Xây dựng quy trình sản xuất mẫu bệnh phẩm giả định dùng trong ngoại kiểm vi sinh

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - LÊ NGỌC MINH TRÂN XÂY DỰNG QUY TRÌNH SẢN XUẤT MẪU BỆNH PHẨM GIẢ ĐỊNH DÙNG TRONG NGOẠI KIỂM VI SINH LUẬN VĂN THẠC SĨ Chuyên ngành Xét Nghiệm BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƢỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - LÊ NGỌC MINH TRÂN XÂY DỰNG QUY TRÌNH SẢN XUẤT MẪU BỆNH PHẨM GIẢ ĐỊNH DÙNG TRONG NGOẠI KIỂM VI SINH LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT Y HỌC Chuyên ngành Xét Nghiệm Mã số: 60720333 NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS TS BS VŨ QUANG HUY THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH – NĂM 2017 i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu luận văn hoàn toàn trung thực chƣa đƣợc cơng bố cơng trình khác Tác giả LÊ NGỌC MINH TRÂN ii MỤC LỤC Trang LỜI CAM ĐOAN I MỤC LỤC II DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT IV DANH MỤC BẢNG VI DANH MỤC BIỂU ĐỒ VII DANH MỤC HÌNH IX ĐẶT VẤN ĐỀ CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 ĐẠI CƢƠNG VỀ VI KHUẨN 1.2 CÁC KỸ THUẬT VI SINH LÂM SÀNG 1.3 QUẢN LÝ CHẤT LƢỢNG XÉT NGHIỆM VI SINH LÂM SÀNG 18 CHƢƠNG 2: ĐỐI TƢỢNG - PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 2.1 THIẾT KẾ NGHIÊN CỨU 22 2.2 ĐỐI TƢỢNG NGHIÊN CỨU 23 2.3 AN TOÀN VÀ THỰC HÀNH TRONG NGHIÊN CỨU 23 2.4 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 24 2.5 PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 26 2.6 THỬ NGHIỆM ĐÁNH GIÁ ĐỘ ĐỒNG NHẤT VÀ ỔN ĐỊNH CỦA CÁC MẪU BỆNH PHẨM GIẢ ĐỊNH 32 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 35 3.1 KẾT QUẢ NỘI KIỂM TRA 35 3.2 KẾT QUẢ ĐÁNH GIÁ MẪU TIÊU BẢN 37 iii 3.3 KẾT QUẢ ĐÁNH GIÁ MẪU PHÂN GIẢ ĐỊNH 41 3.4 KẾT QUẢ ĐÁNH GIẢ MẪU MỦ GIẢ ĐỊNH 51 CHƢƠNG 4: BÀN LUẬN 62 4.1 QUY TRÌNH SẢN XUẤT THỬ NGHIỆM 62 4.2 MẪU TIÊU BẢN VI KHUẨN 72 4.3 MẪU PHÂN GIẢ ĐỊNH 73 4.4 MẪU MỦ GIẢ ĐỊNH 77 KẾT LUẬN 83 KIẾN NGHỊ 84 TÀI LIỆU THAM KHẢO I PHỤ LỤC 1: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH ANOVA CỦA MẪU PHÂN GIẢ ĐỊNH XI PHỤ LỤC 2: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH ANOVA CỦA MẪU MỦ GIẢ ĐỊNH XVII iv DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Từ tiếng Việt ATSH An toàn sinh học C Cầu khuẩn gram dƣơng CSVC Cơ sở vật chất Đ Độ tiêu ĐHYD Đại Học Y Dƣợc Thành phố hồ Chí Minh KS Kháng sinh KST Ký sinh trùng M Màu sắc nhuộm tiêu NK Ngoại kiểm PXN Phòng xét nghiệm y học QT Quy trình T Trực khuẩn gram âm TTKC Trung tâm kiểm chuẩn chất lƣợng xét nghiệm y học VK Vi khuẩn v Từ nước AMP Ampicillin API Analytical profile index ATCC American Type Culture Collection ATM Aztreonam AUG Amoxicillin/Clavulanic BA Blood Argar BHI Brain heart infusion CAZ Ceftazidime CFU Colony-forming unit CIP Ciprofloxacin CLSI Clinical Laboratory Standard Institute CRO Ceftriaxone CTX Cefotaxime E coli Escherichia coli EQA External Quality Assessment HCAI Health Care-Associated Infection K pneumoniae Klebsiella pneumoniae MC MacConkey MHA Mueller Hinton Agar PEF Cefepime S aureus Staphylococcus aureus S flexneri Shigella flexeneri SS Salmonella - Shigella SXT Trimethoprim-sulfamethoxazole WHO World health organization vi DANH MỤC BẢNG Trang Bảng 2.1 Các chủng thương mại dành cho nghiên cứu 23 Bảng 2.2 Danh sách trang thiết bị thực nghiên cứu 24 Bảng 2.3 Sinh phẩm - hóa chất dùng nghiên cứu 25 Bảng 2.4 Tiêu chí đánh giá tiêu [82] 32 Bảng 3.1 Kết tiêu E.coli ngày vận chuyển 39 Bảng 3.2 Kết tiêu S aureus ngày vận chuyển 40 Bảng 3.3 Kết đánh giá độ đồng S flexneri mẫu phân 41 Bảng 3.4 Kết đánh giá độ ổn định S flexneri bảo quản mẫu phân 44 Bảng 3.5 Kết đánh giá độ ổn định S