Để duy trì sự phát triển kinh tế biển bền vững, yếu tố đóng vai trò quan trọng nhất là phải có chương trình, cơ chế quản lý các ngành, các lĩnh vực kinh tế biển một cách chặt chẽ, hợp lý, đồng bộ, có chất lượng và hiệu quả.
Việc quản lý phát triển mảng kinh tế biển của tỉnh trong thời gian qua còn nhiều hạn chế nên trong thời gian tới cần có định hướng và các biện pháp hữu hiệu nhằm nâng cao chất lượng và hiệu quả quản lý kinh tế biển.
Tăng cường nâng cao chất lượng đội ngũ cán bộ quản lý các ngành kinh tế biển kết hợp với xây dựng kế hoạch thu hút nhân tài, đào tạo nguồn nhân lực chất lượng cao bổ sung trong tương lai.
Quản lý phát triển kinh tế biển trên nguyên tắc hài hòa giữa phát triển kinh tế với nâng cao chất lượng cuộc sống người dân và bảo vệ hiệu quả nguồn tài nguyên cũng như bảo vệ tốt môi trường sinh thái biển, ven biển; đảm bảo sự phát triển hài hòa giữa các ngành, các lĩnh vực kinh tế biển.
Có quy hoạch ngắn hạn và dài hạn để phát triển kinh tế biển theo từng giai đoạn cụ thể. Tăng cường công tác kiểm tra, rà soát để điều chỉnh và bổ sung quy hoạch phát triển kinh tế biển một cách hợp lý.
Có cơ chế quản lý đủ mạnh để quản lý hiệu quả việc khai thác với bảo vệ, tái tạo nguồn tài nguyên biển và bảo vệ môi trường sinh thái.
Có sự phối hợp liên ngành, liên vùng trong phát triển kinh tế biển để tạo được sự phát triển đồng bộ, thống nhất.
Nâng cao khả năng ứng dụng công nghệ tiên tiến trong quản lý, phát triển kinh tế biển.