giải trình tự chuỗi gen 18s ribosome

... pháp giải trình tự chuỗi xem có nhiều ưu điểm bật bên cạnh việc xác định trình tự chuỗi Nucleotids gen HBV để từ so sánh với thư viện gen xác định HBV genotypes mà dựa vào kết giải trình tự xác ... Việc xác định thứ tự Nu gắn kết với dọc theo chiều dài gen (DNA) gọi việc giải trình tự chuỗi (Sequencing), trình tự gắn kết Nu gọi trình tự chuỗi (Sequence) Cấu tạo gen HBV HBV có gen phân tử DNA, ... Khi điện di gel có độ ly giải cao ta có trình tự Nu, dựa vào phần mềm máy cho trình tự chuỗi DNA HBV So sánh thư viện gen máy tính se cho ta biết kiểu gen vi rút kiểu gen đột biến công bố HBV...

Ngày tải lên: 22/07/2014, 07:21

... phân loại HBV genotypes cần dựa trình tự chuỗi (sequence) đoạn gen HBV phần trình tự chuỗi gen pre-S; S Có nhiều phương pháp nghiên cứu dùng việc xác định HBV genotypes giải trình tự chuỗi (sequencing), ... pháp giải trình tự chuỗi xem có nhiều ưu điểm bật bên cạnh việc xác định trình tự chuỗi Nucleotids gen HBV để từ so sánh với thư viện gen xác định HBV genotypes mà dựa vào kết giải trình tự xác ... xác định thứ tự Nu gắn kết với dọc theo chiều dài gen (DNA) gọi việc giải trình tự chuỗi (Sequencing), trình tự gắn kết Nu gọi trình tự chuỗi (Sequence) 2, CẤU TẠO BỘ GEN HBV: HBV có gen phân tử...

Ngày tải lên: 27/07/2014, 10:21

... Acrylamide với hệ thống OpenGene Tín hiệu tự động thu nhận từ hệ thống điện di phần mềm máy tính xếp trình tự chuỗi mẫu, trình tự chuỗi so sánh với thư viện gen (Gene Librarian) có sẵn cung cấp ... kết với 122 trường hợp thực giải trình tự chuỗi có 76 trường hợp (62,3%) kiểu gen B 46 trường hợp (37,7%) kiểu gen C Trong 122 trường hợp thực giải trình tự chuỗi (HBV DNA dương tính) chúng tơi ... HBV dựa vào nghiên cứu gen HBV phân HBV thành loại đặt tên từ A đến H dựa vào khác 8% tồn bộ gen HBV Có nhiều kỹ thuật dùng để xác định kiểu gen HBV kỹ thuật giải trình tự chuỗi (Sequencing), đa...

Ngày tải lên: 27/07/2014, 11:20

... Acrylamide với hệ thống OpenGene Tín hiệu tự động thu nhận từ hệ thống điện di phần mềm máy tính xếp trình tự chuỗi mẫu, trình tự chuỗi so sánh với thư viện gen (Gene Librarian) có sẵn cung cấp ... với kết với 122 trường hợp thực giải trình tự chuỗi có 76 trường hợp (62,3%) kiểu gen B 46 trường hợp (37,7%) kiểu gen C Trong 122 trường hợp thực giải trình tự chuỗi (HBV DNA dương tính) chúng ... dựa vào nghiên cứu gen HBV phân HBV thành loại đặt tên từ A đến H dựa vào khác 8% toàn bộ gen HBV4,6,8 Có nhiều kỹ thuật dùng để xác định kiểu gen HBV8,13 kỹ thuật giải trình tự chuỗi (Sequencing),...

Ngày tải lên: 01/08/2014, 18:21

... ảnh) Gen ABL có 11 exon, exon có biến thể với trình tự chuỗi khác gọi exon 1a exon 1b Trong trình tạo thành tổ hợp gen với BCR, từ exon exon đến exon 11 ABL gắn với gen BCR (Hình 1.2) Trình tự chuỗi ... việc sử dụng trình tự chuỗi chuẩn để phân tích đột biến biến thể a hay b không ảnh hưởng đến kết nghiên cứu Phần mềm SeqScape sử dụng để so sánh trình tự chuỗi DNA bệnh nhân với trình tự chuẩn ABL ... R1 Hình 2.1: Cấu trúc gen BCR/ABL vùng ATP binding ABL 15 CHƢƠNG III: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 Nội dung 1: Xây dựng quy trình chẩn đốn đột biến gen BCR/ABL giải trình tự chuỗi DNA từ mẫu tủy xƣơng...