flexneri vận chuyển mẫu phân 47 Bảng 3.6 Kết đánh giá độ đồng K pneumoniae mẫu mủ 51 Bảng 3.7 Kết đánh giá độ ổn định K pneumoniae bảo quản mẫu mủ 55 Bảng 3.8 Kết đánh giá độ ổn định K pneumoniae vận chuyển mẫu mủ 58 vii DANH MỤC BIỂU ĐỒ Trang Biểu đồ 1.1 Biểu đồ Shewhart dạng tỉ số z (z-socre) 21 Biểu đồ 3.1 Kết đánh giá độ đồng tiêu E coli S aureus 37 Biểu đồ 3.2 Kết tiêu S aureus đạt tiêu chí điều kiện bảo quản tuần 38 Biểu đồ 3.3 Biểu diễn z-score nồng độ S flexneri gram mẫu phân giả định 42 Biểu đồ 3.4 Biểu diễn z-score đường kính nhạy Ampicillin (A), Ciprofloxacin (B), SXT (C) S flexneri đánh giá đồng 43 Biểu đồ 3.5 Biểu diễn thay đổi nồng độ S flexneri gram phân qua tuần bảo quản 45 Biểu đồ 3.6 Biểu diễn độ nhạy với Ampicillin (AMP), Ciprofloxacin (CIP), SXT S flexneri điều kiện bảo quản 14 ngày 46 Biểu đồ 3.7 Nồng độ S flexneri vận chuyển tuần 49 Biểu đồ 3.8 Biểu diễn độ nhạy với Ampicillin (A), Ciprofloxacin (B), SXT (C) S flexneri điều kiện vận chuyển tuần 50 Biểu đồ 3.9 Kết đánh giá độ đồng K pneumoniae tính sinh hóa định danh 52 Biểu đồ 3.10 Tỉ số z-score nồng độ K pneumoniae đánh giá đồng 53 Biểu đồ 3.11 Biểu diễn tỉ số z-score đường kính nhạy Amoxicillin/Clavulanic acid (A), Cefotaxime (B), Ceftriaxone (C), Ceftazidime (D), Cefepime (E), Aztreonam (F) K pneumoniae đánh giá đồng 54 viii Biểu đồ 3.12 Đường biểu diễn nồng độ K pneumoniae mẫu mủ giả định theo thời gian 56 Biểu đồ 3.13 Biểu diễn độ nhạy với Amoxicillin/Clavulanic acid (A), Cefotaxime(B), Ceftriaxone (C), Ceftazidime (D), Cefepime (E), Aztreonam (F) K pneumoniae tuần bảo quản 57 Biểu đồ 3.14 Biểu diễn thay đổi nồng độ K pneumoniae vận chuyển 59 Biểu đồ 3.15 Biểu đồ biểu diễn đường kính nhạy với Amoxicillin/Clavulanic acid (A), Cefotaxime(B), Ceftriaxone (C), Ceftazidime (D), Cefepime (E), Aztreonam (F) K pneumoniae vận chuyển 60 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XI PHỤ LỤC 1: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH ANOVA CỦA MẪU PHÂN GIẢ ĐỊNH Bảng PL1.1: Nồng độ S flexneri gram mẫu Anova: Single Factor Groups Lô Lô Source of Variation Between Groups Within Groups Total Count 10 10 SS 0,00072 0,01016 0,01088 Sum Average Variance 77,78 77,9 7,778 7,79 0,000462 0,000667 MS 0,00072 0,000564 F 1,275591 df 18 19 P-value 0,273548 F crit 4,413873 Bảng PL1.2: Tỉ lệ định danh S flexneri Anova: Single Factor Groups Count Sum Average Variance Lô 11 898,5 81,68182 835,8596 Lô 11 872,4 79,30909 829,6409 Source of Variation SS df MS F P-value F crit Between Groups 30,96409 30,96409 0,037183 0,849038 4,351243 Within Groups 16655,01 20 832,7503 Total 16685,97 21 Bảng PL2.3: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Ampicillin S flexneri Anova: Single Factor Groups Count Sum Average Variance Lô 10 220 22 0,444444 Lô 10 220 22 0,666667 Source of Variation SS df MS F Between Groups 0 Within Groups 10 18 0,555556 Total 10 19 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn P-value F crit 4,413873 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XII Bảng PL1.4: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Ciprofloxacin S flexneri Anova: Single Factor Groups Count Sum Average Variance Lô 10 378 37,8 0,4 Lô 10 379 37,9 0,544444 Source of Variation SS df MS F P-value F crit Between Groups 0,05 0,05 0,105882 0,748634 4,413873 Within Groups 8,5 18 0,472222 Total 8,55 19 Bảng PL1.5: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Trimethoprimsulfamethoxazole S flexneri Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 336 Lô 10 339 Source of Variation SS df Between Groups 0,45 Within Groups 9,3 18 Total 9,75 19 Average 33,6 33,9 Variance 0,488889 0,544444 MS 0,45 0,516667 