Đặc điểm hình thái của các mẫu nấm thu thập

Một phần của tài liệu Nghiên cứu thành phần loài, tính gây bệnh và khả năng phòng chống nấm colletotrichum spp gây bệnh thán thư ớt tại đồng bằng sông hồng (Trang 182 - 198)

TT Mẫu nấm

Địa điểm thu thập

Hình thái

Bào tử phân sinh Đĩa áp Nhóm

hình thái Hình dạng Kích thước

(dài x rộng, àm) Màu sắc, hỡnh dạng Kớch thước (àm) 1 C1 Trâu Quỳ, Gia Lâm,

Hà Nội

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,6 ± 0,8 × 4,9 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,2 ± 1,3 × 6,1 ± 0,7 I 2 C2 Trâu Quỳ, Gia Lâm,

Hà Nội

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,8 ± 1,1 × 5,0 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,1 ± 0,8 × 5,6 ± 0,4 I 3 C3 Quỳnh Hội, Quỳnh

Phụ, Thái Bình

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,2 ± 0,6 × 4,7 ± 0,3 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,8 ± 0,9 × 5,9 ± 0,8 I 4 C4 Quỳnh Hội, Quỳnh

Phụ, Thái Bình

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,9 ± 1,2 × 3,9 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

6,7 ± 0,7 × 5,7 ± 0,6 I 5 C5 Hoàn Long, Yên

Mỹ, Hưng Yên

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,2 ± 0,7 × 4,3 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,5 ± 0,8 × 6,0 ± 0,7 I 6 C6 Dạ Trạch, Khoái

Châu, Hưng Yên

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,7 ± 1,3 × 3,9 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

6,7 ± 0,8 × 5,1 ± 1,5 I 7 C7 Đông Tảo, Khoái

Châu, Hưng Yên

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,4 ± 0,8 × 4,1 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,8 ± 1,1 × 5,8 ± 0,9 I 8 C8 Tiền Phong, Ân Thi,

Hưng Yên

Lưỡi liềm 20,5 ± 1,2 × 3,9 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,8 ± 0,9 × 5,1 ± 0,5 III 9 C9 An Bình, Lương

Tài, Bắc Ninh

Trụ, hai đầu tù tới tròn

12,0 ± 0,9 × 3,9 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

9,5 ± 1,3 × 5,2 ± 0,5 I 10 C10 An Bình, Lương Trụ, hai đầu 11,2 ± 0,7 × 4,6 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới 8,5 ± 1,1 × 5,8 ± 0,6 I

165

TT Mẫu nấm

Địa điểm thu thập

Hình thái

Bào tử phân sinh Đĩa áp Nhóm

hình thái Hình dạng Kích thước

(dài x rộng, àm) Màu sắc, hỡnh dạng Kớch thước (àm) 11 C11 Trung Kênh, Lương

Tài, Bắc Ninh

Trụ, hai đầu tù tới tròn

12,5 ± 0,8 × 4,7 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,3 ± 1,1 × 5,1 ± 0,8 I 12 C12 Trung Kênh, Lương

Tài, Bắc Ninh

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,1 ± 1,2 × 5,1 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,7 ± 1,2 × 6,1 ± 0,7 I 13 C13 Trấn Dương, Vĩnh

Bảo, Hải Phòng

Lưỡi liềm 21,2 ± 1,4 × 3,5 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

9,3 ± 1,1 × 5,7 ± 0,6 III 14 C14 Trấn Dương, Vĩnh

Bảo, Hải Phòng

Trụ, hai đầu tù tới tròn

12,5 ± 0,8 × 4,4 ± 0,3 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,8 ± 1,3 x 6,0 ± 0,9 I 15 C15 Trấn Dương, Vĩnh

Bảo, Hải Phòng

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,3 ± 1,2 × 3,6 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,8 ± 1,1 × 4,5 ± 0,7 I 16 C16 Trấn Dương, Vĩnh

