Một trong những lo lắng nhất của khách hàng khi sử dụng dịch vụ Mobile Banking đó là việc tài khoản bị đánh cắp. Người sử dụng Mobile banking cũng có khả năng phải đối mặt với các nguy cơ như bị cài phần mềm độc hại trên thiết bị di động đánh cắp tài khoản hoặc thay đổi giao dịch, bị tấn công dẫn đến mất tài khoản… và ngồi ra do tính di động, thì cịn có nguy cơ mất các thiết bị di động, trên đó có cài đặt sẵn các ứng dụng Mobile Banking. Theo ước tính của McAfee trong năm 2014, các doanh nghiệp trên toàn thế giới đã thiệt hại hơn 1 nghìn tỷ USD do các vụ thiệt hại do mất an toàn thơng tin gây ra. Đích nhắm của tội phạm cơng nghệ cao thường nằm trong lĩnh vực tài chính, ngân hàng, thanh toán trực tuyến với mục tiêu là kiếm tiền bất hợp pháp.Tuy nhiên, hiện nay, theo ghi nhận thì chưa có trường hợp nào bị mất tiền trong tài khoản vì giao dịch Mobile Banking của Sacombank. Một phần do số người sử dụng dịch vụ này chưa nhiều vì chưa có thói quen, cũng như cịn e ngại về vấn đề an toàn khi sử dụng.
Một trong những rào cản trước mắt vẫn còn khá lớn trong việc triển khai Mobile Banking tại Ngân hàng Sacombank đó là hệ thống chưa hồn thiện. Cơ sở hạ tầng còn yếu kém như chất lượng mạng, tốc độ đường truyền, lỗi kỹ thuật hoặc thiết bị đầu cuối không đảm bảo chất lượng dẫn tới chất lượng dịch vụ chưa cao.Bên cạnh đó, các hệ thống ngân hàng điện tử của các ngân hàng cịn phát triển chưa có sự phối hợp, liên thông cần thiết nhằm phát huy cao nhất hiệu quả của dịch vụ mới này.
Điều này làm cho người tiêu dùng có tâm lý sợ rủi ro không muốn sử dụng dịch vụ Mobile Banking.Ngoài ra, trong thời gian vừa qua, nhiều ngân hàng đã làm mất uy tín đối với khách hàng khi thực hiện các giao dịch trực tuyến trên mạng, điều này gây ra tâm lý lo ngại cho người dân khi thực hiện thanh toán online.
vẫn là phương thức thanh toán chủ yếu, chiếm tỷ trọng lớn trong khu vực công, doanh nghiệp và dân cư. Mặc dù Ngân hàng Sacombank cũng như các tổ chức cung ứng dịch vụ thanh toán đã cố gắng tăng cường đầu tư nâng cao cải thiện chất lượng dịch vụ, nhưng một số vướng mắc như gặp trục trặc kỹ thuật, việc giải quyết khiếu nại, khiếu kiện chưa nhanh chóng, kịp thời,…vẫn ảnh hưởng trực tiếp đến niềm tin của người dân vào dịch vụ Mobile banking.