Bộ VHTT&DL là cơ quan chủ quản cao nhất. Nhà hát CMNVN chịu sự quản quản lý trực tiếp của Bộ VHTT&DL về mọi hoạt động của mình. Cơ chế quản lý Nhà hát CMNVN được thực hiện theo hệ thống quản lý ngành dọc, có sự phân cấp quản lý rõ ràng.
* Bộ VHTT&DL: Là cơ quan trực tiếp quản lý các Nhà hát trực thuộc Bộ trong đó có Nhà hát
CMNVN. Những chủ trương đường lối phát triển về mọi mặt cho Nhà hát như: Biểu diễn nghệ thuật, tài chính, tổ chức cán bộ, đào tạo, đối ngoại, công tác Đảng, Cơng đồn, Đồn thanh niên đều do Bộ VHTT&DL chỉ đạo triển khai thông qua các cục, vụ chức năng và các tổ chức chính trị xã hội trực thuộc Bộ.
* Cục NTBD: Quản lý, định hướng Nhà hát CMNVN về mọi mặt trong công tác biểu diễn nghệ
thuật của Nhà hát như: Thẩm định, kiểm tra, đánh giá về hình thức, nội dung nghệ thuật, nội dung tư tưởng… các chương trình nghệ thuật trước khi cấp phép biểu diễn cho các chương trình. Cục NTBD hướng dẫn Nhà hát CMNVN thực hiện những nghị định, thơng tư của Chính phủ, Bộ VHTT&DL. Cục NTBD ban hành các cơng văn, quy định có liên quan tới hoạt động biểu diễn nghệ thuật của Nhà hát.
Ngoài ra Nhà hát CMNVN còn chịu sự quản lý của các vụ chức năng trực thuộc Bộ VHTT&DL như: Vụ Tổ chức cán bộ; Vụ Kế hoạch Tài chính; Vụ Đào tạo; Vụ Hợp tác quốc tế; Vụ Thi đua khen thưởng hay các tổ chức đoàn thể như: Ban cán sự Đảng, Cơng đồn, Đồn thanh niên của Bộ VHTT&DL về các mặt liên quan khác phục vụ cho hoạt động biểu diễn nghệ thuật của Nhà hát như: Nguồn nhân lực, tài chính, giao lưu hợp tác nước ngồi, thi đua khen thưởng, cơng tác Đảng, Cơng Đồn, Đồn thanh niên.
Nhà hát CMNVN là đơn vị biểu diễn nghệ thuật công lập do nhà nước quản lý do vậy khơng thể thiếu vai trị của tổ chức Đảng trong công tác quản lý, giám sát Nhà hát. Đảng ủy Nhà hát hoạt động dưới sự chỉ đạo của ban cán sự Đảng Bộ VHTT&DL, có nhiệm vụ tổ chức chỉ đạo mọi hoạt động của tổ chức Công đồn, Đồn thanh niên. Đảng uỷ Nhà hát cịn thực hiện việc chỉ đạo, giám sát ban giám đốc Nhà hát thực hiện những đường lối, chủ trương, chính sách của Đảng và Nhà nước trong hoạt động biểu diễn nghệ thuật Ca, Múa, Nhạc của Nhà hát và mọi mặt công tác khác.
Giám đốc Nhà hát Nhà hát CMNVN kiêm bí thư Đảng ủy, vì vậy vai trị lãnh đạo của Đảng và quản lý nhà nước được tập trung thống nhất. Tuy là một người nhưng Giám đốc Nhà hát đại diện thực hiện hai vai trò lãnh đạo để thống nhất định hướng phát triển của Nhà hát nhằm hướng đến sự chặt chẽ, tập trung và đồng thuận cao trong lãnh đạo điều hành.