Cục Hải quan tỉnh Lạng Sơn được thành lập theo Nghị định số 206/TC-NĐ ngày 10/09/1953 của Bộ trưởng Bộ Tài chính. Trong 02 cuộc chiến tranh chống Pháp và chống Mỹ, Cục HQLS đã thực hiện tốt nhiệm vụ thông quan, tiếp nhận sự giúp đỡ của các nước Xã hội chủ nghĩa anh em, đóng góp tích cực vào việc hỗ trợ kịp thời cho tiền tuyến. Lạng Sơn trở thành “cảng nổi”, “điểm giải tỏa hàng hóa sôi động” của cả nước.
Qua hơn 60 năm phấn đấu xây dựng và phát triển, Cục Hải quan tỉnh Lạng sơn đã vinh dự được các cấp ghi nhận những thành tích với nhiều phần thưởng xứng đáng. Trong đó, phần thưởng cao quý nhất là Cờ thi đua của Chính phủ năm 2009, Huân chương Lao động Hạng III do Chủ tịch nước trao tặng năm 2011. Đạt được kết quả trên, ngoài sự cố gắng, nỗ lực của Lãnh đạo và cán bộ, công chức Cục Hải quan tỉnh Lạng Sơn còn nhờ sự quan tâm chỉ đạo của Lãnh đạo Bộ Tài chính, Tỉnh Ủy, Hội đồng nhân dân, Ủy ban nhân dân tỉnh Lạng Sơn và của Tổng cục Hải quan; sự hỗ trợ giúp đỡ của các đơn vị trong ngành Hải quan, của các Sở, Ban, Ngành tại địa phương.
Hiện nay bộ máy tổ chức của Hải quan Lạng Sơn đứng thứ 6 toàn ngành với 16 đơn vị trực thuộc (trong đó có 05 Chi cục Hải quan Cửa khẩu,01 Chi cục Kiểm tra sau thông quan, 01 Đội Kiểm soát Hải quan; 01 Bộ phận hải quan công tác tại Trạm Kiểm soát liên ngành Dốc Quýt và 08 đơn vị thuộc Khối các đơn vị tham mưu thuộc Cục). Chức năng, nhiệm vụ của Cục Hải quan tỉnh Lạng Sơn được quy định như sau:
Tổ chức thực thi Pháp luật về Hải quan và các quy định khác của Pháp luật có liên quan trên địa bàn hoạt động của Cục Hải quan theo quy định của pháp luật. Cục Hải quan có tư cách pháp nhân, con dấu riêng, được mở tài khoản tại Kho bạc Nhà nước theo quy định của pháp luật.
* Nhiệm vụ:
Cục Hải quan tỉnh Lạng Sơn thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn theo quy định của Luật hải quan, các quy định khác của Pháp luật có liên quan và những nhiệm vụ quyền hạn cụ thể sau:
- Tổ chức, chỉ đạo, hướng dẫn và triển khai thực hiện các quy định của Nhà nước về hải quan trên địa bàn hoạt động của Cục Hải quan Tỉnh Lạng Sơn
- Hướng dẫn, chỉ đạo, kiểm tra các Chi cục Hải quan trong việc tổ chức triển khai nhiệm vụ được giao. Thanh tra, kiểm tra việc thực hiện chính sách, pháp luật về hải quan theo quy định của pháp luật.
- Xử lý vi phạm hành chính hoặc khởi tố đối với các vụ buôn lậu, vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới theo quy định của pháp luật; giải quyết khiếu nại đối với các quyết định hành chính của các đơn vị trực thuộc và giải quyết khiếu nại, tố cáo thuộc thẩm quyền theo quy định của pháp luật.
- Kiến nghị những vấn đề cần sửa đổi, bổ sung các quy định của Nhà nước về hải quan đối với hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu, xuất cảnh, nhập cảnh, quá cảnh và chính sách thuế đối với hàng hoá xuất khẩu, nhập khẩu.
- Tổ chức triển khai ứng dụng tiến bộ khoa học, công nghệ và phương pháp quản lý hải quan hiện đại vào hoạt động của Cục Hải quan; Phối hợp với các đơn vị trên địa bàn, cơ quan nhà nước và các tổ chức có liên quan để thực hiện nhiệm vụ được giao; Tuyên truyền và hướng dẫn thực hiện chính sách, pháp luật về hải quan trên địa bàn.
- Tổng kết, đánh giá tình hình và kết quả hoạt động của Cục Hải quan; thực hiện chế độ báo cáo theo chế độ quy định; Quản lý, sử dụng, đào tạo, bồi dưỡng cán bộ, công chức của Cục hải quan theo quy định của pháp luật và phân cấp quản lý cán bộ của Bộ Tài chính; Quản lý, lưu giữ hồ sơ, tài liệu, ấn chỉ thuế; quản lý, sử
dụng phương tiện, trang bị kỹ thuật và kinh phí hoạt động của Cục hải quan theo quy định của pháp luật.