Chương 4 BÀN LUẬN
4.1.1. Về kết quả thu nhận cỏc gen PB2, PB1 và PA
Kết quả thu nhận cỏc gen PB2, PB1 và PA trong hệ gen 6 biến chủng virus cỳm A/H5N1 nghiờn cứu, cho thấy:
- Sỏu biến chủng virus cỳm A/H5N1 nghiờn cứu, bao gồm: DkNA72-2007, DkNA114-2007, CkDT382-2008, DkTG926-2009, DkQT801-2011 và DkQT802- 2011, chứa cỏc gen PB2, PB1 và PA thu nhận sau giải trỡnh tự, đều cú kớch thước lần lượt là 2.280, 2.274 và 2.151 nucleotide theo thứ tự, với bộ ba khởi đầu là ATG và kết thỳc là TAG. Đõy cũng là tổng số nucleotide của trỡnh tự vốn cú của cỏc gen PB2, PB1 và PA trong hệ gen virus cỳm A/H5N1 được phõn lập, nghiờn cứu và cụng bố từ năm 1996 đến nay [1], [2], [6], [12].
- Kết quả cắt kiểm tra DNA của PB2, PB1, PA cho thấy, cú sự bảo tồn cỏc vị trớ điểm cắt của enzym EcoRI trong trỡnh tự cỏc gen PB2 (1 vị trớ), PB1 (2 vị trớ) và PA (2 vị trớ), ở 6 biến chủng virus cỳm A/H5N1 nghiờn cứu so với trỡnh tự tương ứng, của cỏc chủng virus phõn lập trờn nhiều loài vật chủ từ 2003 đến nay.
- Bờn cạnh đú, kết quả đối chiếu trỡnh tự cỏc gen PB2, PB1 và PA thu nhận từ 06 biến chủng virus cỳm A/H5N1 nghiờn cứu, đều cú tỉ lệ tương đồng 97% – 99% ở mức độ so sỏnh 96% – 100%, với trỡnh tự cỏc gen tương ứng của cỏc chủng virus cỳm A/H5N1 được lưu trữ trong Ngõn hàng gen từ năm 2007 đến nay.
Cỏc kết quả trờn chứng tỏ rằng, trỡnh tự nucleotide cỏc gen PB2, PB1 và PA trong hệ gen của 6 biến chủng virus nghiờn cứu, đó được thu nhận đầy đủ toàn vẹn khung đọc mở và chớnh xỏc là cỏc gen tương ứng, của virus cỳm A/H5N1 đang lưu hành gõy bệnh dịch cỳm gia cầm A/H5N1 thời gian gần đõy. Kết quả cũng cho thấy, trỡnh tự của cỏc gen núi trờn đảm bảo độ tin cậy để so sỏnh, phõn tớch biến đổi đặc tớnh di truyền và tỡm hiểu phả hệ nguồn gốc chủng loại, với cỏc gen tương ứng của virus cỳm A/H5N1 lưu hành gõy bệnh từ 2003 đến nay thu thập từ Ngõn hàng gen.