Chương 3 KẾT QUẢ NGHIấN CỨU
3.1.1. Kết quả tỏch chiết RNA tổng số và chuyển đổi cDNA hệ gen virus
Sỏu mẫu RNA tổng số chứa RNA hệ gen virus của 6 biến chủng virus cỳm A/H5N1 trong nghiờn cứu, được tỏch chiết từ cỏc mẫu bệnh phẩm tương ứng và chuyển đổi thành cDNA. Cỏc mẫu cDNA hệ gen của 6 biến chủng virus núi trờn được kiểm tra bằng phản ứng PCR, với cặp mồi H5F1 – H5R1 thu nhận một phần gen HA(H5). Sản phẩm sau cỏc phản ứng PCR núi trờn được điện di kiểm tra trờn thạch agarose 1% và trỡnh bày ở hỡnh 3.1.
Hỡnh 3.1. Kết quả điện di kiểm tra DNA một phần gen HA(H5) với cặp mồi H5F1 – H5R1 của 6 biến chủng virus cỳm A/H5N1 trong nghiờn cứu
Ghi chỳ: (A): DNA một phần gen H5 của 4 biến chủng virus DkNA72-2007, DkNA114-2007, CkDT382-
2008 và DkTG926-2009 (M: Marker Lambda HindIII (λ HindIII); 1: DkNA72-2007; 2: DkNA114-2007; 3:
CkDT382-2008; 4: DkTG926-2009). (B): DNA một phần gen H5 của 2 biến chủng virus DkQT801-2011 và
DkQT802-2011 (1: DkQT801-2011 và 2: DkQT802-2011).
Kết quả trong hỡnh 3.1 cho thấy, ở 4 mẫu kiểm tra cDNA hệ gen của cỏc biến chủng virus DkNA72-2007, DkNA114-2007, CkDT382-2008 và DkTG926-2009 (Hỡnh 3.1A), cựng với 2 mẫu của cỏc biến chủng virus DkQT801-2011 và DkQT802-2011 (Hỡnh 3.1B), đều cho 1 băng sỏng biểu hiện sản phẩm DNA. Cỏc sản phẩm DNA núi trờn cú độ dài khoảng 0,8 kb đối chiếu với marker λ HindIII, tương ứng với độ dài đoạn DNA một phần gen H5 dự kiến thu nhận, sau phản ứng PCR từ cDNA hệ gen virus với cặp mồi H5F1 – H5R1.
Kết quả trờn chứng tỏ, quỏ trỡnh tỏch chiết RNA tổng số và chuyển đổi RNA hệ gen của 6 biến chủng virus cỳm A/H5N1 trong nghiờn cứu thành cDNA, đó được
thực hiện thành cụng từ cỏc mẫu bệnh phẩm tương ứng. Sản phẩm cDNA hệ gen virus được lưu giữ bảo quản ở nhiệt độ -200C, và sử dụng làm khuụn mẫu cho thu nhận DNA cỏc gen PB2, PB1 và PA với cỏc cặp mồi đặc hiệu bằng PCR.