 intron cú kớch thƣớc khoảng 4,2; 2,5; 1,5 kb [40].

Phõn tớch trỡnh tự vựng điều khiển 5' của gen H-FABP chứa cỏc TATA-Box nằm phớa trƣớc mó khởi đầu (ATG) 92 bp và cú chứa nhiều vị trớ liờn kết tiềm năng tƣơng ứng với cỏc yếu tố phiờn mó khỏc nhau, cỏc thụ thể của cỏc hormone.

Bảng 1.1: Vị trớ của cỏc yếu tố phiờn mó bỏm trờn vựng phớa trƣớc đầu 5' của gen mó hoỏ H-FABP

Yếu tố Trỡnh tự tƣơng ứng Vị trớ

Yếu tố hoạt hoỏ Protein 1 (AP-1) STGACTMA -875 Yếu tố hoạt hoỏ protein 2 (AP-2) CCSCRGGC -408

Yếu tố hoạt hoỏ protein 3 (AP-3) TGTGWWW -1545,-714

CCAAT-EBP (C/EBP) TKNNGYAAK

-1608, -1504, -1072, -665, - 628 E-Box CANNTG -1539, -1328, -1308, -1111, -768, -110

Growth Hormone (GH-cse 2) AATAAAT -1441

Glucocorticoids (GRE) TGTTCT -1000

Krox-24 GCGSGGGCG -134

Yếu tố hoạt hoỏ tuyến vỳ (MAF) GRRGSAAGK -1134

Sat-5 TTCNNNGAA -1178

Những yếu tố này phự hợp với những bỏo cỏo về sự biểu hiện đặc hiệu

cỏc H-FABP. E-Box cú chức năng điều khiển biểu hiện cỏc H-FABP đặc hiệu

trong tế bào cơ xƣơng nhờ sự liờn kết với họ protein MYOD của cơ. Cơ chế chung điều khiển H-FABP cú thể giải thớch bằng sự cú mặt của cỏc vị trớ liờn kết tiềm năng tƣơng ứng nhƣ yếu tố hoạt hoỏ protein (activator protein - AP 1, 2, 3), Krox 24 và cỏc yếu tố đỏp ứng glucocorticoids. Một đoạn 13 nucleotide (CTTCCT[A/C]TTTCGG) tỡm thấy ở vị trớ nucleotide - 250 ở lợn là một nhõn tố mới trong điều khiển phiờn mó khi so sỏnh với trỡnh tự trờn genbank/EMBL. Yếu tố liờn kết tiềm năng Stat - 5 giải thớch cho sự phụ thuộc của quỏ trỡnh tiết sữa với sự biểu hiện của gen H-FABP. Vị trớ liờn kết Stat - 5 cũng đƣợc phỏt hiện trong cỏc promotor của cỏc gen mó hoỏ protein sữa.

Chức năng của gen H-FABP

Gen H-FABP là gen mó hoỏ cho một protein H-FABP liờn kết acid bộo

ở cơ, cú kớch thƣớc là 15 kDa. H-FABP là một thành viờn thuộc nhúm protein liờn kết lipid nằm trong tế bào, chỳng bao gồm 9 loại F-ABP khỏc nhau nằm ở cỏc mụ đặc hiệu khỏc nhau của cơ thể. Đú là A-FABP nằm ở mụ mỡ, B-FABP

ở cỏc tế bào thần kinh của nóo, E-FABP ở biểu bỡ, H-FABP ở tế bào cơ, I- FABP ở ruột, IL- FABP ở hồi tràng, L-FABP ở gan, M-FABP ở myelin và T- FABP nằm ở tinh hoàn [36].

Hỡnh 1.3: Trỡnh tự aminoacid của cỏc loại F-ABP

H- FABP thƣờng cú mặt ở cỏc mụ cú nhu cầu cao vờ cỏc acid bộo là mụ

cơ hay cỏc mụ cơ tim, mụ cơ xƣơng và tuyến sữa. Nguồn gốc của chất ức chế sinh trƣởng trong vỳ là một protein ức chế sự phỏt triển của cỏc tế bào u, thực chất là hỗn hợp của H-FABP và một loại A-FABP.

H-FABP là cỏc protein nhỏ nội bào liờn kết với cỏc acid bộo để vận chuyển cỏc acid bộo này qua màng tế bào chất đến vị trớ β-oxy hoỏ cỏc acid bộo để cung cấp năng lƣợng hoặc tổng hợp triacylglycerol (TAG) hay phospholipid [66]. Hơn thế nữa, H-FABP cú thể điều chỉnh hàm lƣợng acid bộo trong cơ và thụng qua con đƣờng này chỳng điều khiển quỏ trỡnh tổng hợp lipid. H-FABPA-FABP đƣợc coi là hai ứng cử gen cho tớnh trạng hàm lƣợng mỡ ở lợn.

Hỡnh 1.4: Cơ chế hoạt động của H-FABP trong tế bào

Một phần của tài liệu nghiên cứu khả năng sản xuất, chất lượng thịt và phân tích đa hình gen di truyền của gen h-fabp bằng phương pháp pcr-rflp trên đàn lợn mẹo nuôi tại huyện pác nặm - tỉnh bắc kạn (Trang 36 - 39)