Song song với những kết quả đạt đƣợc là những tồn tại hạn chế cần chú ý:
Về số lượng khách hàng
Tỷ trọng số khách hàng vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao trên số khách hàng vay nông nghiệp nông thôn và trên tổng số khách hàng vay vẫn còn thấp. Tốc độ tăng số lƣơng khách hàng vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao lớn về số tƣơng đối nhƣng thấp về số tuyệt đối.
Dƣ nợ cho vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao chiếm tỷ trọng khá thấp trong tổng dƣ nợ cho vay của Agribank Lâm Đồng trong khi dƣ nợ cho vay nông nghiệp nông thôn nói chung chiếm tỷ trọng chủ yếu. Về tốc độ tăng trƣởng, dƣ nợ cho vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao có tăng đáng kể, tuy nhiên tỷ lệ này vẫn chƣa cao, chƣa đạt yêu cầu của Agribank Lâm Đồng đề ra, và chƣa tƣơng xứng với tiềm năng phát triển nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao tại Lâm Đồng.
Về cơ cấu dư nợ cho vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao
Cơ cấu cho vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao theo ngành nghề và các đối tƣợng sản xuất vẫn chƣa đồng đều, chỉ tập trung chủ yếu vào cho vay lĩnh vực trồng trọt, với đối tƣợng sản xuất chính là rau, hoa công nghệ cao.
Về lợi nhuận từ cho vay và tốc độ tăng lợi nhuận từ cho vay
Tỷ lệ thực thu lãi vẫn chƣa cao, lãi tồn cho vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao vẫn tăng qua các năm. Chênh lệch lãi suất đầu vào đầu ra giảm, tuy ảnh hƣởng bởi chính sách, chủ trƣơng chung của chính phủ và ngân hàng nhà nƣớc nhƣng vẫn tác động một phần vào kết quả kinh doanh của đơn vị.
Về tỷ lệ nợ xấu từ cho vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao
Tuy tỷ lệ nợ xấu cho vay nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao hiện tại thấp, nhƣng nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao là một lĩnh vực mới đòi hỏi nhiều kiến thức và kỹ thuật đối với ngƣời nông dân, đồng thời đối với ngân hàng, dƣ nợ bình quân cho vay 1 khách hàng sản xuất nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao cũng lớn hơn các khách hàng khác, do đó rủi ro không thu hồi đƣợc nợ cũng cao hơn, vì vậy nguy cơ phát sinh nợ xấu cũng sẽ tăng.