Các bộ, ngành, địa phương là cơ quan trực tiếp quyết định đầu tư các dự án sử dụng vốn NSNN, do vậy để hoạt động kiểm soát chi đầu tư XDCB đạt hiệu quả cao, kiến nghị với các bộ, ngành, địa phương như sau:
- Đối với công tác lập, phân bổ kế hoạch vốn phải bố trí vốn tập trung, tránh dàn trải, ưu tiên vốn cho các dự án cấp bách, dự án chuyển tiếp, dự án có tiến độ thực hiện tốt. Kiên quyết cắt giảm vốn các dự án không hiệu quả, đình hoãn các dự án chưa cần thiết phải khởi công. Đổi mới công tác bố trí kế hoạch vốn bằng công tác lập dự toán vốn cho dự án cùng với lập dự toán ngân sách hàng năm và phải dự kiến vốn cho các năm tiếp theo theo tổng mức đầu tư đã phê duyệt và tiến độ triển khai thực hiện dự án đã ghi trong quyết định đầu tư. Tiến tới kiểm soát chi theo dự án, kiểm soát chi đầu tư XDCB chi tiết theo kế hoạch vốn hàng năm.
- Thành lập các BQLDA khu vực để giúp cho các chủ đầu tư cấp xã trong việc tổ chức quản lý dự án. Hiện nay mỗi huyện có 01 BQLDA chuyên ngành nên không đảm đương nổi khối lượng công việc lớn trong khi hầu hết các xã đều không đủ năng lực để quản lý dự án, có biểu hiện khoán trắng cho các doanh nghiệp tư vấn quản lý dự án.
- Đôn đốc chủ đầu tư khẩn trương lập và trình duyệt quyết toán vốn đầu tư dự án, công trình hoàn thành và khẩn trương phê duyệt quyết toán vốn đầu tư dự án, công trình hoàn thành đã có đầy đủ điều kiện, hồ sơ thủ tục theo luật định để làm cơ sở cho KBNN thanh quyết toán và tất toán tài khoản của dự án.
- Tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra, giảm sát quá trình thực hiện các dự án đầu tư để ngăn ngừa và hạn chế những vi phạm của các chủ đầu tư, nhà thầu và đơn vị tư vấn khi tham gia quản lý, thực hiện dự án đầu tư.