Cấu trúc virus PRRS quan sát dưới kính hiển vi điển tử có dạng hình cầu, có vỏ bọc, trên bề mặt có nhiều gai nhô ra, kích thước 45-80 nm và chứa nhân nucleocapside kích thước 25-35nm.
Hệ gen của virus PRRS là một chuỗi RNA đơn dương, dài khoảng 15 kb và chứa 9 khung đọc mở (ORF). ORF1a và ORF1b chiếm khoảng 80% hệ gen virus và được dịch thành hai polyprotein lớn là protein sao chép pp1a và pp1b. Những protein này sau khi dịch mã bởi 4 protease thành 14 protein phi cấu trúc (NSPs), NSP1α, NSP1β và NSP2 đến NSP12. NSP9 mã hóa cho RNA polymerase phụ thuộc RNA và NSP10 mã hóa cho helicase, là hai protein phi cấu trúc chính chịu trách nhiệm sao chép và phiên mã của hệ gen virus. Người ta đã chứng minh được rằng có một vùng đặc biệt thuộc protein NSP11 đóng vai trò quan trọng trọng chu trình sao chép của tất cả các virus thuộc chi Arterivirus (Bautista et al., 2002; Fang and Snijder, 2010). ORFs 2a, 2b và ORF3-7 nằm ở đầu 3’ của hệ gen virus, sau dịch mã được phân cắt thành các protein cấu trúc của virus PRRS (Dea et al., 1996;
Meulenberg et al., 1995; Wu et al., 2001). Các protein cấu trúc được biểu hiện ra từ các đoạn mRNA nằm ở đầu 3’ của hệ gen virus và có cùng trình tự điều khiển nằm ở đầu 5’ của các đoạn này (Snijder and Meulenberg, 1998). Glycoprotein 5 (GP5), protein màng (M) và nucleoprotein (N) được mã hóa bởi các ORFs 5-7, là các thành phần chính của hạt virus (Dea et al., 2000).
ORF 2a, 3 và 4 mã hóa cho các protein khác thuộc hạt virus bao gồm GP2a, GP3 và GP4. Các protein này tương tác với nhau và tụ hội thành virion như một phức hệ đa thành phần và cũng tham gia vào quá trình nhiễm trùng của virus (Wissink et al., 2005). ORF 2b mã hóa cho protein vỏ (E).
ORF2a, ORF2b và ORFs 3-7 mã hóa lần lượt cho protein cấu trúc virus GP2a, GP2b (E), GP3, GP4, GP5, M và N (Snijder and Meulenberg, 1998); GP2b là một ORF nhỏ ở bên trong, nằm hoàn toàn trong ORF2. GP2a, GP3, và GP4 là các protein vỏ phụ bị glycosyl hóa ở đầu N, tạo thành dị tam hợp bằng liên kết disulphide (Wieringa et al, 2003a; Wissink et al, 2004).
Hình 1.3. Cấu trúc thông tin di truyền của virus PRRS
Bảng 1.3. Hệ gen của virus PRRS và các thông tin liên quan Số
TT ORF
Protein được
mã hóa Chức năng
Vai trò trong miễn dịch, bảo hộ 1 ORF1a Prot ei n in kh ông c ấu t rúc
nsp 1 Cystein protease, giống papain IFN và TNF, chất đối kháng mạnh
nsp 1 Cystein protease, giống papain
nsp 2 Cystein protease, giống papain Chất đối kháng IFN mạnh nsp 3 Protein chuyển màng Chưa có số liệu - chưa biết nsp 4 Serine protease Chưa biết
nsp 5 Protein chuyển màng Chưa biết nsp 6 Chưa biết Chưa biết
nsp 7 Chưa biết Kháng nguyên cho xác định huyết thanh học về sự cảm nhiễm virus
nsp 7 Chưa biết
nsp 8 Chưa biết Chưa biết
2 ORF1b
nsp 9 Polymerase RNA phụ thuộc Chưa biết nsp 10 Helicase Chưa biết
nsp 11 Endoribonuclease Chất đối kháng IFN mạnh nsp 12 Chưa biết Chưa biết
3 ORF2a Prot ei n cấ u tr ú c
GP2a Protein vỏ nhỏ, tương tác với
CD163 Epitop trung hòa nhỏ 4 ORF2b GP2b Protein vỏ nhỏ Chưa biết
5 ORF3 GP3 Protein vỏ nhỏ Epitop trung hòa nhỏ
6 ORF4 GP4 Protein vỏ nhỏ, tương tác với
CD163 Epitop trung hòa nhỏ
8 ORF5 GP5 Protein vỏ chính, tương tác với
sialoadhesin Epitop trung hòa chính
8 ORF6 M protein Protein vỏ chính, tương tác với heparansulfate
Epitop tế bào T, epitop trung hòa nhỏ (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
9 ORF7 N protein Nucleocapside Epitop không trung hòa
(Nguồn: Charerntantanakul, 2012)