F 0,870968 P-value 0,363038 F crit 4,413873 Bảng PL1.6: Kết nồng độ S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance ANOVA Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 139,8067414 139,9102 7,76704119 7,772789 0,001305568 0,000795 SS 0,008798081 0,000297297 0,001764352 0,025155 0,03601473 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn df 5 24 35 MS F P-value F crit 0,00176 1,678823 0,178056 2,620654 0,000297 0,283646 0,599218 4,259677 0,000353 0,336668 0,885645 2,620654 0,001048 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XIII Bảng PL1.7: Kết định danh S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance ANOVA Source of Variation Sample Columns Interaction Within 18 1632,3 90,68333333 98,64852941 18 1606,4 89,24444 122,7626 SS 93,16805556 18,63361111 540,3747222 3130,446667 df 5 24 Total 3782,623056 35 Total 2888,209722 35 MS 18,63361 18,63361 108,0749 130,4353 F 0,142857 0,142857 0,828571 P-value 0,980305 0,708779 0,541957 F crit 2,620654 4,259677 2,620654 Bảng PL1.8: Kết nhạy Ampicillin S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance ANOVA Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 382 385 21,22222222 21,38889 0,418300654 0,369281 SS 4,472222222 0,25 0,25 8,666666667 13,63888889 df 5 24 MS F P-value F crit 0,894444 2,476923 0,060501 2,620654 0,25 0,692308 0,413583 4,259677 0,05 0,138462 0,98162 2,620654 0,361111 35 Bảng PL1.9: Kết nhạy Ciprofloxacin S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication ANOVA Source of Variation SS df MS Sample 5,805555556 1,161111 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn F P-value F crit 1,045 0,414522 2,620654 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XIV Columns Interaction Within 0,027777778 0,472222222 26,66666667 0,027778 0,094444 24 1,111111 Total 32,97222222 35 0,025 0,87569 4,259677 0,085 0,993937 2,620654 Bảng PL1.10: Kết nhạy Trimethoprim-sulfamethoxazole S flexneri trình bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance ANOVA Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 604 33,55555556 1,202614379 18 607 33,72222 0,565359 SS 9,805555556 0,25 1,583333333 18,66666667 df 5 24 30,30555556 MS 1,961111 0,25 0,316667 0,777778 F 2,521429 0,321429 0,407143 P-value 0,057023 0,576015 0,83903 F crit 2,620654 4,259677 2,620654 35 Bảng PL1.11: Kết mật độ S flexneri trình vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count 12 12 Sum 92,9620080393,04117 Average 7,7468340027,753431 Variance 0,0009044870,000744 Source of Variation SS df Sample 0,003928913 Columns 0,000261129 0,000261 0,309287 0,585812 4,493998 Interaction 0,000694984 0,000232 0,274385 0,842993 3,238872 Within 0,013508687 16 0,000844 Total 0,018393712 23 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn MS F P-value F crit 0,00131 1,551165 0,240017 3,238872 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XV Bảng PL1.12: Kết định danh S flexneri trình vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 12 1088,2 1114,1 90,68333333 92,84167 101,6378788 55,90083 SS 307,4545833 27,95041667 83,85125 1341,62 1760,87625 df 3 16 23 MS F P-value F crit 102,4849 1,222222 0,333941 3,238872 27,95042 0,333333 0,571738 4,493998 27,95042 0,333333 0,8014 3,238872 83,85125 Bảng PL1.13: Kết độ nhạy Ampicillin S flexneri vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 12 263 260 21,91666667 21,66667 0,810606061 0,969697 SS 5,791666667 0,375 1,125 12,66666667 19,95833333 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn df 3 16 23 MS F P-value F crit 1,930556 2,438596 0,102172 3,238872 0,375 0,473684 0,501155 4,493998 0,375 0,473684 0,70492 3,238872 0,791667 