Bảo, Hải Phòng

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,3 ± 1,1 × 4,1 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,2 ± 0,8 × 5,1 ± 0,4 I 17 C17 Trấn Dương, Vĩnh

Bảo, Hải Phòng

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,6 ± 1,3 ×4,4 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,9 ± 1,1 × 5,3 ± 0,6 I 18 C18 Trấn Dương, Vĩnh

Bảo, Hải Phòng

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,9 ± 1,2 × 4,2 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,1 ± 1,2 × 5,4 ± 0,6 I 19 C19 Quỳnh Hải, Quỳnh

Phụ, Thái Bình

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,2 ± 1,3 × 4,5 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,9 ± 1,1 × 5,0 ± 0,3 I 20 C20 Quỳnh Hải, Quỳnh

Phụ, Thái Bình

Lưỡi liềm 21,3 ± 1,4 × 3,7 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,6 ± 1,1 × 5,3 ± 0,6 III 21 C22 Nhân Hưng, Lý Trụ, hai đầu 11,6 ± 1,2 × 4,3 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới 7,7 ± 1,1 × 5,1 ± 0,5 I

166

TT Mẫu nấm

Địa điểm thu thập

Hình thái

Bào tử phân sinh Đĩa áp Nhóm

hình thái Hình dạng Kích thước

(dài x rộng, àm) Màu sắc, hỡnh dạng Kớch thước (àm) 22 C23 Nhân Hưng, Lý

Nhân, Hà Nam

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,1 ± 1,0 × 4,5 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,4 ± 0,9 × 4,8 ± 0,4 I 23 C24 Dạ Trạch, Khoái

Châu, Hưng Yên

Trụ, hai đầu tù tới tròn

12,6 ± 0,9 × 3,8 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,8 ± 1,2 × 4,9 ± 0,4 I 24 C25 Văn Đức, Gia Lâm,

Hà Nội

Lưỡi liềm 21,5 ± 1,2 ×3,5 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

11,7 ± 1,4 × 6,3 ± 1,0

III 25 C26 Hoàn Long, Yên

Mỹ, Hưng Yên

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,0 ± 1,1 × 4,3 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,3 ± 1,0 × 4,8 ± 0,8 I 26 C27 Nhân Hưng, Lý

Nhân, Hà Nam

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,6 ± 1,2 × 4,7 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,6 ± 1,1 × 5,1 ± 0,7 I 27 C28 Thanh Ninh, Phú

Bình, Thái Nguyên

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,7 ± 0,9 × 4,5 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,3 ± 1,2 × 4,7 ± 0,5 I 28 C29 Thanh Ninh, Phú

Bình, Thái Nguyên

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,9 ± 1,1 × 4,6 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số chẻ thùy

9,7 ± 1,4 × 5,7 ± 0,6 II 29 C30 Vân Nội, Đông

Anh, Hà Nội

Lưỡi liềm 21,9 ± 1,0 × 3,7 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,1 ± 1,3 × 5,3 ± 0,7 III 30 C31 Nhân Hưng, Lý

Nhân, Hà Nam

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,7 ± 1,1 × 4,1 ± 0,7 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

6,9 ± 0,8 × 5,2 ± 0,5 I 31 C32 Thị trấn Nông

trường, Mộc Châu, Sơn La

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,8 ± 1,3 × 4,7 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,0 ± 1,2 × 5,8 ± 0,6 I

167

TT Mẫu nấm

Địa điểm thu thập

Hình thái

Bào tử phân sinh Đĩa áp Nhóm

hình thái Hình dạng Kích thước

(dài x rộng, àm) Màu sắc, hỡnh dạng Kớch thước (àm) 32 C33 Đông Sang, Mộc

Châu, Sơn La

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,9 ± 1,0 × 4,5 ± 0,7 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,2 ± 1,0 × 5,3 ± 0,6 I 33 C34 Đông Sang, Mộc

Châu, Sơn La

Trụ, hai đầu tù tới tròn

12,2 ± 1,1 × 4,7 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,6 ± 0,9 × 6,2 ± 0,5 I 34 C35 Long Thành, Long

