Đặc điểm dịch tễ virus cỳm A/H5N

Một phần của tài liệu Nghiên cứu sự biến đổi di truyền các gen PB2, PB1 và PA polymerase của virus cúm A/H5N1 đương nhiễm tại Việt Nam (Trang 33)

* Trờn thế giới:

Virus cỳm A/H5N1 thể độc lực cao (highly pathogenic avian influenza A/H5N1, HPAI A/H5N1) thuộc phõn type virus cỳm A/H5N1 trong nhúm virus cỳm A, lần đầu tiờn xõm nhiễm gõy bệnh ở ngỗng nuụi tại Quảng Đụng (Trung Quốc) năm 1996, và gõy ra vụ dịch cỳm chim (bird flu) ở gia cầm tại Hồng Kụng (Trung Quốc) năm 1997 [1], [6], [12].

Kể từ đú đến nay, virus cỳm A/H5N1 liờn tục biến đổi đặc tớnh khỏng nguyờn và độc lực, gõy bựng phỏt dịch cỳm gia cầm A/H5N1 nguy hại tại một số quốc gia chõu Á vào năm 2003, sau đú tiếp tục gõy tỏi bựng phỏt dịch và lan truyền rộng rói tới hơn 60 quốc gia trờn khắp cỏc chõu lục.

Đặc biệt, virus cỳm A/H5N1 cú khả năng xõm nhiễm gõy bệnh cỳm cấp tớnh nặng trờn người với tỉ lệ tử vong cao (khoảng 60%), trong cỏc vụ dịch cỳm gia cầm A/H5N1 xảy ra ở nhiều quốc gia trờn thế giới. Tớnh đến 14/4/2012, đó cú 372 người tử vong trong tổng số 623 người nhiễm virus, ở 15 quốc gia cú dịch cỳm gia cầm A/H5N1 (Bảng 1.4) [3], [6], [12], [65].

Cho đến nay, cú 10 clade khỏng nguyờn H5 từ clade 0 đến clade 9 (Hỡnh 1.9) và 12 genotype tỏi tổ hợp 6 gen khung PB2, PB1, PA, NP, M và NS, gồm cỏc genotype: GD, A, B, C, D, E, X(X0-X7), V, Y, W, Z(Z+) và G (Hỡnh 1.10), của virus cỳm A/H5N1 được phỏt hiện lưu hành gõy bệnh dịch cỳm A/H5N1 ở cỏc quốc gia trờn thế giới [6], [12], [66], [67], [68], [69]. Trong đú:

- Cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 clade 1, 2 và 7 với sự hỡnh thành nhiều nhỏnh clade thuộc 3 genotye tỏi tổ hợp Z, V và G, lưu hành phổ biến gõy bệnh dịch cỳm gia cầm A/H5N1 ở chim hoang dó, gia cầm và xõm nhiễm gõy bệnh làm tử vong ở người từ 2003 đến nay (Hỡnh 1.9 và Hỡnh 1.10).

Bảng 1.4. Số người nhiễm và tử vong do virus cỳm A/H5N1 từ 2003 đến nay (tớnh đến 14/04/2013) [65] Quốc gia 2003 - 2005 2006 - 2008 2009 - 2011 2012 2013 Tổng số N TV N TV N TV N TV N TV N TV Azerbaijan 0 0 8 5 0 0 0 0 0 0 8 5 Bangladesh 0 0 1 0 0 0 3 0 0 0 6 0 Cambodia 4 4 4 3 10 9 3 3 9 8 30 27 China 9 6 22 15 10 6 2 1 2 2 45 30 Djibouti 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 Egypt 0 0 51 23 108 32 10 5 1 1 169 61 Indonesia 20 13 121 102 42 36 8 8 0 0 191 159 Iraq 0 0 3 2 0 0 0 0 0 0 3 2 Lao 0 0 2 2 0 0 0 0 0 0 2 2 Myanmar 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 Nigeria 0 0 2 1 0 0 0 0 0 0 1 1 Pakistan 0 0 3 1 0 0 0 0 0 0 3 1 Thailand 22 14 3 3 0 0 0 0 0 0 25 17 Turkey 0 0 12 4 0 0 0 0 0 0 12 4 Viet Nam 93 42 13 10 12 7 4 2 1 1 124 62 Tổng số 148 79 247 171 183 90 30 19 30 19 623 372

Ghi chỳ: N: Số người nhiễm; TV: Số người tử vong. Cỏc quốc gia (Việt Nam; Indonesia; Ai Cập) cú số người nhiễm và tử vong cao do virus cỳm A/H5N1 được in trờn nền đậm.