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XVI Bảng PL1.14: Kết độ nhạy Ciprofloxacin S flexneri vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 453 37,75 1,295454545 12 450 37,5 0,636364 SS 0,458333333 0,375 0,125 20,66666667 df 3 16 21,625 MS 0,152778 0,375 0,041667 1,291667 F 0,11828 0,290323 0,032258 P-value 0,948049 0,597432 0,991907 F crit 3,238872 4,493998 3,238872 23 Bảng PL1.15: Kết độ nhạy Trimethoprim-sulfamethoxazole S flexneri trình vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 12 404 402 33,66666667 33,5 0,424242424 0,818182 SS 4,166666667 0,166666667 0,833333333 8,666666667 13,83333333 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn df 3 16 23 MS F P-value F crit 1,388889 2,564103 0,091016 3,238872 0,166667 0,307692 0,586771 4,493998 0,277778 0,512821 0,679201 3,238872 0,541667 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XVII PHỤ LỤC 2: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH ANOVA CỦA MẪU MỦ GIẢ ĐỊNH Bảng PL2.1: Mật độ K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 61,53 Lô 10 61,42 Source of Variation SS df Between Groups 0,000605 Within Groups 0,04077 18 Total 0,041375 19 Average 6,153 6,142 Variance 0,001423333 0,003106667 MS 0,000605 0,002265 F 0,267108168 P-value F crit 0,61157 4,413873 Bảng PL2.2: Tỉ lệ định danh K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum API 20E Lô 10 979,9 API 20E Lô 10 982 Source of Variation SS df Between Groups 0,2205 Within Groups 23,409 18 Total 23,6295 19 Average 97,99 98,2 MS 0,2205 1,3005 Variance 1,241 1,36 F 0,169550173 P-value 0,685374 F crit 4,413873 Bảng PL2.3: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Amoxicillin/Clavulanic acid K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 197 Lô 10 199 Source of Variation SS df Between Groups 0,2 Within Groups 17 18 Total 17,2 19 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Average Variance 19,7 19,9 MS 0,2 0,944444444 0,9 0,988888889 F P-value F crit 0,211764706 0,650898 4,413873 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XVIII Bảng PL2.4: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Cefotaxime K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 234 Lô 10 238 Source of Variation SS df Between Groups 0,8 Within Groups 12 18 Total 12,8 19 Average 23,4 23,8 MS Variance 0,488888889 0,844444444 F 0,8 0,666666667 P-value F crit 1,2 0,287763 4,413873 Bảng PL2.5: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Ceftriaxone K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 203 Lô 10 204 Source of Variation SS df Between Groups 0,05 Within Groups 4,5 18 Total 4,55 19 Average 20,3 20,4 MS Variance 0,233333333 0,266666667 F 0,05 0,25 P-value F crit 0,2 0,660056 4,413873 Bảng PL2.6: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Ceftazidime K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum 16 131 15 135 Source of Variation SS df Between Groups 0,888889 Within Groups 6,222222 16 Total 7,111111 17 Average Variance 14,55555556 0,277778 15 0,5 MS F P-value 0,888888889 2,285714 0,150069 0,388888889 F crit 4,493998418 Bảng PL2.7: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Cefepime củaK pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 268 Lô 10 269 Source of Variation SS df Between Groups 0,05 Within Groups 8,5 18 Total 8,55 19 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Average Variance 26,8 26,9 MS 0,05 0,472222222 0,4 0,544444444 F P-value F crit 0,105882353 0,748634 4,413873 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XIX Bảng PL2.8: Đường kính nhạy cảm với kháng sinh Atreonam K pneumoniae Anova: Single Factor Groups Count Sum Lô 10 133 Lô 10 132 