1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam

99 25 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 99
Dung lượng 4,11 MB

Nội dung

Mẫu đề cương luận văn thạc sĩ 6,38 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN Phạm Thị Hương Quỳnh PHÁT TRIỂN QUY TRÌNH ExBP RT PHÁT HIỆN CÁC ĐỘT BIẾN ĐIỂM THƯỜNG GẶP TRÊN EGFR mRNA CỦA BỆNH NHÂN UNG THƯ PHỔI KHÔNG TẾ BÀO NHỎ Ở VIỆT NAM LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC HÀ NỘI 2021 HÀ NỘI 2021 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN Phạm Thị Hương Quỳnh PHÁT TRIỂN QUY TRÌNH ExBP RT PHÁT HIỆN CÁC ĐỘT BIẾN ĐIỂM THƯỜNG GẶP TRÊN EGFR mRNA CỦA BỆNH NHÂN UNG THƯ PHỔI KHÔNG TẾ BÀ.

Ngày đăng: 11/05/2022, 18:39

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
2. Nguyễn Thị Lan Anh (2017), "Nghiên cứu đặc điểm đột biến gen EGFR và mối liên quan với lâm sàng, cận lâm sàng ở bệnh nhân ung thư phổi biểu mô tuyến", Nội hô hấp.Website Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nghiên cứu đặc điểm đột biến gen EGFR và mối liên quan với lâm sàng, cận lâm sàng ở bệnh nhân ung thư phổi biểu mô tuyến
Tác giả: Nguyễn Thị Lan Anh
Năm: 2017
4. "Catalog Of Somatic Mutation In Cancer (COSMIC), Mutation COSV51765161,https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/mutation/overview?id=95491007".Tiếng Anh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Catalog Of Somatic Mutation In Cancer (COSMIC), Mutation COSV51765161, https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/mutation/overview?id=95491007
6. Arcila, M. E., Oxnard, G. R., Nafa, K., Riely, G. J., Solomon, S. B., Zakowski, M. F., Kris, M. G., Pao, W., Miller, V. A., and Ladanyi, M. (2011), "Rebiopsy of lung cancer patients with acquired resistance to EGFR inhibitors and enhanced detection of the T790M mutation using a locked nucleic acid-based assay", Clin Cancer Res, 17(5), pp. 1169-80 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Rebiopsy of lung cancer patients with acquired resistance to EGFR inhibitors and enhanced detection of the T790M mutation using a locked nucleic acid-based assay
Tác giả: Arcila, M. E., Oxnard, G. R., Nafa, K., Riely, G. J., Solomon, S. B., Zakowski, M. F., Kris, M. G., Pao, W., Miller, V. A., and Ladanyi, M
Năm: 2011
7. Babu Koyyala, V. P., Batra, U., Jain, P., Sharma, M., Goyal, P., Medisetty, P., Jajodia, A., and Maheshwari, U. D. (2018), "Frequency of T790M mutations after progression on epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitor in metastatic non-small cell lung cancer in Indian patients: real-time data from tertiary cancer hospital", Lung India, 35(5), pp. 390-394 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Frequency of T790M mutations after progression on epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitor in metastatic non-small cell lung cancer in Indian patients: real-time data from tertiary cancer hospital
Tác giả: Babu Koyyala, V. P., Batra, U., Jain, P., Sharma, M., Goyal, P., Medisetty, P., Jajodia, A., and Maheshwari, U. D
Năm: 2018
8. Bethune, G., Bethune, D., Ridgway, N., and Xu, Z. (2010), "Epidermal growth factor receptor (EGFR) in lung cancer: an overview and update", J Thorac Dis, 2(1), pp. 48-51 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Epidermal growth factor receptor (EGFR) in lung cancer: an overview and update
Tác giả: Bethune, G., Bethune, D., Ridgway, N., and Xu, Z
Năm: 2010
9. Brambilla, E. and Gazdar, A. (2009), "Pathogenesis of lung cancer signalling pathways: roadmap for therapies", Eur Respir J, 33(6), pp. 1485-97 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Pathogenesis of lung cancer signalling pathways: roadmap for therapies
Tác giả: Brambilla, E. and Gazdar, A
Năm: 2009
