Hoạt động kiểm tra, kiểm soát các dự án ĐTXD công trình đường bộ trong thời gian qua đã được tiến hành trên nhiều góc độ: kiểm tra định kỳ, kiểm tra đột xuất, thanh tra, kiểm toán...
Thực tế hiện nay, hầu hết 100% các dự án ĐTXD công trình đường bộ nhóm A, B đều được các cơ quan kiểm tra, kiểm soát như Thanh tra Chính phủ, Thanh tra Bộ xây dựng, Thanh tra Bộ GTVT, Thanh tra cấp hành chính (Thanh tra cấp tỉnh, thanh tra cấp huyện..), các Kiểm toán Nhà nước chuyên ngành và khu vực kiểm toán.
Theo quy định hiện hành về Quyết toán vốn ĐTXD cơ bản, đối với các Dự án nhóm A, nhóm B yêu cầu phải có Kiểm toán độc lập kiểm toán; Dự án nhóm C không bắt buộc hoặc theo yêu cầu của Người quyết định đầu tư.
Kết quả thanh tra, kiểm toán cho thấy, các công trình dự án đều có sai phạm trong các khâu lập dự án, trình tự, thủ tục đầu tư, thiết kế, đấu thầu, sử dụng vốn đầu tư sai mục đích, nghiệm thu, thanh toán khống, quyết toán sai so với khối lượng thực tế đã thi công, đơn giá, định mức.. gây thất thoát, lãng phí.
- Báo cáo tổng hợp toàn ngành Thanh tra (tổng hợp tại Thanh tra Chính phủ) tại các dự án đầu tư xây dựng (trong đó có các dự án đầu tư xây dựng công trình đường bộ) năm 2011 đã xuất toán, loại khỏi giá trị quyết toán và đề
nghị cấp có thẩm quyền xem xét xử lý 3.473 tỷ đồng; năm 2012 thanh tra xuất toán, loại khỏi giá trị quyết toán và đề nghị cơ quan có thẩm quyền xử lý 31.130 tỷ đồng (1.234 cuộc thanh tra đầu tư xây dựng, kiến nghị thu hồi 593,2 tỷ đồng); năm 2013 xuất toán, loại khỏi giá trị quyết toán và đề nghị cơ quan có thẩm quyền xử lý 301.327 tỷ đồng. [16, tr87]
- Kết quả thanh tra Bộ Tài chính tại các dự án ĐTXD công trình đường bộ được thanh tra: năm 2008, tại 6 dự án đã kiến nghị xử lý tài chính số tiền 872,33 tỷ đồng (trong đó, riêng tuyến Quản Lộ - Phụng Hiệp kiến nghị xử lý 846,62 tỷ đồng); năm 2009, tại 3 dự án đã kiến nghị xử lý tài chính 59,39 tỷ đồng. [17, tr87]
- Báo cáo Kiểm toán Nhà nước tại các dự án đầu tư xây dựng công trình đường bộ được kiểm toán: năm 2011, tại 5 dự án đã kiến nghị xử lý tài chính 259,08 tỷ đồng; năm 2012, tại 11 dự án đã kiến nghị xử lý tài chính 114,96 tỷ đồng; năm 2013 tại 3 dự án đã kiến nghị xử lý tài chính 162,1 tỷ đồng.. [7, tr86]
Bên cạnh những kết quả về số liệu, thông qua hoạt động thanh tra, kiểm toán các cơ quan thanh tra, kiểm toán đã kiến nghị sửa đổi các quy trình, tiêu chuẩn ngành giao thông cho lĩnh vực công trình đường bộ; kiến nghị các cơ quan có thẩm quyền sửa đổi, bổ sung hoàn thiện một số các Luật đầu tư, Luật xây dựng, Luật đấu thầu,.. các Nghị định về quản lý đầu tư xây dựng, các thông tư hướng dẫn chi tiết đặc biệt là hướng dẫn về chi phí, về hợp đồng.. đối với dự án ĐTXD công trình đường bộ.