NHTM Agribank được tổ chức theo mô hình tổng công ty và các công ty con gồm NH mẹ và hệ thống các NH chi nhánh trực thuộc. Có một phương thức là chu chuyển vốn điều hòa, do tình hình hoạt động của các chi nhánh khác nhau là khác nhau cho nên những chi nhánh NH mà hoạt động sử dụng vốn vượt quá khả năng huy động vốn thì đầu kỳ lập kế hoạch lên NH mẹ và xin được nhận một lượng vốn điều hòa cần thiết cho hoạt động của mình. NH phải tốn chi phí nguồn vốn điều hòa cao hơn vốn huy động và các ngân hàng này chỉ được nhận nguồn vốn này sau khi đã lập kế hoạch về lượng vốn huy động được trong kỳ sau.
Nguồn vốn huy động có tăng nhưng không đáp ứng đủ nhu cầu vay và các hoạt động khác của chi nhánh nên vốn điều chuyển tăng lên để đáp ứng nhu cầu cho vay của các doanh nghiệp thủy sản trên địa bạn huyện. Bên cạnh đó người dân ở huyện Châu Thành chủ yếu sống bằng nghề nông, có tập quán sản xuất lúa và khai thác thủy hải sản, nhu cầu về vay vốn rất nhiều nên lượng vốn chi nhánh đã vay vốn điều chuyển để đáp ứng nhu cầu vay vốn của người dân. Vốn điều chuyển của chi nhánh tăng đều qua các năm và chiếm hơn 55% tỷ trọng nguồn vốn. Vào năm 2012 nguồn vốn điều chuyển là 335.951 triệu tăng 4,8% so với năm 2011, đến năm 2103 là 365.891 triệu đồng tăng gần 9% so với năm 2013. Vào năm 2013 tình hình khai thác thủy sản rất thuận lợi, đã thu hút một lượng lớn người dân tham gia hoạt động khai thác thủy sản, một
phần mở rộng quy mô đánh bắt từ 2 tàu lên 4 tàu,… vì thế có rất nhiều hợp đồng cho vay phục vụ khai thác thủy sản như: cho vay vốn hỗ trợ đóng tàu thuyền, vay tiền mua ngư cụ phục vụ khai thác, mà vốn tại chi nhánh chỉ đáp ứng đủ một phần vì thế chi nhánh đã chủ động vay vốn điều chuyển. Trong thời gian tới, chi nhánh nên cải thiện việc huy động vốn để giảm bớt tỷ trọng của vốn điều chuyển và chủ động hơn trong hoạt động đầu tư, cấp tín dụng,…