10. Ciuffreda, L., Incani, U. C., Steelman, L. S., Abrams, S. L., Falcone, I., Curatolo, A. D., Chappell, W. H., Franklin, R. A., Vari, S., Cognetti, F., McCubrey, J. A., and Milella, M. (2014), "Signaling intermediates (MAPK and PI3K) as therapeutic targets in NSCLC", Curr Pharm Des, 20(24), pp.3944-57 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Signaling intermediates (MAPK and PI3K) as therapeutic targets in NSCLC
Tác giả: Ciuffreda, L., Incani, U. C., Steelman, L. S., Abrams, S. L., Falcone, I., Curatolo, A. D., Chappell, W. H., Franklin, R. A., Vari, S., Cognetti, F., McCubrey, J. A., and Milella, M
Năm: 2014
11. Cortot, A. B. and Janne, P. A. (2014), "Molecular mechanisms of resistance in epidermal growth factor receptor-mutant lung adenocarcinomas", Eur Respir Rev, 23(133), pp. 356-66 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Molecular mechanisms of resistance in epidermal growth factor receptor-mutant lung adenocarcinomas
Tác giả: Cortot, A. B. and Janne, P. A
Năm: 2014
12. Chen, Y. L., Lin, C. C., Yang, S. C., Chen, W. L., Chen, J. R., Hou, Y. H., Lu, C. C., Chow, N. H., Su, W. C., and Ho, C. L. (2019), "Five Technologies for Detecting the EGFR T790M Mutation in the Circulating Cell-Free DNA of Patients With Non-small Cell Lung Cancer: A Comparison", Front Oncol, 9(631) Sách, tạp chí
Tiêu đề: Five Technologies for Detecting the EGFR T790M Mutation in the Circulating Cell-Free DNA of Patients With Non-small Cell Lung Cancer: A Comparison
Tác giả: Chen, Y. L., Lin, C. C., Yang, S. C., Chen, W. L., Chen, J. R., Hou, Y. H., Lu, C. C., Chow, N. H., Su, W. C., and Ho, C. L
Năm: 2019
13. Cheng, L., Alexander, R. E., Maclennan, G. T., Cummings, O. W., Montironi, R., Lopez-Beltran, A., Cramer, H. M., Davidson, D. D., and Zhang, S. (2012),"Molecular pathology of lung cancer: key to personalized medicine", Mod Pathol, 25(3), pp. 347-69 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Molecular pathology of lung cancer: key to personalized medicine
Tác giả: Cheng, L., Alexander, R. E., Maclennan, G. T., Cummings, O. W., Montironi, R., Lopez-Beltran, A., Cramer, H. M., Davidson, D. D., and Zhang, S
Năm: 2012
14. da Cunha Santos, G., Shepherd, F. A., and Tsao, M. S. (2011), "EGFR mutations and lung cancer", Annu Rev Pathol, 6, pp. 49-69 Sách, tạp chí
Tiêu đề: EGFR mutations and lung cancer
Tác giả: da Cunha Santos, G., Shepherd, F. A., and Tsao, M. S
Năm: 2011
15. de Biase, D., Visani, M., Malapelle, U., Simonato, F., Cesari, V., Bellevicine, C., Pession, A., Troncone, G., Fassina, A., and Tallini, G. (2013), "Next- generation sequencing of lung cancer EGFR exons 18-21 allows effective molecular diagnosis of small routine samples (cytology and biopsy)" , PLoS One, 8(12), pp. e83607 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Next-generation sequencing of lung cancer EGFR exons 18-21 allows effective molecular diagnosis of small routine samples (cytology and biopsy)
Tác giả: de Biase, D., Visani, M., Malapelle, U., Simonato, F., Cesari, V., Bellevicine, C., Pession, A., Troncone, G., Fassina, A., and Tallini, G
Năm: 2013
17. Ding, X., Liu, X., Song, X., and Yao, J. (2016), "Chemotherapy Drug Response to the L858R-induced Conformational Change of EGFR Activation Loop in Lung Cancer", Mol Inform, 35(10), pp. 529-537 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Chemotherapy Drug Response to the L858R-induced Conformational Change of EGFR Activation Loop in Lung Cancer
Tác giả: Ding, X., Liu, X., Song, X., and Yao, J
Năm: 2016
20. Ellison, G., Donald, E., McWalter, G., Knight, L., Fletcher, L., Sherwood, J., Cantarini, M., Orr, M., and Speake, G. (2010), "A comparison of ARMS and DNA sequencing for mutation analysis in clinical biopsy samples", J Exp Clin Cancer Res, 29, pp. 132 Sách, tạp chí
Tiêu đề: A comparison of ARMS and DNA sequencing for mutation analysis in clinical biopsy samples
Tác giả: Ellison, G., Donald, E., McWalter, G., Knight, L., Fletcher, L., Sherwood, J., Cantarini, M., Orr, M., and Speake, G
