Để tạo hành lang pháp lý cho công tác huy động vốn ngày 26/7/1994, Chính phủ ban hành Nghị định 72/CP về quy chế phát hành TPCP. Theo đó, cơ chế phát hành TPCP đã đƣợc cải tiến và mở rộng với nhiều hình thức khác nhau nhƣ: phát hành trực tiếp qua hệ thống KBNN, đấu thầu quá NHNN và đại lý phát hành.
Sau khi có Nghị định 72/CP của Chính phủ và các Thông tƣ hƣớng dẫn của Bộ Tài chính, tháng 6/1995 hệ thống KBNN chỉ phát hành trực tiếp ra công chúng các loại trái phiếu kho bạc có kỳ hạn từ một đến hai năm. Các đợt phát hành đƣợc thực hiện tƣơng đối liên tục trong năm tại tất cả các đơn vị KBNN. Kênh huy động vốn này đã thu hút đƣợc một khối lƣợng đáng kể tiền
nhàn rỗi trong nền kinh tế, đặc biệt là từ khu vực dân cƣ, phục vụ cho đầu tƣ phát triển.
Đối với tín phiếu kho bạc ngắn hạn (dƣới một năm), KBNN đã phối hợp với NHNN đƣa vào hoạt động thị trƣờng đấu thầu theo hình thức chiết khấu. Việc triển khai kênh phát hành này đánh dấu một bƣớc tiến mới về phƣơng thức và kỹ thuật phát hành TPCP theo thông lệ quốc tế.
Hoạt động thị trƣờng đấu thầu tín phiếu kho bạc, khi còn ở giai đoạn thử nghiệm, song đã mang lại những kết quả thiết thực. Cơ chế đấu thầu đã bƣớc đầu tạo ra cơ hội cạnh tranh, hình thành lãi suất tín phiếu theo cơ chế thị trƣờng. Tín phiếu phát hành theo hình thức ghi sổ nên giảm bớt chi phí phát hành. NHNN thực hiện việc quản lý sổ sách và thanh toán tín phiếu. Nghiệp vụ quản lý phát hành và thanh toán tƣơng đối đơn giản, thuận lợi cho cả nhà phát hành và các nhà đầu tƣ.
Sau khi Chính phủ ban hành nghị định 72/CP, việc phát hành trái phiếu công trình địa phƣơng và trung ƣơng đã có bƣớc phát triển mới. KBNN đã phối hợp với các bộ, ngành và địa phƣơng xây dựng các đề án và tổ chức huy động vốn để đầu tƣ một số công trình quan trọng nằm trong kế hoạch đầu tƣ của Nhà nƣớc nhƣng chƣa kịp bố trí vốn. Nguồn vốn thanh toán trái phiếu đƣợc cân đối trong kế hoạch đầu tƣ của ngành, địa phƣơng và các nguồn thu khác do công trình mang lại. Nhờ có nguồn thu từ trái phiếu mà một số công trình trung ƣơng cũng nhƣ địa phƣơng đƣợc đẩy nhanh tiến độ thực hiện, nâng cao hiệu quả đầu tƣ, phục vụ kịp thời yêu cầu phát triển kinh tế - xã hội. Mặt khác, việc phát hành thành công TPCP tài trợ cho các công trình đã mở ra một cơ chế huy động vốn khá hiệu quả cho các công trình, dự án đầu tƣ ở nƣớc ta.
Tháng 5/1999, KBNN phát hành công trái XDTQ, cơ chế phát hành và thanh toán đã có một bƣớc đổi mới căn bản so với việc phát hành công trái giai đoạn 1983-1988, phù hợp hơn với cơ chế thị trƣờng, đủ sức hấp dẫn
ngƣời mua, nên kết quả phát hành rất khả quan. Đây là đợt phát hành TPCP có kỳ hạn dài nhất trong giai đoạn 1991-1999.