Năng lực, vai trò lãnh đạo, sức chiến đấu các cơ quan lãnh đạo, cơ quan quản lý, của tổ chức cơ sở đảng trong cơ quan chủ quản, cơ quan báo chí chưa được phát huy. Ngày 31-07-2008, Trung ương Đảng ban hành Chỉ thị số 25-CT/TƯ về "Tăng cường công tác xây dựng Đảng trong các cơ quan báo chí". Chỉ thị chỉ rõ:
Nguyên nhân của những yếu kém khuyết điểm, là do công tác quản lý bị buông lỏng, chỉ đạo bị động, chưa theo kịp sự phát triển nhanh chống, đa dạng, phức tạp của báo chí; công tác xây dựng Đảng trong các cơ quan báo chí chưa được coi trọng đúng mức; vai trò lãnh đạo của tổ chức cơ sở đảng, trách nhiệm, tính chiến đấu của đội ngũ đảng viên và người đứng đầu cơ quan báo chí chưa được đề cao [38, tr.2].
Các chỉ thị, nghị quyết của Trung ương, địa phương được triển khai, thực hiện có nơi chưa đạt yêu cầu, thiếu kiểm tra, đôn đốc. Các vấn đề nâng cao năng lực lãnh đạo, sức chiến đấu của tổ chức cơ sở đảng trong cơ quan báo chí; chính sách tài chính; phương pháp lãnh đạo, quản lý báo chí; việc xem xét để bổng sung Luật sửa đổi báo chí và văn bản liên quan đến lĩnh vực này chưa được quan tâm đúng mức, không theo kịp bước phát triển phong phú, sôi động và có phần phức tạp của báo chí.
Vẫn còn thiếu sự thống nhất giữa các cơ quan chủ quản, cơ quan lãnh đạo, quản lý báo chí trong một số vần đề cụ thể. Việc nhận xét, đánh giá các mặt ưu điểm và khuyết điểm về nội dung thông tin trên báo chí có lúc chưa thống nhất, gây khó khăn trong việc xử lý.
Công tác đào tạo, bồi dưỡng cán bộ chủ chốt, phóng viên trong các cơ quan báo chí chưa thật sự tốt. Như chúng ta đã biết, trình độ dân trí ĐBSCL được xem là vùng trũng đối với mặt bằng chung cả nước, trong đó đội ngũ những người làm báo không phải là trường hợp ngoại lệ. Chỉ tính riêng lực lượng làm báo Đảng ĐBSCL, hiện nay có 587 người, trong đó có trên 61% là trình độ đại học, 0,5% trình độ trên đại học. Nếu tính riêng bộ phận trực tiếp làm nghiệp vụ thì chỉ có trên 36% tốt nghiệp đại học, trong đó gần 23% tốt nghiệp đại học báo chí. Số người chỉ có bằng THPT, chưa có bằng đại học nào chiếm đến 23%. Về trình độ chính trị, trong tổng số 587 người đang làm việc tại các tờ báo Đảng khu vực ĐBSCL có khoảng 14% đạt trình độ cao cấp chính trị và cử nhân chính trị, trên 36% đạt trình độ trung cấp chính trị. Chính tỷ lệ chưa được đào tạo chuyên ngành còn chiếm khá cao và tỷ lệ đạt trình độ chính trị thấp nên tính chuyên nghiệp trong các cơ quan báo chí địa phương còn thấp, dẫn đến sản phẩm báo chí còn nghèo nàn về chất lượng chính trị, tư tưởng, văn hóa... Báo chí là một nghề đặc thù, người làm báo phải có những hiểu biết tương đối cao về các vấn đề trong đời sống xã hội, kể cả việc nhận thức về chính trị. Trong khí đó công tác đào tạo, bồi dưỡng nângl cao trình độ lý luận chính trị, nghiệp vụ chuyên môn cho cán bộ báo chí chưa được quan tâm đúng mức. Đặc biệt còn có tổng biên tập cơ quan báo chí vẫn chưa có bằng chuyên môn, nghiệp vụ. Điều này không đúng với nội dung Quyết định số 75-QĐ/TW ngày 21.08.2007 của Ban Chấp hành Trung ương "Về việc ban hành quy chế bổ nhiệm, miễn nhiệm, khen thưởng,
kỷ luật cán bộ lãnh đạo cơ quan báo chí". Trong Điều 6, tiết 2 ghi rõ: "Tốt nghiệp đại học; đã được đào tạo, bồi dưỡng về nghiệp vụ báo chí và chương trình quản lý nhà nước về báo chí; có trì độ lý luận chính trị cáo cấp; có thời gian hoạt động trong lĩnh vực báo chí ít nhất là 3 năm" [37, tr. 5]. Từ đó có thể thấy rằng, việc thực hiện các văn bản chỉ đạo của cấp trên ở địa phương vẫn còn nhiều sai sót, buông lỏng, thiếu kiểm tra.