Thứ nhất, công tác thẩm định khách hàng còn nhiều khó khăn dẫn đến việc sai lệch trong nhận diện rủi ro khách hàng doanh nghiệp do thiếu thông tin về tài chính doanh nghiệp, pháp lý doanh nghiệp và các vấn đề có liên quan đến dự án đầu tư ( trong trường hợp cho vay dự án đầu tư) dẫn đến sai lệch trong kết luận cho vay khách hàng và dự kiến mức tổn thất có thể xảy ra.
Thứ hai, chi nhánh chủ yếu sử dụng các mô hình truyền thống để đánh giá rủi ro tín dụng, chưa có các công cụ quản trị học hiện đại mang tính định lượng để nâng cao chất lượng đo lường rủi ro tín dụng. Nhất là trong thời điểm hiện tại, thông tin do khách hàng cung cấp không phải cũng chính xác và rất khó kiểm soát.
Thứ ba, công tác ngăn ngừa rủi ro tín dụng tại chi nhánh còn thụ động, nhiều khoản vay chỉ được xử lý sau khi đã xảy ra rủi ro. Chất lượng cán bộ còn hạn chế tại nhiều bộ phận , nhất là đối với những công việc mang tính phức tạp. Chất lượng công tác tự đào tạo chưa đáp ứng được với yêu cầu. Mặc dù thời gian qua có rất nhiều các văn bản sửa đổi bổ sung hướng dẫn về giai đoạn kiểm tra sau vay của cán bộ tín dụng nhưng trên thực tế các cán bộ vẫn chưa nhận thức được đầy đủ sự cần thiết của giai đoạn này. Chưa đa dạng hoá được danh mục đầu tư. Trong đầu tư cho vay mới, cơ cấu dư nợ đã có bước cải thiện tuy nhiên nhìn chung vẫn chưa phù hợp với điều kiện kinh tế địa bàn cũng như điều kiện thực tế của chi nhánh, điều này có thể dẫn tới rủi ro tín dụng bất cứ lúc nào.
Thứ tư, tình trạng kiểm tra sau khi cho vay ở một bộ phận cán bộ tín dụng chỉ mang tính chất đối phó và tượng trưng, chưa thực sự sâu sát với hoạt động sản xuất kinh doanh của khách hàng. Ngoài ra, trong thời buổi cạnh tranh hiện đại, lực lượng cán bộ tín dụng của Agribank phải quản lý một khối lượng khách hàng rất lớn, Agribank cũng chưa có các công cụ hỗ trợ trong việc xử lý công việc được năng suất và hiệu quả
Thứ năm, khả năng giám sát chặt chẽ tình hình sử dụng vốn vay cuả khách hàng nhằm phát hiện sớm dấu hiệu rủi ro còn hạn chế nhất là đối với khách hàng doanh nghiệp có dấu hiệu tình hình kinh doanh suy giảm, gặp khó khăn về tài chính; dẫn đến khó khăn trong quản lý nguồn thu, nguồn tiền trả nợ theo dự án; nguyên nhân do công tác quản lý, dự đoán dự báo, phân tích đánh giá nợ, tài sản đảm bảo nợ còn hạn chế.