Năm: 2010
22. Fahoum, I., Forer, R., Volodarsky, D., Vulih, I., Bick, T., Sarji, S., Bamberger, Z., Ben-Izhak, O., Sabo, E., Hershberg, R., and Hershkovitz, D. (2018),"Characterization of Factors Affecting the Detection Limit of EGFR p.T790M in Circulating Tumor DNA", Technol Cancer Res Treat, 17, pp.1533033818793653 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Characterization of Factors Affecting the Detection Limit of EGFR p.T790M in Circulating Tumor DNA
Tác giả: Fahoum, I., Forer, R., Volodarsky, D., Vulih, I., Bick, T., Sarji, S., Bamberger, Z., Ben-Izhak, O., Sabo, E., Hershberg, R., and Hershkovitz, D
Năm: 2018
23. Farell, E. M. and Alexandre, G. (2012), "Bovine serum albumin further enhances the effects of organic solvents on increased yield of polymerase chain reaction of GC-rich templates", BMC Res Notes, 5(257) Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bovine serum albumin further enhances the effects of organic solvents on increased yield of polymerase chain reaction of GC-rich templates
Tác giả: Farell, E. M. and Alexandre, G
Năm: 2012
25. Ferlay, J., Colombet, M., Soerjomataram, I., Mathers, C., Parkin, D. M., Pineros, M., Znaor, A., and Bray, F. (2019), "Estimating the global cancer incidence and mortality in 2018: GLOBOCAN sources and methods", Int J Cancer, 144(8), pp. 1941-1953 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Estimating the global cancer incidence and mortality in 2018: GLOBOCAN sources and methods
Tác giả: Ferlay, J., Colombet, M., Soerjomataram, I., Mathers, C., Parkin, D. M., Pineros, M., Znaor, A., and Bray, F
Năm: 2019
26. Flys, T., Nissley, D. V., Claasen, C. W., Jones, D., Shi, C., Guay, L. A., Musoke, P., Mmiro, F., Strathern, J. N., Jackson, J. B., Eshleman, J. R., and Eshleman, S. H. (2005), "Sensitive drug-resistance assays reveal long-term persistence of HIV-1 variants with the K103N nevirapine (NVP) resistance mutation in some women and infants after the administration of single-dose NVP: HIVNET 012", J Infect Dis, 192(1), pp. 24-9 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Sensitive drug-resistance assays reveal long-term persistence of HIV-1 variants with the K103N nevirapine (NVP) resistance mutation in some women and infants after the administration of single-dose NVP: HIVNET 012
Tác giả: Flys, T., Nissley, D. V., Claasen, C. W., Jones, D., Shi, C., Guay, L. A., Musoke, P., Mmiro, F., Strathern, J. N., Jackson, J. B., Eshleman, J. R., and Eshleman, S. H
Năm: 2005
28. Fukui, T., Okasaka, T., Kawaguchi, K., Fukumoto, K., Nakamura, S., Hakiri, S., Ozeki, N., and Yokoi, K. (2016), "Conditional Survival After Surgical Intervention in Patients With Non-Small Cell Lung Cancer", Ann Thorac Surg, 101(5), pp. 1877-82 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Conditional Survival After Surgical Intervention in Patients With Non-Small Cell Lung Cancer
Tác giả: Fukui, T., Okasaka, T., Kawaguchi, K., Fukumoto, K., Nakamura, S., Hakiri, S., Ozeki, N., and Yokoi, K
Năm: 2016
29. Fumagalli, C., Vacirca, D., Rappa, A., Passaro, A., Guarize, J., Rafaniello Raviele, P., de Marinis, F., Spaggiari, L., Casadio, C., Viale, G., Barberis, M., and Guerini-Rocco, E. (2018), "The long tail of molecular alterations in non- small cell lung cancer: a single-institution experience of next-generation sequencing in clinical molecular diagnostics", J Clin Pathol, 71(9), pp. 767- 773 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The long tail of molecular alterations in non-small cell lung cancer: a single-institution experience of next-generation sequencing in clinical molecular diagnostics
Tác giả: Fumagalli, C., Vacirca, D., Rappa, A., Passaro, A., Guarize, J., Rafaniello Raviele, P., de Marinis, F., Spaggiari, L., Casadio, C., Viale, G., Barberis, M., and Guerini-Rocco, E
Năm: 2018

