Còn nhiều Đoàn kiểm toán cơ sở vật chất ch−a đảm bảo tính độc lập hoàn toàn, ít nhiều ảnh h−ởng đến tính độc lập của Kiểm toán viên nhất là với Kiểm toán viên kiểm toán lĩnh vực chi sự nghiệp.
Sau khi khảo sát, hầu hết các Đoàn kiểm toán ch−a thực hiện đ−ợc công tác tập huấn nghiệp vụ chuyên môn và phổ biến các đặc điểm về cơ chế chính sách, công tác tổ chức quản lý,… của địa ph−ơng và các nội dung cần chú ý khi thực hiện b−ớc kiểm toán theo yêu cầu của Quy trình kiểm toán NSNN.
*Nguyên nhân dẫn đến các hạn chế
Một trong những nguyên nhân dẫn đến những hạn chế trong khâu thu thập thông tin, phân tích, đánh giá trọng yếu để lập kế hoạch kiểm toán là do trình độ Kiểm toán viên ch−a đạt đến mức yêu cầu. Nhiều Kiểm toán viên đ−ợc giao nhiệm vụ khảo sát không định hình đ−ợc các công việc cụ thể, tài liệu gì cần đ−ợc thu thập, chỉ thực hiện thu thập danh sách đơn vị sử dụng ngân sách, số l−ợng kinh phí mà mỗi đơn vị đ−ợc cấp là coi nh− xong nhiệm vụ. Thậm chí các số liệu, tài liệu đánh giá đặc điểm thực hiện quản lý, chi tiêu và quyết toán ngân sách… thu thập đều do cán bộ Sở Tài chính và Kho bạc Nhà n−ớc thống kê, cung cấp.
Công tác thu thập thông tin khi khảo sát để lập kế hoạch kiểm toán là khâu rất quan trọng. Đó là tài liệu mà trong suốt quá trình thực hiện kiểm toán các Kiểm toán viên dùng làm định h−ớng kiểm toán, dùng làm tài liệu phục vụ cho việc kiểm toán tổng hợp và quyết định rất nhiều đến kết quả của cuộc kiểm toán. Thực tế hiện nay, tài liệu khảo sát và công tác khảo sát nói chung ch−a đ−ợc tổ chức, khai thác hết tác dụng để thực sự giúp ích cho giai đoạn thực hiện kiểm toán.
2.2.2.2 B−ớc thứ hai: Thực hiện kiểm toán
Về cơ bản công tác kiểm toán chi sự nghiệp nói chung, chi sự nghiệp giáo dục-đào tạo, y tế nói riêng đã đáp ứng đ−ợc yêu cầu về mục tiêu, nội dung của cuộc kiểm toán. Các Kiểm toán viên đã thực hiện đúng Quy trình kiểm toán quy định. Qua kiểm toán đã đ−a ra những đánh giá về quản lý, sử dụng ngân sách của các đơn vị, những kiến nghị để khắc phục, chấn chỉnh sai phạm, tồn tại trong quản lý, sử dụng ngân sách. Tuy nhiên mức độ đánh giá, nhận xét đối với một số cuộc kiểm toán đ−a ra ch−a thật tổng quát, ch−a thực sự gắn với số liệu thực chi cho lĩnh vực đó và ý kiến kiến nghị xử lý ch−a phù hợp với chính sách chế độ hiện hành.