Chương 4 BÀN LUẬN
4.2.2.2.Về biến đổi thành phần nucleotide và amino acid gen PB1-F
Kết quả so sỏnh và phõn tớch cho thấy, trỡnh tự gen PB1-F2 của 6 biến chủng virus cỳm A/H5N1 nghiờn cứu và 19 chủng virus lựa chọn so sỏnh, đều chứa đầy đủ 273 nucleotide. Tuy nhiờn, một số chủng virus cỳm A/H5N1 cú cỏc đột biến làm thay đổi về số lượng, bờn cạnh cỏc chủng virus cú đột biến làm thay đổi amino acid trong protein PB1-F2 suy diễn.
- Trỡnh tự gen PB1-F2 của biến chủng virus cỳm A/H5N1 nghiờn cứu DkQT801-2011 clade 2.3.2.1, cựng với 2 chủng virus A/VN/UT31244II/2007 clade 2.3.4.3 và A/MDk/VN/OIE/559/2011 clade 1.1, xuất hiện đột biến nucleotide hỡnh thành bộ ba kết thỳc tại cỏc vị trớ thứ 10, 80 và 26, dẫn đến protein PB1-F2 của cỏc chủng virus núi trờn chỉ chứa 9, 79 và 25 amino acid lần lượt theo thứ tự. Protein PB1-F2 là yếu tố độc lực chủ yếu của virus cỳm A núi chung và virus cỳm A/H5N1 núi riờng, đột biến làm thiếu hụt về số lượng amino acid trong protein PB1-F2, cú thể dẫn đến làm mất hoạt tớnh kớch thớch tế bào nhiễm chết theo chương trỡnh (appoptosis) của protein này, qua đú làm giảm độc lực gõy bệnh của virus cỳm A/H5N1 ở cỏc loài vật chủ [5], [9], [32], [36], [37], [38]. Theo cỏc tỏc giả: Chen và cs. (2001, 2009) [9], [53], Roland và cs. (2007) [38], Zell và cs. (2007) [36], hoạt tớnh gõy chết tế bào nhiễm theo chương trỡnh được biểu hiện khi trỡnh tự protein PB1-F2 được mó húa chứa từ 87 – 90 amino acid. Do vậy, protein PB1-F2 của cả 03 chủng virus cỳm A/H5N1 kể trờn, đều khụng biểu hiện hoạt tớnh ở cơ thể nhiễm. Theo Chen và cs. (2001) [26], Zell và cs. (2007) [36], Deluca và cs. (2011) [39], đột biến xuất hiện bộ ba kết thỳc thường gặp sau vị trớ bộ ba mó húa thứ 11 trong trỡnh tự gen PB1-F2, của cỏc chủng virus cỳm A lưu hành gõy bệnh ở cỏc loài vật chủ. Tuy nhiờn, trong nghiờn cứu này của chỳng tụi, đột biến trờn được thấy cả ở vị trớ bộ ba mó húa amino acid thứ 10 trong trỡnh tự gen PB1-F2, của biến chủng virus DkQT801-2011 clade 2.3.2.1. Kết quả này cho thấy, cú sự biến đổi giảm độc lực gõy bệnh ở cỏc chủng virus núi trờn, qua đú làm tăng khả năng tồn tại lõy truyền trong quần thể loài vật chủ tự nhiờn, giỳp virus tớch lũy cỏc biến đổi thớch ứng xõm nhiễm sang loài vật chủ mới. Đõy là mối nguy cơ tiềm ẩn lõu dài của virus cỳm A/H5N1 và virus cỳm A, đối với quần thể người và cỏc loài vật chủ trong tương lai.
- Bờn cạnh đú, cú 10/12 vị trớ sai khỏc nucleotide dẫn tới thay đổi amino acid trong trỡnh tự gen PB1-F2, mó húa protein PB1-F2 chứa đầy đủ 90 amino acid của
22/25 chủng virus so sỏnh trong nghiờn cứu. Cỏc vị trớ thay đổi amino acid trong protein PB1-F2 cú thể làm thay đổi hoạt tớnh của protein này, dẫn tới thay đổi độc lực gõy bệnh của cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 núi trờn.
- Đỏng lưu ý là trỡnh tự protein PB1-F2 của biến chủng virus nghiờn cứu DkQT802-2011 clade 2.3.2.1 và 5 chủng trong nhúm virus clade 1.1 (gồm cả 02 biến chủng virus CkDT382-2008 và DkTG926-2009 nghiờn cứu), cú sự thay đổi amino acid từ arginin thành serin tại vị trớ 66 (N66S) so với trỡnh tự tương ứng của cỏc chủng virus so sỏnh. Đột biến thay đổi amino acid N66S trong protein PB1-F2 là một trong cỏc dấu hiệu biến đổi di truyền, đó được chứng minh cú vai trũ làm tăng hoạt tớnh protein này, qua đú gúp phần gia tăng độc lực gõy bệnh của virus cỳm A/H5N1 ở cơ thể người và cỏc loài động vật cú vỳ [30], [31], [32]. Kết quả trờn cho thấy, xu hướng biến đổi thớch ứng gia tăng độc lực gõy bệnh trong cơ thể người và cỏc loài động vật cú vỳ, ở cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 núi trờn.
- Trong khi đú, 2 biến chủng virus nghiờn cứu: DkNA72-2007 và DkNA114- 2007 cựng với cỏc chủng đại diện trong 2 nhúm virus clade 2.3.4.3 và clade 1, cú sự bảo tồn arginin tại vị trớ 66 (N66) trong protein PB1-F2. Điều này chứng tỏ cỏc chủng trong 2 nhúm virus núi trờn vẫn bảo tồn đặc tớnh độc lực gõy bệnh cao ở gia cầm. Kết quả này phự hợp với kết quả nghiờn cứu đột biến gen PB1 và PB1-F2 ở virus cỳm A/H5N1 clade 1 phõn lập tại Việt Nam giai đoạn 2004 – 2007 của cỏc tỏc giả Wan và cs. (2008) [76], Trần Quang Vui và cs. (2009) [103].
Cỏc kết quả trờn cho thấy, cú sự xuất hiện cả 2 xu hướng đột biến trong trỡnh tự gen PB1-F2, làm giảm độc lực gõy bệnh ở gia cầm và gia tăng độc lực gõy bệnh ở cỏc loài động vật cú vỳ, trong 2 nhúm virus clade 2.3.2.1 và 1.1 so với 2 nhúm virus clade 1 và 2.3.4.3. Điều này gúp phần chứng tỏ khả năng biến đổi phức tạp và diễn biến dịch tễ học khú lường của virus cỳm A/H5N1, đang lưu hành gõy bệnh ở cỏc loài vật chủ hiện nay. Trong đú, sự biến đổi gia tăng độc lực gõy bệnh của virus ở cỏc loài động vật cú vỳ là ưu thế, cần được lưu ý quan tõm nhằm phũng chống dịch cỳm A/H5N1 hiệu quả cho người và gia cầm trong tương lai.