Hỡnh 1.9. Cõy phả hệ minh họa sự hỡnh thành và lưu hành xõm nhiễm gõy bệnh ở người của cỏc clade HA(H5) virus cỳm A/H5N1 ở chõu Á từ 2003 – 2011

(http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/201101_h5n1evoconceptualdiagram.pdf)

Ghi chỳ: Cỏc chữ số (0 – 9): tờn cỏc clade HA(H5); Cỏc nhỏnh clade virus cỳm A/H5N1in trờn nền màu

- Gần đõy, cú sự hỡnh thành cỏc biến chủng virus cỳm A/H5N1 clade 1.1 (năm 2007) và clade 2.3.2.1 (năm 2009), thay đổi lớn về đặc tớnh khỏng nguyờn H5 so với cỏc chủng virus lưu hành trước đú, gõy tỏi bựng phỏt dịch cỳm A/H5N1 tại nhiều quốc gia chõu Á và chõu Âu. Đặc biệt, đó cú người nhiễm và tử vong do cỏc biến chủng virus cỳm A/H5N1 mới kể trờn [65], [69], [70].

Hỡnh 1.10. Sơ đồ minh họa tỏi tổ hợp hỡnh thành cỏc genotype Z, G và V của virus cỳm A/H5N1 [73]

Ghi chỳ: Cỏc năm ghi trờn hỡnh là thời gian virus A/H5N1 hỡnh thành và xuất hiện; Cỏc genotype in đậm

màu xanh là cỏc genotype virus cỳm A/H5N1 đang lưu hành gõy bệnh trờn gia cầm và xõm nhiễm trờn người. Cỏc trường hợp người nhiễm và tử vong bởi virus cỳm A/H5N1, được xỏc định là do virus xõm nhiễm trực tiếp thụng qua tiếp xỳc với gia cầm bệnh, chất thải ụ nhiễm hoặc sử dụng cỏc sản phẩm khụng an toàn chứa virus từ gia cầm bệnh. Tuy nhiờn, sự liờn tục biến đổi hỡnh thành cỏc biến chủng virus mới lưu hành lan truyền rộng rói của virus cỳm A/H5N1, gõy tỏi bựng phỏt dịch cỳm A/H5N1 ở chim hoang dó, gia cầm và xõm nhiễm gõy bệnh cỳm nặng làm tử vong ở người, khụng chỉ gõy thiệt hại về kinh tế mà cũn là mối lo ngại cho sức khỏe cộng đồng, được mọi quốc gia quan tõm ngăn chặn [65], [69], [70], [71]. Bờn cạnh đú, sự xuất hiện xõm nhiễm

gõy bệnh cỳm nặng và làm tử vong ở người của chủng virus cỳm mới A/H7N9, tại Trung Quốc từ thỏng 03/2013 đến nay (5/2013), gúp phần làm cho dịch tễ virus cỳm A/H5N1 núi riờng và virus cỳm A núi chung ngày càng trở nờn phức tạp hơn, bởi nguy cơ tỏi tổ hợp giữa cỏc virus kể trờn [72].

* Tại Việt Nam:

Dịch cỳm gia cầm A/H5N1 bựng phỏt và được chớnh thức cụng bố tại Việt Nam vào thỏng 12 năm 2003, sau đú liờn tục gõy tỏi bựng phỏt nhiều vụ dịch tản phỏt hàng năm ở nhiều địa phương trong cả nước [74], [75], [76], [77]. Gần đõy (thỏng 04/2013), dịch cỳm gia cầm A/H5N1 vẫn đang tiếp tục xảy ra và được cụng bố ở cỏc đàn chim yến tại tỉnh Bỡnh Thuận (Thụng tin Bộ Y tế 4/2013, http://www.moh.gov.vn).

Tớnh đến thỏng 04 năm 2013, Việt Nam đó cú 62 người tử vong trong tổng số 125 trường hợp xỏc định nhiễm virus cỳm A/H5N1. Trường hợp gần đõy nhất (thỏng 03/2013) được xỏc định tử vong do nhiễm virus cỳm A/H5N1 là một bệnh nhi tại Đồng Thỏp (Thụng tin Bộ Y tế 4/2013, http://www.moh.gov.vn). Tổ chức y tế thế giới xỏc định Việt Nam là 1 trong cỏc quốc gia cú người nhiễm và tử vong do virus cỳm A/H5N1 cao, và là trung tõm dịch tễ biến đổi của cỳm A/H5N1 cần quan tõm giỏm sỏt [68].

Cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 lưu hành gõy bệnh dịch tại Việt Nam, đều cú nguồn gốc từ virus cỳm A/H5N1 hỡnh thành tại Nam Trung Quốc, do vị trớ địa lớ, tập quỏn di cư của chim di trỳ và trao đổi sản phẩm thương mại từ gia cầm giữa 2 quốc gia. Từ cuối năm 2003 đến nay, đó phỏt hiện 6 clade gen H5, gồm: cỏc clade 0, 1, 2 (2.3.2 và 2.3.4), 3, 5 và 7(7.1), của cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 thuộc 3 genotype Z, G và V, xõm nhập và lưu hành gõy bệnh dịch tại Việt Nam [73], [75], [76], [77], [78], [79], [80]. Trong đú, nhúm virus clade 1 thuộc genotype Z cú sự lưu hành gõy bệnh dịch phổ biến ở gia cầm và xõm nhiễm gõy bệnh trờn người, trong cả nước giai đoạn 2003 – 2005 và sau đú tiếp tục lưu hành ở miền Nam giai đoạn 2005 – 2007. Cựng với nhúm virus clade 2.3.4 thuộc genotype V cú sự biến đổi hỡnh thành clade 2.3.4.3 tại Việt Nam, lưu hành gõy bệnh dịch ở gia cầm và xõm nhiễm gõy bệnh trờn người ở duyờn hải miền Trung và miền Bắc giai đoạn cỏc năm 2007 – 2008, thay thế nhúm virus clade 1 lưu hành trước đú. Cỏc nhúm virus cũn lại chỉ được phỏt hiện gõy bệnh đơn lẻ trong cỏc vụ dịch khụng điển hỡnh ở gia cầm hoặc chim hoang dó [75], [76], [78], [80], [81], [82], [83].

- Hai nhúm virus cỳm A/H5N1 clade 1.1 và 2.3.2.1 cũng đó được phỏt hiện xõm nhập và lần lượt gõy ra nhiều vụ dịch cỳm gia cầm A/H5N1, ở cỏc địa phương khu vực miền Nam và miền Bắc (Việt Nam) trong cỏc năm từ 2008 đến nay. Đặc biệt, nhúm virus cỳm A/H5N1 clade 2.3.2.1 chỉ được phỏt hiện gõy bệnh dịch cỳm A/H5N1 ở gia cầm tại cỏc địa phương duyờn hải miền Trung và miền Bắc (Việt Nam) từ 2010 đến nay. Nhúm virus này cú sự biến đổi khỏc biệt về khỏng nguyờn H5 so với cỏc nhúm virus cỳm A/H5N1 đang lưu hành, làm giảm hiệu quả bảo vệ của cỏc vaccine sử dụng phổ biến và độc lực rất cao ở gia cầm, được dự bỏo cú khả năng gõy tử vong cao cho người nhiễm [68], [84], [85], [86], [87].

Hỡnh 1.11. Cỏc genotype virus cỳm A/H5N1 hỡnh thành ở Việt Nam [76]

Ghi chỳ: Cỏc vạch màu biểu thị nguồn gốc của cỏc phõn đoạn gen trong mỗi genotype virus cỳm A/H5N1.

Cỏc kớ hiệu: HK97-like, F1-like, E319-like, HK821-like, GX4016-like, GX22-like, GX604-like, FJ584-like và chưa rừ nguồn gốc, là cỏc nhúm virus cỳm A/H5N1 cung cấp nguồn gen tỏi tổ hợp. Cỏc kớ hiệu: VN1 – VN9: cỏc genotype virus cỳm A/H5N1 hỡnh thành tại Việt Nam theo cỏc mốc thời gian.

- Bờn cạnh đú, virus cỳm A/H5N1 lưu hành gõy bệnh dịch tại Việt Nam từ 2003 – 2008, cũng cú sự biến đổi hỡnh thành 9 genotype virus cỳm A/H5N1 khỏc nhau, kớ hiệu từ VN1 – VN9, do tỏi tổ hợp cỏc gen khung giữa cỏc biến chủng virus cỳm A/H5N1 xõm nhập, cựng lưu hành ở chim hoang dó và gia cầm tại Việt Nam (Hỡnh 1.11) [69], [76].

Một phần của tài liệu Nghiên cứu sự biến đổi di truyền các gen PB2, PB1 và PA polymerase của virus cúm A/H5N1 đương nhiễm tại Việt Nam (Trang 33)

Tải bản đầy đủ (DOC)

(146 trang)
w