Những điểm protein khác biệt, kể cả những protein biểu hiện tăng/giảm trong mô gan bệnh nhân ung thư gan đều là những đặc trưng về bệnh và có thể là những protein chỉ thị ung thư. Kết hợp xác định protein bằng MALDI-TOF MS và tra cứu cơ sở dữ liệu, chúng tôi đã nhận dạng được 38 protein biểu hiện khác biệt giữa mô gan ung thư so với mô gan bình thường. Để tìm hiểu mối liên quan của các protein này với ung thư, chúng tôi đã tìm kiếm trên cơ sở dữ liệu về protein [51], từ đó xác định được chức năng chính của protein và mô tả sơ lược, phân nhóm các protein như trong bảng 10 và hình 14.
48
Bảng 10. Tóm tắt chức năng chính của các protein biểu hiện khác biệt giữa mô gan ung thư so với mô gan đối chứng đã đươc nhận dạng
Ptotein
Chức năng chính
Protein liên quan đến chu trình tế bào, tăng sinh tế bào và apoptosis: 5 protein
Protein ST7L Ức chế phát triển khối u
Metastasis related protein Protein liên quan đến quá trình di căn Protein Neuropolypeptide h3 Ức chế hoạt động của protein Raf
Protein p53 Protein ức chế khối u, điều hòa sự tăng sinh tế bào, kiểm
soát chu trình tế bào và apoptosis Proliferating cell nuclear antigen
(PCNA)
Tăng sinh tế bào, điều khiển sao chép DNA, sửa chữa DNA
Protein liên quan đến quá trình miễn dịch và bảo vệ cơ thể: 11 protein
Protein sốc nhiệt beta-1 (HSPB1/HSP27)
Đáp ứng lại stress, nhiễm virus, kích thích sản xuất interleukin-1
HSP60 Tương tác vật chủ - virus, hoạt hóa tế bào T, kích thích
tế bào B sản xuất cytokine, than gia cuộn gấp protein. Kháng nguyên MHC lớp I Trình diện kháng nguyên nội sinh
Interleukin-32 Tham gia đáp ứng miễn dịch, kích thích sinh ra IL-8,
yếu tố hoại tử mô (TNFA) Immunoglobulin G heavy chain
variable region
Cấu tạo phân tử Ig
T cell receptor alpha chain Tham gia nhận dạng kháng nguyên
Peroxiredoxin 2 Chống lại các stress oxy hóa
Alpha-1-antitrypsin Ức chế protease nhóm serine, tham gia quá trình đông máu
Haptoglobin Liên kết với Hemoglobin
Superoxide dismutase [Cu-Zn] Phá hủy gốc tự do bảo vệ cơ thể Superoxide dismutase [Mn] Phá hủy gốc tự do bảo vệ cơ thể
Protein tham gia cấu trúc tế bào: 2 protein
49
Microfibrillar-associated protein 3 (MFAP3)
Liên quan đến microfibri, tham gia cấu tạo tế bào
Protein tham gia các quá trình trao đổi chất: 10 protein
Aldehyde Dehydrogenase Chuyển hóa rượu, phân giải ethanol
Enoyl-CoA hydratase Trao đổi lipid
Glutamine synthetase (GS) Chuyển hóa glutamate, dẫn truyền thần kinh (có liên quan đến quá trình tăng sinh tế bào)
Glutamate dehydrogenase Truyền xung thần kinh
Apolipoprotein L2 Chuyển hóa và vận chuyển lipid
3-ketoacyl-CoA thiolase Chuyển hóa lipid và acid béo
UMP-CMP kinase (KYC) Chuyển gốc phosphate từ ATP sang UMP và CMP, tổng
hợp Pyrimidin Glyceraldehyde-3-phosphate
dehydrogenase (G3P)
Tham gia quá trình đường phân, vận chuyển các chất qua màng tế bào.
AP-2 complex subunit alpha-1 Vận chuyển protein
Cathepsin D (CATD) Proteinase nội bào
Protein tham gia vào quá trình phiên mã, dịch mã, cải biến: 10 protein
Protein PDIA3 Tái sắp xếp liên kết S-S
Protien PDIA1 Phá vỡ và tái tạo liên kết S-S
Yếu tố phiên mã Ca150 Điều hòa phiên mã
Yếu tố phiên mã EC Điều hòa phiên mã
BAT2 protein (Protein PRRC2A) Tham gia ghép nối tiền mARN
Protein Peregrin Điều hòa phiên mã gene RUNX1, RUNX2, tham gia
acetyl hóa Histone H3
Zinc finger protein Gắn với DNA tại vị trí liên kết với yếu tố phiên mã Heterogeneous nuclear
ribonucleoprotein L-like
Chế biến mARN (cắt nối luân phiên)
REST corepressor 1 (Protein CoREST)
Tham gia phiên mã và điều hòa phiên mã, tương tác virus - vật chủ.
50
Căn cứ vào chức năng chính của protein, các protein có biểu hiện khác biệt giữa mô gan ung thư so với mô gan bình thường được nhóm thành 5 nhóm khác nhau dựa vào quá trình sinh học mà protein tham gia. Tỷ lệ protein thuộc 5 nhóm này không đồng đều (hình 14), trong đó, các protein tham gia vào quá trình quá trình miễn dịch và bảo vệ cơ thể chiếm tỷ lệ cao nhất (~ 29%) và các protein tham gia cấu trúc tế bào chiếm tỷ lệ thấp nhất (~5%).
Hình 14. Tỷ lệ các nhóm protein tham gia vào các quá trình sinh học khác nhau
Dựa vào kết quả nhận dạng protein, chúng tôi thấy có nhiều loại protein biểu hiện khác nhau giữa mô gan ở trạng thái bình thường và bệnh lý. Sự thay đổi mức độ biểu hiện của các protein có thể là nguyên nhân dẫn đến rối loạn hoạt động tế bào đưa đến tình trạng ung thư, hoặc cũng có thể là hậu do quá trình tăng sinh tế bào mang lại. Do đó, các protein biểu hiện khác biệt giữa mô gan ung thư và mô gan bình thường, đặc biệt là các protein có phản ứng miễn dịch với huyết tương của chính bệnh nhân HCC đều có thể trở thành protein chỉ thị cho ung thư gan. Dưới đây là sự mô tả chức năng của một số protein có liện hệ mật thiết với tình trạng ung thư tế bào.