Johnson & Wen (2009) đã nghiên cứu quá trình sản xuất biodiesel từ loài
Aurantriochytriumlimacinum SR21 (S. limacinum SR21) sử dụng các phương pháp
khác nhau, bao gồm quá trình tách chiết dầu theo sau là quá trình chuyển vị ester (phương pháp hai giai đoạn) hoặc chuyển vị trực tiếp từ sinh khối tảo khô (phương pháp một giai đoạn). Khi sinh khối đông khô được sử dụng làm nguyên liệu, phương pháp hai giai đoạn sản lượng đạt 57% sản lượng biodiesel thô (tính theo sinh khối tảo) với thành phần FAME là 66,37%. Phương pháp một giai đoạn (sử dụng cloroform, hexane, hoặc petroleum ether được sử dụng trong quá trình chuyển vị) cho sản lượng biodiesel thô cao hơn, trong đó, sử dụng dung môi cloroform trong quá trình chuyển vị ester đã cho hàm lượng FAME cao hơn. Khi sinh khối tảo tươi được sử dụng làm nguồn nguyên liệu, phương pháp chuyển hoá một giai đoạn cho sản lượng biodiesel thấp hơn rất nhiều. Sản phẩm biodiesel đạt một số tiêu chuẩn ASTM như glycerol tự do, glycerol tổng số, trị số axít, trị số xà phòng, ăn mòn kim loại đồng, điểm chớp cháy, độ nhớt, trong khi lượng nước và cặn cũng như hàm lượng lưu huỳnh chưa đạt tiêu chuẩn (Johnson & Wen, 2009).
Kim và cộng sự (2012) đã sử dụng sinh khối dạng bột Schizochytrium sp. của NOVUS (Mỹ) để sản xuất ethanol. Hàm lượng cacbohydrate (glucan- 10,8%, galactan-6,5%) và lipit của chủng này đạt 17,3 và 25,1% khối lượng khô, tương ứng. Hàm lượng DHA chiếm 8,2% so với axít béo tổng số. Phương pháp phân đoạn bằng thủy nhiệt tảo Schizochytrium sp. đã được tiến hành để phân tách các thành phần đường, lipit và protein. Quá trình phân đoạn nêu trên sẽ tạo thành phần rắn giàu protein và phần lỏng chứa các đường oligo và lipit. Hai thành phần trong pha lỏng có thể tiếp tục được phân tách. Loại đường chủ yếu trong sinh khối tảo sau quá trình thủy nhiệt là D-glucose and L-galactose. Điều kiện tối ưu cho quá trình phân đoạn được xác định bao gồm nhiệt độ, thời gian phản ứng tương ứng là 115,5oC, 46,7 phút, và lượng chất rắn đầu vào là 25% được xác định bằng phương pháp đáp ứng bề mặt (RSM). Theo tính toán lý thuyết, sản lượng đường oligo tối ưu có thể thu hồi là 19,4 % khối lượng. Kết quả thực nghiệm thu được vào khoảng 16,6 % khối lượng. Quá trình sản xuất bioethanol sau đó được tiến hành bởi E. coli KO11 và sản lượng ethanol thu được đạt 11,8 g-ethanol/l từ 25,7 g/l glucose (Kim và cs, 2012).