10 A/Duck/VNBN/06/12 Vịt Bắc Ninh 24/02/
3.2.4. Trình tự axit amin tại cleavage site của chủng phân lập
Thành phần và trình tự amino acid kiềm tại ñiểm cắt (HA0 clevaege site) tách H1 và H2 protein mã hóa trong gene H là một trong những ñặc ñiểm nhận dạng vi rút cúm gia cầm có ñộc lực cao hay thấp. Trình tự nucleotide và axit amin tại cleavage site của 10 chủng vi rút sử dụng trong nghiên cứu này ñược trình bày ở bảng 3.6.
Bảng 3.6. Trình tự Amino acid tại cleavage site
TT Tên chủng Amino acide
1 A/Duck/VNNB/03/10 PQRERRRKRGLF 2 A/Ck/VNVP/03/11 PQRERRRKRGLF 2 A/Ck/VNVP/03/11 PQRERRRKRGLF 3 A/Ck/VNHD/04/11 PQRERRRKRGLF 4 A/Ck/VNQT/06/11 PQRERRRKRGLF 5 A/Duck/VNHD/07/11 PQRERRRKRGLF 6 A/MD/VNHD/01/12 PQRERRRKRGLF 7 A/Ck/VNVP/03/12 PQRERRRKRGLF 8 A/Ck/VNTB/10/12 PQRERRRKRGLF 9 A/Ck/VNHP/05/12 PQRERRRKRGLF 10 A/Duck/VNBN/06/12 PQRERRRKRGLF
Theo khuyên cáo của OFFLU, hoàn toàn có thể nhận dạng vi rút cúm gia cầm thể ñộc lực cao qua clevaege sitẹ Trình tự của HA0 clevaege site của các vi rút cúm gia cầm ñược chia thành hai nhóm ñộc lực cao và thấp, tùy thuộc vào số lượng axit amin kiềm (Offlu, 2013).
Cả 10 chủng vi rút trong nghiên cứu này ñều có clevaege site là
PQRERRRKRGLF 10 axit amin kiềm, cho thấy, ñặc tính chủng ñộc lực cao do
ñặc tính di truyền của clade 2.3.2.1 quyết ñịnh, trình tự 10 axit amin kiềm này hoàn toàn phù hợp với clevaege site của H5N1 Eurasian-African lineagẹ
Trường ðại học Nông nghiệp Hà Nội – Luận văn thạc sỹ khoa học Nông nghiệp ……… 51 Kết quả ở bảng 3.5 và 3.6 cho biết 10 chủng vi rút phân lập sử dụng trong nghiên cứu này có chỉ số IVPI lớn hơn 1.2 và trình tự axit amin tại HA0 ñặc thù của chủng vi rút cúm gia cầm có ñộc lực cao phù với các tiêu chí của OIẸ