Các vấn ựề môi trường trong NTTS phát sinh do nuôi trồng thuỷ sản phụ thuộc rất lớn vào môi trường (như nước, thành phần thức ăn, giống,ẦỢ và Ộdịch vụỢ (như vùng sinh thái ven bờ ựể thải nước từ các ao nuôi). Tác ựộng qua lại giữa NTTS và môi trường bị ảnh hưởng bởi nhiều yếu tố có mối quan hệ tương hỗ như tắnh sẵn có, số lượng và chất lượng của các nguồn ựược sử dụng, loài nuôi, quy mô trại nuôi, thiết kế và quản lý mô hình nuôi và ựặc ựiểm môi trường của vùng nuôi. Các vấn ựề chắnh là [14]:
- NTTS thường rất nhạy cảm với các thay ựổi bất lợi của môi trường (như chất lượng nguồn nước, giống và chất lượng thức ăn), và có thể bị ảnh hưởng nghiêm trọng bởi sự ô nhiễm nguồn nước.
- NTTS không thể tránh khỏi sự tác ựộng qua lại với các ngành nghề không liên quan trực tiếp ựến nuôi trồng thuỷ sản nhưng các nghề này lại phụ thuộc vào các nguồn tài nguyên sử dụng ỘcungỢ như nguồn nước và ựất, các mâu thuẫn có thể phát sinh ở những nơi mà cấu trúc thể chế/luật pháp/xã hội chắnh thức và không chắnh thức không ựủ ựể giải quyết các mâu thuẫn và sự phân chia nguồn lợi giữa các nhóm có sự cạnh tranh.
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 21 hướng bảo vệ và nâng cao chất lượng môi trường. điều này làm nảy sinh khả năng ựáng chú ý là người nuôi phải hoạt ựộng trong mối quan hệ cộng tác với nhau và với các nhóm khác trong cùng mối quan tâm bảo vệ môi trường thuỷ sinh thông qua quản lý trên cơ sở cộng ựộng hoặc ựồng quản lý.
Sự tương tác giữa nuôi trồng thuỷ sản và môi trường toàn cầu là ựiều ựã ựược biết ựến từ lâu, ựó là tác ựộng của sự thay ựổi môi trường ựối với NTTS, tác ựộng của NTTS ựến môi trường và sự tác ựộng của loại hình NTTS với nhau. Các vấn ựề môi trường quan trọng gồm:
- Tác ựộng của sự thay ựổi môi trường ựến hoạt ựộng NTTS.
- Hệ quả sinh thái do sự chuyển ựổi và thay ựổi các sinh cảnh tự nhiên liên quan ựến các vấn ựề như phá rừng ngập mặn, xây dựng các cơ sở nuôi và xây dựng cơ sở hạ tầng các vùng nuôi trồng thuỷ sản.
- Những vấn ựề về ựa dạng sinh học nảy sinh trước hết do sự khai thác giống bố mẹ, giống ngoài tự nhiên về việc các loài nuôi thoát ra ngoài môi trường ngoài.
- Khai thác quá mức các loài cá ngoài tự nhiên ựể làm giống cho các trại nuôi cá và việc thất thoát các nguồn ựạm từ cá (sinh khối) ở cấp quốc gia, khu vực và thế giới.
- Dịch chuyển các ựộng vật sống giữa các quốc gia liên quan ựến các mối nguy về biến ựổi gen, các loài ngoại lai và các tác nhân gây bệnh mới.
- Chất thải của nuôi trồng thuỷ sản gây ô nhiễm trong cơ sở nuôi và vùng ven bờ. - Sự rò rỉ và thải nước mặn từ các ao nuôi có thể dẫn ựến mặn hoá nguồn nước ngầm và vùng ựất nông nghiệp lân cận.
- Sử dụng cá tạp hoặc bột cá và dầu cá làm thức ăn NTTS.
- Việc sử dụng không hợp lý các loại hoá chất và thuốc làm gia tăng các mối lo ngại về sức khoẻ và môi trường.
- Sự lây lan bệnh của ựộng vật dưới nước.
- Các vấn ựề về an toàn thực phẩm và sức khoẻ người tiêu dùng.
Trường đại học Nông nghiệp Hà Nội Ờ Luận văn thạc sĩ khoa học nông nghiệp ẦẦẦẦẦẦẦẦ 22 sử dụng các nguồn tài nguyên trong NTTS so với các ngành nghề hoặc với những người sử dụng nguồn lợi mang tắnh cạnh tranh. Mức ựộ của tác ựộng qua lại với môi trường là rất khác nhau tuỳ thuộc vào mô hình nuôi, ựịa ựiểm, các yếu tố kinh tế xã hội và các khuyến khắch hoặc trở ngại khác.