Định, Tiền Giang

Lưỡi liềm 22,4 ± 1,4 × 3,9 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,3 ± 1,2 × 5,2 ± 0,6 III 35 C36 Long Thành, Long

Định, Tiền Giang

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,5 ± 1,1 × 4,8 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,6 ± 1,2 × 4,9 ± 0,7 I 36 C37 Nhân Hưng, Lý

Nhân, Hà Nam

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,8 ± 0,9 × 4,6 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,8 ± 1,3 × 5,4 ± 0,5 I 37 C38 Mỹ Tiến, Mỹ Lộc,

Nam Định

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,4 ± 1,1 × 4,8 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,4 ± 1,1 × 5,1 ± 0,6 I 38 C39 Mỹ Tân, Mỹ Lộc,

Nam Định

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,4 ± 1,2 × 3,8 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,6 ± 1,1 × 5,3 ± 0,4 I 39 C40 Hợp Đức, Tân Yên,

Bắc Giang

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,7 ± 1,1 × 4,9 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,8 ± 1,2 × 4,8 ± 0,4 I 40 C41 Hợp Đức, Tân Yên,

Bắc Giang

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,2 ± 1,1 × 4,7 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,7 ± 0,9 × 4,6 ± 0,5 I 41 C42 Song Vân, Tân Yên,

Bắc Giang

Trụ, hai đầu tù tới tròn

12,6 ± 1,2 × 3,6 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,0 ± 0,6 × 4,7 ± 0,6 I 42 C43 Song Vân, Tân Yên,

Bắc Giang

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,9 ± 1,1 × 4,1 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,7 ± 1,1 × 5,6 ± 0,7 I

168

TT Mẫu nấm

Địa điểm thu thập

Hình thái

Bào tử phân sinh Đĩa áp Nhóm

hình thái Hình dạng Kích thước

(dài x rộng, àm) Màu sắc, hỡnh dạng Kớch thước (àm) 43 C44 Cổ Bi, Gia Lâm, Hà

Nội

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,0 ± 1,1 × 3,4 ± 0,2 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,3 ± 1,0 × 4,8 ± 0,8 I 44 C45 Cổ Bi, Gia Lâm, Hà

Nội

Trụ, hai đầu tù tới tròn

12,3 ± 1,3 × 3,6 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

6,6 ± 0,6 × 5,4 ± 1,3 I 45 C46 Khánh Vân, Yên

Khánh, Ninh Bình

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,9 ± 1,2 × 3,9 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,1 ± 0,9 × 5,1 ± 0,8 I 46 C47 Khánh Vân, Yên

Khánh, Ninh Bình

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,2 ± 1,1 × 4,6 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,9 ± 1,2 × 5,6 ± 0,5 I 47 C48 Văn Đức, Gia Lâm,

Hà Nội

Lưỡi liềm 22,4 ± 1,2 × 3,6 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

11,7 ± 2,2 × 6,3 ± 1,0

III 48 C50 Việt Hồng, Thanh

Hà, Hải Dương

Trụ, hai đầu tù tới tròn

10,8 ± 0,8 × 4,8 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,3 ± 1,1 × 5,8 ± 0,6 I 49 C51 Thanh Hải, Thanh

Hà, Hải Dương

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,3 ± 1,2 × 4,5 ± 0,4 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,9 ± 0,8 × 5,5 ± 0,7 I 50 C52 Kim Tân, Kim

Thành, Hải Dương

Trụ, hai đầu tù tới tròn

11,9 ± 1,1 × 4,1 ± 0,6 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

7,4 ± 0,6 × 5,7 ± 0,5 I 51 C53 Kim Tân, Kim

Thành, Hải Dương

Lưỡi liềm 21,7 ± 1,2 × 4,1 ± 0,3 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