Source of Variation SS df Between Groups 0,05 Within Groups 3,7 18 Total 3,75 19 Average 13,3 13,2 MS 0,05 0,205555556 Variance 0,233333333 0,177777778 F 0,243243243 P-value 0,627837 F crit 4,413873 Bảng PL2.9: Nồng độ K pneumoniae điều kiện bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count 18 18 Sum 110,5293985 110,4778 Average 6,140522139 6,137658 Variance 0,001189953 0,001265 Source of Variation SS df Sample 0,013739374 Columns 7,38268E-05 Interaction 0,001323676 Within 0,026679023 24 MS 0,002747875 7,38268E-05 0,000264735 0,001111626 P-value 0,060904 0,798829 0,941689 P-value 0,060904 0,798829 0,941689 F crit 2,62065415 4,25967721 2,62065415 Bảng PL2.10: Tỉ lệ định danh K pneumoniae điều kiện bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 1762,5 1766,7 97,91666667 98,15 1,053235294 1,209706 SS 3,44 0,49 5,39 29,64 38,96 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn df 5 24 35 MS F P-value 0,688 0,557085 0,731597 0,49 0,396761 0,534718 1,078 0,872874 0,513829 1,235 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XX Bảng PL2.11: Độ nhạy với AUG K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 352 351 19,55555556 19,5 0,967320261 0,382353 SS 3,805555556 0,027777778 0,472222222 18,66666667 22,97222222 df 5 24 35 MS F P-value 0,761111 0,978571 0,450919 0,027778 0,035714 0,851696 0,094444 0,121429 0,986289 0,777778 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bảng PL2.12: Độ nhạy với Cefotaxime K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 431 23,94444444 0,526143791 18 431 23,94444 0,643791 SS 5,222222222 0,666666667 14 19,88888889 df 5 24 35 MS 1,044444 0,133333 0,583333 F 1,790476 0,228571 P-value 0,152942 0,946366 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bảng PL2.13: Độ nhạy với Ceftriaxone K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 358 19,88888889 0,575163399 18 361 20,05556 0,526144 SS 6,138888889 0,25 0,583333333 12 18,97222222 df Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 5 24 35 MS 1,227778 0,25 0,116667 0,5 F 2,455556 0,5 0,233333 P-value 0,062248 0,48631 0,944061 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XXI Bảng PL2.14: Độ nhạy với Ceftazidime K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 266 14,77777778 0,300653595 18 267 14,83333 0,382353 SS 1,805555556 0,027777778 0,472222222 9,333333333 df 5 24 11,63888889 MS 0,361111 0,027778 0,094444 0,388889 F 0,928571 0,071429 0,242857 P-value 0,479923 0,791551 0,939333 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 35 Bảng PL2.15: Độ nhạy với K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 463 25,72222222 0,447712418 SS 4,888888889 0,444444444 0,555555556 10,66666667 16,55555556 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 18 459 25,5 0,5 df 5 24 35 MS 0,977778 0,444444 0,111111 0,444444 F P-value 2,2 0,087712 0,327287 0,25 0,935688 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XXII Bảng PL2.16: Độ nhạy với Aztreonam K pneumoniae bảo quản Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 18 18 233 232 12,94444444 12,88889 0,290849673 0,575163 SS 4,916666667 0,027777778 0,472222222 9,333333333 14,75 df 5 24 MS F P-value 0,983333 2,528571 0,056485 0,027778 0,071429 0,791551 0,094444 0,242857 0,939333 0,388889 F crit 2,620654147 4,259677214 2,620654147 35 Bảng PL2.17: Nồng độ K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count 12 12 Sum 72,82 72,61 Average 6,068333333 6,050833 Variance 0,001178788 0,001281 Source of Variation SS df MS Sample 0,0043125 0,0014375 Columns 0,0018375 0,0018375 Interaction Within 0,007145833 0,0156 16 0,002381944 0,000975 Total 0,028895833 23 F 1,4743 59 1,8846 