Ngày tải lên: 04/07/2015, 14:47

... 3.4.6 Giải trình tự chuỗi gen 18S ribosome Sau tinh sạch, sản phẩm gửi cho hãng MACROGEN Hàn Quốc để xác định trình tự 3.4.7 Xử lý chuỗi gen phân tích số liệu Chuỗi nucleotide thu sau giải trình tự ... đoạn DNA cần khuếch đại 2.3.3 Phương pháp giải trình tự Sản phẩm PCR sau tinh giải trình tự trực tiếp máy giải trình tự tự động Nguyên lý: giải trình tự DNA tự động dựa theo nguyên lý phương pháp ... http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST để thu nhận chuỗi gen 18S ribosome tương đồng cao có Ngân hàng gen So sánh đối chiếu trình tự nucleotide chuỗi gen nghiên cứu với chuỗi gen công bố Ngân hàng gen chương trình GENEDOC2.7 Khảo...

Ngày tải lên: 15/11/2016, 10:59

... thấy, trình tự nucleotide chuỗi gen sau giải trình tự liên tục, rõ ràng, có chứa trình tự mồi xi (HTA6F) mồi ngược (HTA4R) phần đầu cuối chuỗi gen, với trình tự mồi thiết kế Như vậy, trình tự đoạn ... nucleotide giải trình máy giải trình trình tự tự động 2.3.9 Phƣơng pháp phân tích xử lý số liệu Trình tự DNA thu nhận từ máy giải trình tự, cung cấp hai dạng: chuỗi nucleotide thô dạng chữ (.txt) chuỗi ... cho giải trình tự DNA * Kết giải trình tự DNA: Plasmid tái tổ hợp gửi giải trình tự Hàn Quốc (Macrogen, Hàn Quốc) - ộ dài tương đối lớn, nên mồi bám nộ 3F-JB4,5R (Bảng 2.1) sử dụng để giải trình...

Ngày tải lên: 16/08/2015, 17:56

... tế bào MARC – 145 36 2.5.4 Giải trình tự phân tích liệu trình tự gen ORF5 39 2.5.4.1 Giải trình tự DNA 39 2.5.4.2 Phân tích liệu trình tự gen ORF5 39 2.5.5 Phƣơng ... – Qiagen 2.5.4 Giải trình tự phân tích liệu trình tự gen ORF5 2.5.4.1 Giải trình tự DNA Sản phẩm DNA phản ứng RT - PCR sau tinh kit tinh gel QIAquick PCR Purification Kit - Qiagen (quy trình ... sản xuất) đƣợc gửi tới công ty Macrogen (Hàn Quốc) để giải trình tự gen 38 2.5.4.2 Phân tích liệu trình tự gen ORF5 Xác định nguồn gốc chủng PRRSV dựa sở gen ORF5 chủng thu nhận đƣợc phƣơng pháp...

Ngày tải lên: 19/03/2016, 09:18

... Blood Midi kit (QIAGEN) Chuẩn bị thư viện DNA Nextera XT (Illumina) Giải trình tự MiSeq (Illumina) với kích thước trình tự đọc 2x150 bp PHƯƠNG PHÁP (Spades) (Ragout) Chú giải gene (Res finder, ... ĐÍCH Xác định gene kháng kháng sinh cơng cụ tin sinh học từ liệu giải trình gene chủng A baumannii đa kháng phân lập lâm sàng • Lắp ráp gene phác thảo chủng A baumannii • Dò tìm gene kháng kháng ... thấp: dacC, dacD pbpG • Gene mtgA Porin: CarO, Opr 33-36, HMP-AB Không đột biến 16 Dự Đoán Gene Kháng Kháng Sinh Tiềm Năng  Enzyme: gene thuộc lớp metallo-beta-lactamase gene thuộc beta-lactamase...

Ngày tải lên: 19/04/2017, 23:15

... tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự tồn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước ngồi chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen ... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... đại gen HP1125 phương pháp PCR M Thang chuẩn ADN 100 cặp bazơ Sản phẩm PCR có kích thướckhoảng 540 cặp bazo kiểm tra phương pháp điện di Kết giải trình tự Sản phẩm PCR, sau làm giải trình tự trực...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

... tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự tồn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước ngồi chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen ... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... đại gen HP1125 phương pháp PCR M Thang chuẩn ADN 100 cặp bazơ Sản phẩm PCR có kích thướckhoảng 540 cặp bazo kiểm tra phương pháp điện di Kết giải trình tự Sản phẩm PCR, sau làm giải trình tự trực...

Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19

... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen ... c) Ghi chú: ñ dài gen h gen tính b ng bp; 5’UTR 3’UTR: ph n khơng mã hóa đ u cu i h gen; Lelystad: ch ng đ i di n dòng châu Âu (genotype I); VR-2332: ch ng đ i di n dòng B c M (genotype II); GD*:...

Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10

... pGEM -3Z mang gen novS 2.2.7 Giải trình tự gen Để giải trình tự gen ta tiến hành tách plasmid tái tổ hợp pGEMnovS tế bào vi khuẩn E.coli XL1 Blue biến nạp trên, sau gửi giải trình tự 2.2.8 Tạo ... 12: 10a So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAF67512.1 10b So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAN65241.1 10c So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAG29801.1 ... Nghiệp K13 Viện Đại Học Mở Hà Nội 3.1.3 Kết xác định trình tự đoạn gen NovS Đoạn gen novS plasmid pGEM -3Z đuợc giải trình tự Kết giải trình tự gen novS sau: ATTGGAGCTCACCGCGGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGGATCCCCCGGGCTGCAG...

Ngày tải lên: 25/12/2013, 12:42

... Các phương pháp giải trình tự gen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trình tự gen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giải trình tự gen sử dụng phương pháp họ đọc hàng triệu bp ngày ... ddTTP C T A G Đoạn ADN cần giải trình tù Måi Sequencing 3’ 5’ ……….CCTATGGAATGC- èng ph¶n øng A * * ** * ph¶n øng C èng * ** èng ph¶n øng G * * èng ph¶n øng T ** Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng...

Ngày tải lên: 18/02/2014, 10:20

... Thịnh NỘI DUNG Khái niệm giải trình tự gen ý nghĩa GTTG Phương pháp giải trình tự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động So sánh phương ... pháp giải trình tự gen tự động Bước 1: Chuẩn bị (DNA khn, dNTP ddNTP có gắn màu quỳnh quang, enzyme, mồi…) Bước 2: Nhân DNA PCR Bước 3: Nạp sản phẩm PCR vào máy giải trình tự gen chạy máy giải trình ... phát màu, màu ứng với nucleotide hiển thị đỉnh 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đọc kết 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động ABI Automated Sequencers (contd.) ABI 310 Capillary ABI...

Ngày tải lên: 06/03/2014, 05:22

... ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy ... paratyphi B trªn GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm vùng đặc trng cho loài, FliC - a lµ gen FliC cđa ... ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thøc víi sè truy cËp lµ AY657000 vµ AY657001 Sau ®©y xin giíi thiƯu gen FliC cđa Salmonella paratyphi B (H×nh 1) H×nh Gen FliC...

Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20

Ngày tải lên: 03/04/2014, 08:20

... bị giải trình tự hệ Roche 01 máy khối phổ để phân tích cấu trúc chức protein Thiết bị giải trình tự Roche giải trình tự đoạn DNA có kích thước đến 800 nucleotide Ngồi mục tiêu giải trình tự phân ... 10/1998 Trình tự DNA 95% vùng chứa gen 99% vùng chứa gen Tháng 4/2003 trình tự gen người trình tự gen người hồn thành với độ hồn thành với độ xác tới 99,99% xác 99,99% Cơng suất giá 500 Mb trình tự/ ... Để tìm trình tự hệ gen hồn chỉnh người với hệ thống giải trình tự tại, cần phải giải trình tự DNA người tương đương với khoảng 30 lần (30X) Nếu trình tự thực trung bình lần dọc theo hệ gen (1X)...

Ngày tải lên: 20/04/2014, 13:32

... Sản phẩm giải trình tự làm tủa tinh phương pháp tủa với ethanol Cuối thực giải trình tự máy sequencer CEQ8000 Becman Coulter Kết giải trình tự phân tích phần mềm phân tích giải trình tự CEQ8000 ... tính xác kết định genotype HCV phát triển khơng khác kết định genotype kỹ thuật giải trình tự Trugene đọan trình tự đích phương pháp chúng tơi đọan trình tự đích phương pháp Trugen gần phù hợp ... phylogenetic Thư viện HCV thư viện xây dựng sẵn người dùng cập nhật thêm kết (thực máy giải trình tự Trugene) vào thư viện này, lấy thư viện bên ngòai khơng thể đăng nhập trình tự có từ máy giải trình...

Ngày tải lên: 01/08/2014, 03:21