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

có thể do đột biến EGFR T790M làm biến đổi cấu hình không gian, từ đó làm tăng ái - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
c ó thể do đột biến EGFR T790M làm biến đổi cấu hình không gian, từ đó làm tăng ái (Trang 25)
Các thiết bị chính sử dụng trong nghiên cứu được liệt kê trong bảng 1. - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
c thiết bị chính sử dụng trong nghiên cứu được liệt kê trong bảng 1 (Trang 38)
Bảng 3: Danh mục mồi/đầu dò được sử dụng trong RT-qPCR - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 3 Danh mục mồi/đầu dò được sử dụng trong RT-qPCR (Trang 41)
Bảng 4: Thành phần phản ứng khuếch đại RNA EGFR tổng số bằng cặp mồi T790M_Fw/T790M_RvT/T790M_P - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 4 Thành phần phản ứng khuếch đại RNA EGFR tổng số bằng cặp mồi T790M_Fw/T790M_RvT/T790M_P (Trang 44)
Bảng 6: Chu trình nhiệt one-step RT-qPCR - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 6 Chu trình nhiệt one-step RT-qPCR (Trang 45)
Bảng 5: Thành phần phản ứng khuếch đại DNA EGFR tổng số bằng cặp mồi T790M_Fw/T790M_RvT/T790M_P - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 5 Thành phần phản ứng khuếch đại DNA EGFR tổng số bằng cặp mồi T790M_Fw/T790M_RvT/T790M_P (Trang 45)
Bảng 8: Thành phần phản ứng khuếch đại DNA EGFR tổng số bằng cặp mồi L858R_Fw/L858R_RvT/L858R_P - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 8 Thành phần phản ứng khuếch đại DNA EGFR tổng số bằng cặp mồi L858R_Fw/L858R_RvT/L858R_P (Trang 46)
Bảng 7: Thành phần phản ứng khuếch đại RNA EGFR tổng số bằng cặp mồi L858R_Fw/L858R_RvT/L858R_P - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 7 Thành phần phản ứng khuếch đại RNA EGFR tổng số bằng cặp mồi L858R_Fw/L858R_RvT/L858R_P (Trang 46)
Bảng 10: Dải tỉ lệ trộn của RNA T790 M: RNA EGFR kiểu dại - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 10 Dải tỉ lệ trộn của RNA T790 M: RNA EGFR kiểu dại (Trang 47)
Bảng 11: Dải tỉ lệ trộn của RNA L858 R: RNA EGFR kiểu dại - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 11 Dải tỉ lệ trộn của RNA L858 R: RNA EGFR kiểu dại (Trang 48)
Bảng 13: Kết quả đánh giá độ tinh sạch và nồng độ các mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 13 Kết quả đánh giá độ tinh sạch và nồng độ các mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo (Trang 53)
Bảng 14: Giá trị Ct của phản ứng đánh giá mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo bằng cặp mồi tổng số T790M_Fw/T790M_RvT và đầu dò T790M_P - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 14 Giá trị Ct của phản ứng đánh giá mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo bằng cặp mồi tổng số T790M_Fw/T790M_RvT và đầu dò T790M_P (Trang 55)
Bảng 15: Giá trị Ct của phản ứng đánh giá RNA tổng hợp nhân tạo bằng cặp mồi tổng số L858R_Fw/L858R_RvT và đầu dò L858R_P - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 15 Giá trị Ct của phản ứng đánh giá RNA tổng hợp nhân tạo bằng cặp mồi tổng số L858R_Fw/L858R_RvT và đầu dò L858R_P (Trang 56)
khuếch đại RNA tổng số là T790M_Fw/T790M_RvT/T790M_P (Hình 14). - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
khu ếch đại RNA tổng số là T790M_Fw/T790M_RvT/T790M_P (Hình 14) (Trang 59)
Các phản ứng với 6 điều kiện về BSA và Glycerol ở bảng 16 được chú thích màu như trong hình - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
c phản ứng với 6 điều kiện về BSA và Glycerol ở bảng 16 được chú thích màu như trong hình (Trang 61)
Bảng 17: Thành phần phản ứng tối ưu của phản ứng ExBP-RT phát hiện đột - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 17 Thành phần phản ứng tối ưu của phản ứng ExBP-RT phát hiện đột (Trang 63)
không có khác biệt giữa phản ứng có/không bổ sung DMSO vào phản ứng (Hình 18). Do vậy, DMSO không được bổ sung vào các thí nghiệm tối ưu tiếp theo - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
kh ông có khác biệt giữa phản ứng có/không bổ sung DMSO vào phản ứng (Hình 18). Do vậy, DMSO không được bổ sung vào các thí nghiệm tối ưu tiếp theo (Trang 64)