15 2,4430 P-value 0,25912 0,18874 0,10175 Bảng PL2.18: Tỉ lệ định danh K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance 12 12 1176,6 1172,1 98,05 97,675 1,235454545 0,771136 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn F crit 3,2388715 4,4939984 3,2388715 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XXIII Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total SS 1,09125 0,84375 0,64125 20,34 22,91625 df 3 16 23 MS F P-value F crit 0,36375 0,286136 0,8347 3,23887152 0,84375 0,663717 0,427211 4,49399842 0,21375 0,168142 0,916308 3,23887152 1,27125 Bảng PL2.19: Độ nhạy với Aztreonam K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum 12 234 Average 19,5 Variance Source of Variatio n Sample Columns Interaction Within Total 12 230 19,1666 1,96969 SS 10,3333333 0,66666666 2,33333333 20 33,3333333 df 3 16 MS 3,44444444 0,66666666 0,77777777 1,25 F 2,75555 0,53333 0,62222 P-value F crit 0,07649 3,23887152 0,47576 4,49399841 0,61084 3,238871522 23 Bảng PL2.20: Độ nhạy với Cefotaxime K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample 12 283 23,5833333 0,26515151 12 284 23,6666 0,78787 SS df Columns 3,125 0,04166666 Interaction Within Total 1,125 7,33333333 11,625 16 23 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn MS 1,04166666 0,04166666 0,375 0,45833333 F 2,27272 0,09090 0,81818 P-value 0,11928 0,76690 0,50258 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XXIV Bảng PL2.21: Độ nhạy với Ceftriaxone K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 243 20,25 0,56818181 12 240 20 0,54545 SS 2,45833333 df 0,375 0,45833333 9,33333333 12,625 16 23 MS 0,81944444 0,375 0,15277777 0,58333333 F 1,40476 0,64285 0,26190 P-value 0,27783 0,43442 0,85178 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 Bảng PL2.22: Độ nhạy với Ceftazidime K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 178 14,8333333 0,33333333 12 179 14,9166 SS 2,45833333 0,04166666 0,79166666 5,33333333 8,625 df 0,44697 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 3 16 23 MS 0,81944444 0,04166666 0,26388888 0,33333333 F 2,45833 0,125 0,79166 P-value 0,10032 0,72828 0,51615 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.HCM XXV Bảng PL2.23: Độ nhạy với Cefepime K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 307 25,5833333 1,17424242 12 303 25,25 0,38636 SS 1,83333333 0,66666666 0,66666666 14,6666666 17,8333333 df 3 16 MS 0,61111111 0,66666666 0,22222222 0,91666666 F 0,66666 0,72727 0,24242 P-value 0,58466 0,40635 0,86546 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 23 Bảng PL2.24: Độ nhạy với Aztreonam K pneumoniae vận chuyển Anova: Two-Factor With Replication Total Count Sum Average Variance Source of Variation Sample Columns Interaction Within Total 12 151 12,5833333 0,26515151 12 155 12,9166 0,62878 SS df 0,5 0,66666666 0,66666666 8,66666666 10,5 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 3 16 23 MS 0,16666666 0,66666666 0,22222222 0,54166666 F 0,30769 1,23076 0,41025 P-value 0,81947 0,28365 0,74782 F crit 3,23887152 4,49399841 3,23887152 ... tiếp chƣơng trình ngoại kiểm vi sinh với mẫu ngoại kiểm đƣợc gởi dƣới dạng mẫu bệnh phẩm giả định có chứa vi khuẩn gây bệnh [46] Đến năm 1985, có ghi nhận chƣơng trình ngoại kiểm vi sinh Châu Âu... cứu thử nghiệm sản xuất mẫu bệnh phẩm giả định 23 2.2 ĐỐI TƢỢNG NGHIÊN CỨU Đối tƣợng nghiên cứu quy trình sản xuất mẫu bệnh phẩm giả định gồm tiêu vi khuẩn, mẫu phân, mẫu mủ Các mẫu đƣợc nghiên... trình sản xuất mẫu bệnh phẩm giả định dùng ngoại kiểm vi sinh" với mục tiêu: Xây dựng quy trình sản xuất thử nghiệm mẫu tiêu nhuộm gram Staphylococcus aureus Escherichia coli đồng ổn định hình