Hiện nay, trong thủ tục tố tụng dân sự giải quyết tranh chấp HĐTD ngân hàng còn chưa linh hoạt trong xử lý vấn đề. Bên cạnh đó trình tự, thủ tục giải quyết tranh chấp HĐTD cũng cần sửa đổi đơn giản hơn nếu xét thấy đã đầy đủ tài liệu, chứng cứ của vụ án thì Tịa án cần giải quyết ngay cho đương sự để tạo điều kiện cho các bên kinh doanh, sản xuất. Trình tự thủ tục giải quyết án ở Tòa án thường kéo dài từ 03 – 05 tháng (đối với tranh chấp kinh doanh, thương mại), từ 06 – 08 tháng (đối với tranh chấp dân sự), hoặc có thể lâu hơn, do phải trải qua các khâu: Thụ lý, nghiên cứu hồ sơ để tiến hành hịa giải, nếu hịa giải khơng thành thì tiến hành xét xử. Đến khi bản án hoặc quyết định có hiệu lực thì phải chờ Cơ quan thi hành án tiến hành giải quyết cho người có đơn u cầu thi hành án. Chính vì nhiều thủ tục như vậy, dẫn đến tình trạng là hoạt động kinh doanh, sản xuất của các bên bị ảnh hưởng nhiều theo chiều hướng bất lợi. Vì vậy, để bảo vệ quyền và lợi ích hợp pháp cho các đương sự thì cơ quan chức năng cần nghiên cứu, xây dựng một hệ thống pháp luật mà ở đó tùy từng trường hợp, cần quy định nới rộng thêm thời hạn giải quyết các tranh chấp kinh doanh, thương mại đối với những vụ án có tính chất phức tạp, nhiều đương sự, ở nhiều nơi khác nhau, cố tình giấu địa chỉ hoặc cần quy định rút ngắn thời gian, thủ tục giải quyết đơn giản, nhanh chóng… mà vẫn đảm bảo được lẽ phải, chân lý của cuộc sống và của pháp luật.