Tính khoa học của dự án phụ thuộc rất nhiều vào sử dụng các phương pháp thẩm định, theo từng cấp độ, nội dung cũng như yêu cầu thu thập thông tin, nguồn thông tin hiện có để đưa ra các phương pháp thẩm định khả thi, tối ưu hóa việc sử dụng có hiệu quả các phương pháp, nâng cao chất lượng công tác thẩm định. Hiện tại, NHCT-Chi nhánh Ba Đình đã áp dụng kết hợp nhiều phương pháp thẩm định như phương pháp thẩm định theo trình tự, phương pháp so sánh, đối chiếu các chỉ tiêu, phương pháp độ nhaỵ,... Tuy nhiên, những phương pháp được áp dụng chủ yếu là những phương pháp truyền thống, yêu cầu kỹ thuật chưa cao, do đó đòi hỏi NHCT-Chi nhánh Ba Đìnhcần thực hiện đa dạng hóa hơn nữa các phương pháp thẩm định, cụ thể:
NHCT-Chi nhánh Ba Đìnhcần sử dụng linh hoạt các phương pháp thẩm định nhằm có những nhận xét, đánh giá đa chiều, trung thực về DAĐT. Sử dụng phương pháp không chỉ dừng lại ở việc tìm hiểu, nhận xét, đánh giá, đảm bảo tuân thủ theo pháp luật mà còn là cách thức tác động vào dự án để dự án bộc lộ một cách toàn diện trên mọi khía cạnh. Khi thẩm định hiệu quả dự án đầu tư, NHCT-Chi nhánh Ba Đìnhcần chú trọng vào nghiên cứu DAĐT ở trạng thái động. Hiện nay, ngoài hai phương pháp chủ yếu hay sử dụng là thẩm định theo trình tự và phương pháp đối chiếu so sánh, công tác thẩm định DAĐT cần tiến hành sử dụng phương pháp thẩm định phân tích độ nhạy của dự án. Việc nghiên cứu hiệu quả của DAĐT trong điều kiện một hoặc một số yếu tố của dự án thay đổi giúp cho ngân hàng thấy được tính ổn định trong các kết luận về tính hiệu quả của dự án, tránh được những rủi ro có
thể xảy ra trong tương lai.
Để thực hiện được điều này, cán bộ thẩm định phải lựa chọn được các yếu tố không an toàn, cho các yếu tố này thay đổi theo một tỉ lệ phần trăm nhất định so với số liệu ban đầu, sau đó tính lại các chỉ tiêu hiệu quả tài chính dự án theo sự điều chỉnh này. Điều quan trọng khi sử dụng phương pháp này là phải dự đoán được xu hướng và mức độ thay đổi của các yếu tố ảnh hưởng. Đây cũng là cơ sở để xác định yếu tố nào có tác động lớn nhất đến dự án, nhằm đánh giá mức độ an toàn của dự án, từ đó có những biện pháp điều chỉnh thích hợp trong quá trình đưa dự án đi vào hoạt động.