Trong tiến trình xây dựng và hoàn thiện pháp luật kinh tế thị trƣờng định hƣớng xã hội chủ nghĩa là một quá trình lâu dài, “va chạm” và “xung đột” giữa hệ thống pháp luật cũ và mới trong quá trình cải cách cũng đƣa đến một số ảnh hƣởng không nhỏ đến tình hình tham nhũng và tội phạm tham nhũng ở Việt Nam. Cụ thể là:
Thể chế về quản lý kinh tế - xã hội còn nhiều sơ hở dễ bị lợi dụng để tham nhũng nhƣ: Thể chế và thủ tục quản lý, sử dụng đất đai, tài nguyên khoáng sản; thu - chi ngân sách, đầu tƣ, mua sắm công; quản lý doanh nghiệp nhà nƣớc; quan hệ giữa cơ quan quản lý nhà nƣớc với ngƣời dân, doanh nghiệp còn nhiều sơ hở, dễ nảy sinh tiêu cực, tham nhũng; công tác cải cách hành chính chƣa đạt yêu cầu đề ra, một số thủ tục hành chính còn gây phiền hà cho tổ chức và ngƣời dân; việc đổi mới và áp dụng công nghệ hiện đại vào quản lý nhằm phòng ngừa tham nhũng chƣa đƣợc chỉ đạo thực hiện kiên quyết; tình trạng xin - cho, nhất là trong phân bổ nguồn lực chƣa đƣợc khắc phục.
Một số quy định pháp luật về phòng, chống tham nhũng chƣa phù hợp, thiếu đồng bộ, chƣa đủ chặt chẽ còn có những hạn chế (quy định về kê khai tài sản có những điều chƣa hợp lý nhƣ: Việc xác minh để bảo đảm tính trung thực của bản kê khai; việc công khai bản kê khai; việc kiểm soát thu nhập của ngƣời có chức vụ, quyền hạn…).
Các quy định pháp luật về phát hiện, xử lý tham nhũng chủ yếu mới đề cập đến việc chống oan, sai, chƣa chú ý đúng mức đến việc phát hiện, xử lý những trƣờng hợp bỏ lọt tội phạm tham nhũng.
Cán bộ là khâu then chốt quyết định sự thành công của công cuộc đấu tranh phòng, chống tham nhũng. Tuy nhiên, nhiều quy định pháp luật, cơ chế, chính sách về công tác cán bộ chƣa theo kịp đòi hỏi phòng, chống tham nhũng trong tình hình mới dẫn đến một bộ phận không nhỏ cán bộ, đảng viên giữ vị trí lãnh đạo, quản lý có biểu hiện suy thoái đạo đức, lối sống (chạy theo danh lợi, tiền tài, tham nhũng), phai nhạt lý tƣởng.