Từ năm 2013 đến nay, Thanh tra Bộ gồm 05 phòng chuyên môn nghiệp vụ. Chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức bộ máy của các phòng do Chánh Thanh tra Bộ đề xuất, Bộ trƣởng Bộ VHTTDL quyết định. Các phòng chức năng cụ thể theo Quyết định số 3885/QĐ-BVHTTDL ngày 04 tháng 11 năm 2013 của Bộ trưởng Bộ VHTTDL Quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Thanh tra Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch, nhƣ sau [6]:
+ Phòng Hành chính-Tổng hợp: Có trách nhiệm giúp Chánh Thanh tra Bộ lãnh đạo, chỉ đạo quản lý, điều hành các mặt công tác của Thanh tra Bộ; xây dựng chƣơng trình, kế hoạch và tổng hợp, báo cáo chung về tình hình, kết quả công tác của Thanh tra Bộ VHTTDL theo quy định.
+ Phòng Thanh tra Văn hóa-Gia đình: có trách nhiệm giúp Chánh thanh tra Bộ VHTTDL chỉ đạo và tổ chức thực hiện công tác thanh tra việc chấp hành pháp luật chuyên ngành quản lý nhà nƣớc trong các lĩnh vực văn hóa và gia đình, nhƣ: về di sản văn hóa; nghệ thuật biểu diễn; điện ảnh; mỹ thuật, nhiếp ảnh, triển lãm; về quyền tác giả, quyền liên quan; về thƣ viện; về quảng cáo; về văn hóa quần chúng, văn hóa dân tộc và tuyên truyền cổ động; về văn học; và về gia đình.
+ Phòng Thanh tra Thể dục, thể thao: có trách nhiệm giúp Chánh thanh tra Bộ VHTTDL chỉ đạo và tổ chức thực hiện công tác thanh tra việc chấp hành pháp luật chuyên ngành quản lý nhà nƣớc trong lĩnh vực thể dục, thể thao cho mọi ngƣời, thể thao thành tích cao và thể thao chuyên nghiệp
+ Phòng Thanh tra Du lịch: có trách nhiệm giúp Chánh thanh tra Bộ VHTTDL chỉ đạo và tổ chức thực hiện công tác thanh tra việc chấp hành pháp
luật chuyên ngành quản lý nhà nƣớc về khu du lịch, điểm du lịch, tuyến du lịch, hƣớng dẫn du lịch, kinh doanh du lịch.
+ Phòng Thanh tra Hành chính và Chống tham nhũng.
Chánh Thanh tra Bộ chịu trách nhiệm trƣớc Bộ trƣởng Bộ Văn hoá, Thể thao và Du lịch và trƣớc pháp luật về việc thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn đƣợc giao của Thanh tra Bộ; có trách nhiệm quy định chức năng, nhiệm vụ cụ thể của các phòng trực thuộc; sắp xếp, bố trí công chức theo cơ cấu chức danh và tiêu chuẩn nghiệp vụ; xây dựng và ban hành Quy chế tổ chức và hoạt động của Thanh tra Bộ.