Viện Khoa học Đo đạc và Bản đồ đã trải qua quá trình hình thành và phát triển sau:
- Ngày 9/7/1994 Tổng cục trưởng Tổng cục Địa chính có Quyết định số 413 QĐ/TCCB thành lập Viện Khoa học và Công nghệ Địa chính trên cơ sở Liên hiệp Khoa học sản xuất Trắc địa và Bản đồ được thành lập tại QĐ số 143/CT ngày 26/4/1991 của Chủ tịch Hội đồng Bộ trưởng;
- Ngày 11/9/1997 Tổng Cục trưởng Tổng cục Địa chính có Quyết định số 520 QĐ/TCCB V/v đổi tên Viện Khoa học và Công nghệ Địa chính thành Viện nghiên cứu Địa chính căn cứ theo Quyết định số 782/QĐ-TTg ngày 24/10/1996 của Thủ tướng Chính phủ về việc sắp xếp các cơ quan nghiên cứu - triển khai khoa học và công nghệ. Các chức năng, nhiệm vụ và tổ chức bộ máy của Viện Nghiên cứu Địa chính được quy định bởi Quyết định số 45/1999/QĐ-ĐC ngày 10/02/1999 của Tổng Cục trưởng Tổng cục Địa chính và các Quyết định số 11/2004/QĐ-BTNMT ngày 16/06/2004 và Quyết định số 11/2004/QĐ-BTNMT ngày 16/06/2004 và Quyết định số 942/QĐ-BTNMT ngày 17/07/2006 của Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường.
- Viện Nghiên cứu Địa chính được đổi tên thành Viện Khoa học Đo đạc và Bản đồ theo Quyết định số 1238/QĐ-TTg ngày 18/9/2006 của Thủ tướng Chính Phủ. Căn cứ theo Nghị định số 115/2005/NĐ-CP ngày 05/09/2005 của Chính phủ quy định cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm của tổ chức khoa học và công nghệ công lập và Quyết định số 08/2007/QĐ-BKHCN ngày 06/04/2007 của Bộ Khoa học và Công nghệ về việc ban hành “Quy định
về tiêu chí xác định tổ chức khoa học và công nghệ nghiên cứu cơ bản, nghiên cứu chiến lược, chính sách phục vụ quản lý nhà nước”, Viện Khoa học Đo đạc và Bản đồ được sắp xếp là Viện nghiên cứu cơ bản trực thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường theo Quyết định số 1140/QĐ-BTNMT ngày 30/07/2007 của Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường. Căn cứ Nghị định số 25/2008/NĐ-CP của Chính phủ quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ Tài nguyên và Môi trường, Thủ tướng Chính phủ ban hành Quyết định số 767/QĐ-TTg ngày 23/06/2008 về các đơn vị sự nghiệp trực thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường, mà theo đó Viện Khoa học Đo đạc và Bản đồ là đơn vị trực thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường. Chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Viện Khoa học Đo đạc và Bản đồ được quy định trong Quyết định số 3482/QĐ-BTNMT ngày 29 tháng 12 năm 2017 của Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường.
Trong quá trình hình thành và phát triển, Viện đã có nhiều đóng góp vào sự phát triển của ngành Đo đạc - Bản đồ và Quản lý đất đai.
Viện đã chủ trì xây dựng nhiều quy phạm, định mức kinh tế - kỹ thuật của ngành như Quy phạm Thành lập Bản đồ Địa hình tỷ lệ 1:10.000 và 1:25.000; Định mức Kinh tế - kỹ thuật Đo đạc Địa chính, Đăng ký đất đai, lập Hồ sơ Địa chính, cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất; Quy phạm Xây dựng lưới trọng lực quốc gia; Quy phạm Thành lập Bản đồ Địa chính tỷ lệ 1/200, 1/500, 1/1000, 1/2000, 1/5000 và 1/10.000 và Ký hiệu Bản đồ Địa chính tỷ lệ 1/200, 1/500, 1/1000, 1/2000, 1/5000 và 1/10.000; Tham gia thực hiện dự án xây dựng cơ sở dữ liệu hệ thống thông tin địa hình thuỷ văn cơ bản phục vụ phòng chống lũ lụt và phát triển kinh tế xã hội Vùng Đồng bằng sông Cửu Long; Xây dựng hệ thống trọng lực cho Việt Nam; Xây dựng hệ thống mốc cơ sở cho toàn bộ các sân bay của Việt Nam…
Hiện nay, Viện đang triển khai xây dựng định mức kinh tế kỹ thuật Xây dựng lưới trọng lực Nhà nước. Ngoài ra, Viện cònứng dụng công nghệ máy bay không người lái (UAV) để thực hiện các dự án kinh tế.
Với những đóng góp và thành tích đã đạt được Viện đã nhận được những phần thưởng của Đảng và Nhà nước trao tặng như: Bằng khen của Thủ tướng Chính phủ tại Quyết định số 1329/QĐ-TTg ngày 04/12/2005; Bằng khen của Bộ Tài nguyên và Môi trường các năm và nhiều bằng khen khác của Nhà nước trao tặng cho tập thể và cá nhân.