trình bày ở bảng 18 và chu trình nhiệt như bảng 6. - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
tr ình bày ở bảng 18 và chu trình nhiệt như bảng 6 (Trang 66)
Bảng 18: Thành phần phản ứng tối ưu của phản ứng phản hiện đột biến EGFR - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 18 Thành phần phản ứng tối ưu của phản ứng phản hiện đột biến EGFR (Trang 67)
3.3.2. Đánh giá khả năng phát hiện đột biến điểm EGFRL858R trên RNA ở - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
3.3.2. Đánh giá khả năng phát hiện đột biến điểm EGFRL858R trên RNA ở (Trang 69)
Bảng 20: Kết quả đánh giá độ nhạy, độ đặc hiệu và độ chính xác lâm sàng của quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến RNA EGFR L858R trên mẫu mô đúc nến - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 20 Kết quả đánh giá độ nhạy, độ đặc hiệu và độ chính xác lâm sàng của quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến RNA EGFR L858R trên mẫu mô đúc nến (Trang 70)
Bảng 21: Các mẫu mô dương tính EGFRL858R mRNA bằng quy trình ExBP-RT - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 21 Các mẫu mô dương tính EGFRL858R mRNA bằng quy trình ExBP-RT (Trang 72)
Bảng 22: Kết quả độ nhạy, độ đặc hiệu và độ chính xác lâm sàng của quy trình phát hiện đột biến EGFR T790M trêm mRNA ở nhóm bệnh nhân trước điều trị - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 22 Kết quả độ nhạy, độ đặc hiệu và độ chính xác lâm sàng của quy trình phát hiện đột biến EGFR T790M trêm mRNA ở nhóm bệnh nhân trước điều trị (Trang 75)
động giữa RNA đột biến/RNA tổng số là từ 0,236 %- 2,368% (Bảng 23). Trên 44 mẫu âm tính với EGFR T790M trên DNA cũng đều cho kết quả âm tính với quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến EGFR T790M trên mRNA với ∆Ct mẫu >14 = ∆Ct cut-off (Phụ lục 2) - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
ng giữa RNA đột biến/RNA tổng số là từ 0,236 %- 2,368% (Bảng 23). Trên 44 mẫu âm tính với EGFR T790M trên DNA cũng đều cho kết quả âm tính với quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến EGFR T790M trên mRNA với ∆Ct mẫu >14 = ∆Ct cut-off (Phụ lục 2) (Trang 75)
cho kết quả EGFR T790M dương tính (Hình 25, Phụ lục 3). Kết hợp với kết quả trên mẫu trước điều trị, cho thấy độ đặc hiệu của quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
cho kết quả EGFR T790M dương tính (Hình 25, Phụ lục 3). Kết hợp với kết quả trên mẫu trước điều trị, cho thấy độ đặc hiệu của quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến (Trang 76)
Bảng 25: Kết quả các mẫu dương tính EGFR T790M trên mRNA - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
Bảng 25 Kết quả các mẫu dương tính EGFR T790M trên mRNA (Trang 79)
Hình PL 1: Hình ảnh kết quả one-step RT-qPCR đánh giá DNA lẫn trong mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo EGFR T790M và EGFR kiểu dại bằng cặp mồi EGFR - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
nh PL 1: Hình ảnh kết quả one-step RT-qPCR đánh giá DNA lẫn trong mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo EGFR T790M và EGFR kiểu dại bằng cặp mồi EGFR (Trang 95)
Hình PL 2: Hình ảnh kết quả one-step RT-qPCR đánh giá DNA lẫn trong mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo EGFR L858R và EGFR kiểu dại bằng cặp mồi EGFR - Phát triển quy trình ExBPRT phát hiện các đột biến điểm thường gặp trên gen EGFR mRNA của bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ ở Việt Nam
nh PL 2: Hình ảnh kết quả one-step RT-qPCR đánh giá DNA lẫn trong mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo EGFR L858R và EGFR kiểu dại bằng cặp mồi EGFR (Trang 95)

TRÍCH ĐOẠN

Thu thập, bảo quản và tách chiết mẫu bệnh phẩm Phân tích đột biến trên DNA bằng phương pháp ARMS Phân tích thống kê Đánh giá kích thước mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo Đánh giá mẫu chuẩn RNA tổng hợp nhân tạo bằng cặp mồi tổng số Tối ưu quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến điểm EGFR trên RNA Đánh giá quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến EGFR T790M trên mRNA Đánh giá tiềm năng ứng dụng của quy trình ExBP-RT phát hiện đột biến

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w