9,7 ± 0,8 × 5,6 ± 0,4 III 52 C54 Hoàng Hanh, Ninh

Giang, Hải Dương

Trụ, hai đầu tù tới tròn

12,1 ± 1,3 × 4,4 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, một số có hình dạng không đều

8,1 ± 1,2 × 5,1 ± 0,7 I

169

PHỤ LỤC 2. HÌNH ẢNH CÁC SẢN PHẨM PCR 1. Sản phẩm PCR 10 mẫu nấm Colletotrichum bằng cặp mồi ITS

2. Sản phẩm PCR 9 mẫu nấm Colletotrichum bằng cặp mồi ApMat

3. Sản phẩm PCR tối ưu phương pháp chiết DNA các mẫu nấm Colletotrichum

3. Sản phẩm PCR tối ưu nhiệt độ gắn mồi cho 4 cặp mồi tự thiết kế phục vụ chẩn đoán các loài nấm Colletotrichum

4. Sản phẩm PCR xác định thành phần loài Colletotrichum bằng các cặp mồi đặc hiệu tự thiết kế

PHỤ LỤC 3. TRÌNH TỰĐOẠN ĐỌC ĐƯỢC CỦA CÁC MẪU NẤM 1. Giải trình tự vùng gen ITS 10 mẫu nấm

 C1-17B4ZAB008 - (548 nts)

TTGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTGACCT

 C4-17B4ZAB009 - (529 nts)

AAAAAAAAACAACAAACAACAAGACCAAATGGAAGTAAAAGTCGTAACAA GGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGATCATTACTGAGTTTACGCTATACA ACCCTTTGTGGACATACCTATAACTGTTGCTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGTG ACCCTCCCGGCCTCCCGCCCCCGGGCGGGTCGGCGCCCGCCGGAGGATAAC CAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGAGTGGTACAAGCAAATAATCAAA ACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAA ATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGA ACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCAT TTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACACGCTGATGTAGGCC CTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTAC GTCTCGCACTGGGA

 C6-17B4ZAB010 - (548 nts)

TTGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTGACCT

 C9-17B4ZAB011 - (547 nts)

TTGGAAGTAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGTGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCAATTTCCAAAGGTGACCT

 C14-17B4ZAB012 (549)

TTGGAAGTAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTGACCTC

 C25-17B4ZAB013 - (556 nts)

TTGGAAGGTAAAAAGTGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGA TCATTACTGAGTTACCGCTCATCAACCCTTTGTGAACATACCTTAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGCGTCCCCTGAAAAGGACGTCTCCCGGCCCTCTCCCGTC CGCGGGTGGGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTT TCTTCTGAGTGACACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTG GTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTG CAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCAT TCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGG TGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCT CGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGA CTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTGACCTC

 C26-17B4ZAB014 - (560 nts)

TTGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTACAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTA

 C29-17B4ZAB015 - (563 nts)

TTTGGAAGTAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGA TCATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTGACCTCGGATCAGGTAGAT

 C30-17B4ZAB016 - (556 nts)

TTGGAAGTAAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGA TCATTACTGAGTTACCGCTCATCAACCCTTTGTGAACATACCTTAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGCGTCCCCTAAAAAGGACGTCTCCCGGCCCTCTCCCGTC CGCGGGTGGGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTT TCTTCTGAGTGACACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTG GTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTG CAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCAT TCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGG TGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCT CGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGA CTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTGACCTC

 C33-17B4ZAB017 - (551 nts)

TTTGGAAGTAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGA TCATTACTGAGTTTACGCTCTACAACCCTTTGTGGACATACCTATAACTGTT GCTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGTGACCCTCCCGGCCTCCCGCCCCCGGGCGG GTCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTG AGTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGG CATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATT CAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCG GGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGG GCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGC CTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTG CCGTAAAACCCCCAATTTCCAAAGGTGACCTCGG

2. Giải trình tự vùng gen ApMat

 C1-19D5ZAA000/19D5ZAA001 - (915 nts)

ACAAGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCTCGCAAG CCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGACCAG CTTAGCAGCGTCGATGAGGTAGAGGCCGCCTCCTACCCGAGAGCGACAAAA CCATCAGCGCGCCCACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTATACC TACCGACTGCGACAAGTCGCTGTAGTATCAGTCATGGAACGGAATAGATAT CGGCGCTGCCAAACGACTTTAGGTCGTCCTTGTGTTCTAGACTGGCAGCATC AGCGACCAGAGGAGCCTCAGAACATGGCGCCTTTGGAGGCTGTCTTCGATC TCTATCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACGCATCTGTTCGTCGATTC ACTTCCCGCATGCTGTGGCAAGAGTTACCTGCGCGAGAAACCAACAGACCT TTGTGCGGCGATACTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGAG GAACCAAGAATCATCCTGGACCATCTGCTTCGATGGCAACGCGAAGCAGAG ATCTTCGATTTGATGAACATATTGGTGCAAAAATGTACTCACAACCCATGTA TTCGCATGTCAAGCGAATACGAATCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCC AGTAAATATCATCTTCATGGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTAGAGTGTC TTTTGGCCCCCGCCGTGAGGACCATTGATTCGCCCACATGTTGCTCTTCGCC ACTGCAGACTGCCAACACCATCCATGATGCCCAGCCACTGTCTCGACTGCGC ATCACGGGAATAACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAA CGTCCCGCACCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGGCTCCC

 C4-19D5ZAA002/19D5ZAA003 – (919 nts)

GCACAAGGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCACGC AAGCCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGGC CAGCTTAGCAGCGTCAATGAGGTAGAGGCCGCCTTCTACCCAAGAGCGACA ACACCATCAGCGCGCCGACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTAT ACCTACCGACTGCGATGAGTCGCTGTAGCATCTGCCACGAAATGGAACTGA TATCGGCGCTGCCAGACGACCTAAGGTTGTCTTTGTGTCCTAGAATGGCAGC ATTAGCGACCAGAGGAGCCTAAGAATGTGGCGCCTTTGGCGGCTGTCTTCG ATCTCCATCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACACATCTGGCCATCG ATTCCCTTCCCGCATGCTGCAGCAAGAGTTACCCTGCGCCAGAAACCAACA GACCTTTGTGCGGCGATACTTAGGCGTACGAATGCAAGGAGATCGCCGGAT CTGAGGAACCAAGAATCATCCTGGCCCATCTGCTTCGCTGGCAACGCGAAC CAGAGATCTTCGATTTAATGAACATATTGGTGGTAAAATGTACTCACAACCC ATGTATTCGCATATTCAGAGCGAACCCGAGTCTTTTTCTGTAATTATAATCT GCAAGCCAGTAAATATTATCTTCATAGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTA AAGTGTCTTTTTCCCCCACCATGGGGACTATTCATTCGCCCATATCATGCTCT TCGCCACTGCGGACTGCCAACACCATCCACGATACACAGCCGCTGTCACGA CTGCGCATCACGGGAGTAACTAGGTCTGATCTTTCTTCCAGTCGCTGCTCCA GATGAACGTCCCGCATCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGACCCC

 C6-19D5ZAA004/19D5ZAA005 – (910 nts)

AGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCTCGCAAGCCGTC TGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGACCAGCTTAG CAGCGTCGATGAGGTAGAGGCCGCCTCCTACCCGAGAGCGACAAAACCATC AGCGCGCCCACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTATACCTACCG ACTGCGACAAGTCGCTGTAGTATCAGTCATGGAACGGAATAGATATCGGCG CTGCCAAACGACTTTAGGTCGTCCTTGTGTTCTCGACTGGCAGCATCAGCGA CCAGAGGAGCCTCAGAACATGGCGCCTTTGGAGGCTGTCTTCGATCTCTATC CAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACGCATCTGTTCGTCGATTCACTTCC CGCATGCTGTGGCAAGAGTTACCTGCGCGAGAAACCAACAGACCTTTGTGC GGCGATACTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGAGGAACCA AGAATCATCCTGGACCATCTGCTTCGATGGCAACGCGAAGCAGAGATCTTC GATTTGATGAACATATTGGTGCAAAAATGTACTCACAACCCATGTATTCGCA TGTCAAGCGAATACGAATCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCCAGTAAA TATCATCTTCATGGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTAGAGTGTCTTTTGG CCCCCGCCGTGAGGACCATTGATTCGCCCACATGTTGCTCTTCGCCACTGCA GACTGCCAACACCATCCATGATGCCCAGCCACTGTCTCGACTGCGCATCACG GGAATAACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAACGTCCC GCACCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGGCTCCC

 C9-19D5ZAA006/19D5ZAA007 - (894 nts)

CACAAGGAGCGCCTCCTGATGATGTACCCCGACTACCGTTACACCCCACGC AAGCCGTCTGAGAAGCGTCATCGAAAGCCCAGTGGCCAAAGCAAGAAGGC CAGCTTAGCAGCGTCGATGAGGTAGAGGTCGTCTCCTACCCGAGAGCGACG ACACCATCAGCGCGCCGACTTGTCAGCTCAAGACGGAGGAGTATGAGTTAC ACCTACCGACTGCGACAAGTCGCTGTAGCATCAGCAACGAATTGGAACCGA TATCGGCGCTGCCAGACCACCTTAGGTTGTCTTTGTGCCCTTGACTGGCAGC ATCAGCGACCAGGGAAGCCTAAGAATATGGCGCCTTTGTGCAGCTGTCTTC GATCTCTATCCAGTCAGCGTGGCCAAGCAGGCACCCATGCATCTGGTCATA GATTCCCTTCTTATATGCTGCGGCAAGAGTTACCCTGCGCCGGAAACCAACA GACCTTTGTGCGGCGATACTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGAT CTGACGAACCAAGAATCATCCTGGCCCATCTGCTTCGATGGCTACGCGAAC CAGAGATCTTCGATTCGATGAACTTATTGGTAGAAAAATGTACTACTACTGT ACTCACAACCCATATATTCGCATGTTCAAAGCGAACACGTACCTTTTTCTGT AATTATAATCTGCAAGCCAGTAAATATCATCTTCATAGACCATCTATTCCAG ACCGATACCTAGAGTGTCATTTCTTTTCCTAGCATAAGAATAATGATCCGCC CATGTGATGCTCTTCGCCACTGTCACGACCGCGCATCACGGGAATACTAGGT CTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAAGGTCCCGCATCTCCACTCC GTCCCCGATTCTTTGACCCC

 C14-19D5ZAA008/19D5ZAA009 - (915 nts)

ACAAGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCTCGCAAG CCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGACCAG CTTAGCAGCGTCGATGAGGTAGAGGCCGCCTCCTACCCGAGAGCGACAAAA CCATCAGCGCGCCCACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTATACC TACCGACTGCGACAAGTCGCTGTAGTATCAGTCATGGAACGGAATAGATAT CGGCGCTGCCAAACGACTTTAGGTCGTCCTTGTGTTCTAGACTGGCAGCATC AGCGACCAGAGGAGCCTCAGAACATGGCGCCTTTGGAGGCTGTCTTCGATC TCTATCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACGCATCTGTTCGTCGATTC ACTTCCCGCATGCTGTGGCAAGAGTTACCTGCGCGAGAAACCAACAGACCT TTGTGCGGCGATACTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGAG GAACCAAGAATCATCCTGGACCATCTGCTTCGATGGCAACGCGAAGCAGAG ATCTTCGATTTGATGAACATATTGGTGCAAAAATGTACTCACAACCCATGTA TTCGCATGTCAAGCGAATACGAATCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCC AGTAAATATCATCTTCATGGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTAGAGTGTC TTTTGGCCCCCGCCGTGAGGACCATTGATTCGCCCACATGTTGCTCTTCGCC ACTGCAGACTGCCAACACCATCCATGATGCCCAGCCACTGTCTCGACTGCGC ATCACGGGAATAACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAA CGTCCCGCACCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGGCTCCC

 C26-19D5ZAA010/19D5ZAA011 - (879 nts)

CTGATGATGTACCCCGACTACCGTTACACCCCACGCAAGCCGTCTGAGAAG CGTCATCGAAAGCCCAGTGGCCAAAGCAAGAAGGCCAGCTTAGCAGCGTCG ATGAGGTAGAGGTCGTCTCCTACCCGAGAGCGACGACACCATCAGCGCGCC GACTTGTCAGCTCAAGACGGAGGAGTATGAGTTACACCTACCGACTGCGAC AAGTCGCTGTAGCATCAGCAACGAATTGGAACCGATATCGGCGCTGCCAGA CCACCTTAGGTTGTCTTTGTGCCCTTGACTGGCAGCATCAGCGACCAGGGAA GCCTAAGAATATGGCGCCTTTGTGCAGCTGTCTTCGATCTCTATCCAGTCAG CGTGGCCAAGCAGGCACCCATGCATCTGGTCATAGATTCCCTTCTTATATGC TGCGGCAAGAGTTACCCTGCGCCGGAAACCAACAGACCTTTGTGCGGCGATA CTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGACGAACCAAGAATCAT CCTGGCCCATCTGCTTCGATGGCTACGCGAACCAGAGATCTTCGATTCGATG AACTTATTGGTAGAAAAATGTACTACTACTGTACTCACAACCCATATATTCGC ATGTTCAAAGCGAACACGTACCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCCAGTA AATATCATCTTCATAGACCATCTATTCCAGACCGATACCTAGAGTGTCATTTC TTTTCCTAGCATAAGAATAATGATCCGCCCATGTGATGCTCTTCGCCACTGTC ACGACCGCGCATCACGGGAATACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTC CAGATGAAGGTCCCGCATCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGACCCC

 C29-19D5ZAA012/19D5ZAA013 (930 nts)

TGCAAGATGCACAAGGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTAC ACCCCACGCAAGCCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGC AAGAAGGCCAGCTTAGCAGCGTCAATGAGGTAGAGGCTGCCTCCTACCCGA GAGCGACAACACCCTCAGCGCGCCGACTTGTCGGGTCCAGACGGAGGAGTA TGAGTACCTACCGACTGCGCCGAGTCGCTGTAGCAACAGCCACGAAACGGA ACCGATATCGGCGCTGCCAGACGACCTCAGGTTGTCTTTGTGTCCTAGACTG GCAGCATCAGCGATCAGATGAGCCTAAGAATGTGGCGCCTTTTGCGGCTGTC TTCGATCTCTACCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACACATCTGGTCA TCGATTCTTTGCCGCATGCTGTAGCAAGAGTTGCCCTGCACCAGAAACCAAC AGACCTTTGTGCGGCGAAACTTAGGCGTGCGAACGCAAGGAGATCGCCGGA TCTGAGGAACCAAGAATCATCCTGGCCCATCTGCTTCGATGGCAACGCGAAC CAGGGATCTTCAATTTGATGAACATGTTGGTGGAAAAATGTACTCACAACCC ATGTATTCGCATGTCAAAGCGAACACGAATCTTTTTCTGTAATTATAATCTGC AAGCCAGTAAATATTATCTTCATGGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTAGA GTGTCTTTTGCCCCCCGCCATGAGGACCATTGATTCGCCCACATGTTGCTCTT CGCCACTGCAGACTGCCAACACCATCCATGATGCCCAGCCACTGTCTCGACT GCGCATCACGGGAATAACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGAT GAACGTCCCGCATCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGACCCCGACTCCC

Một phần của tài liệu Nghiên cứu thành phần loài, tính gây bệnh và khả năng phòng chống nấm colletotrichum spp gây bệnh thán thư ớt tại đồng bằng sông hồng (Trang 182 - 198)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(198 trang)