- Khỏm, chữa bệnh cho cỏn bộ chiến sĩ cụng an và nhõn dõn. Tổ chức khỏm, chữa bệnh nội trỳ, ngoại trỳ và thực hiện chăm súc sức khỏe ban đầu bằng cỏc phương phỏp y học cổ truyền; kết hợp y học cổ truyền và y học hiện đại. Tham gia
chương trỡnh y tế cộng đồng và khỏm chữa bệnh bảo hiểm y tế theo quy định của Nhà nước và của Bộ Cụng an.
- Kế thừa và nghiờn cứu khoa học: Nghiờn cứu, xỏc minh, đỏnh giỏ và kế thừa cỏc bài thuốc cổ truyền, cỏc cõy, con làm thuốc, cỏc phương phỏp chữa bệnh bằng y học cổ truyền để nõng cao chất lượng khỏm, chữa bệnh.
- Đào tạo cỏn bộ y tế: Bệnh viện Y học cổ truyền Bộ Cụng an là cơ sở thực hành cho cỏc trường Đại học, Trung học Y, Dược và Y học cổ truyền. Tổ chức bồi dưỡng, đào tạo lại về Y học cổ truyền cho cỏc thành viờn trong bệnh viện và cỏc cỏn bộ y tế khỏc nhằm khụng ngừng nõng cao trỡnh độ chuyờn mụn về y học cổ truyền.
- Chỉ đạo tuyến dƣới về chuyờn mụn kỹ thuật: Tổ chức thực hiện việc chỉ đạo chuyờn mụn kỹ thuật cho cỏc tuyến y tế cơ sở.
- Tuyờn truyền phũng bệnh bằng y học cổ truyền; tham gia phũng chống cỏc dịch bệnh.
- Hợp tỏc quốc tế: Tham gia cỏc chương trỡnh hợp tỏc quốc tế về y học cổ truyền với cỏc tổ chức hoặc cỏc cỏ nhõn ở nước ngoài theo đỳng quy định của Nhà nước và của Bộ Cụng an.
- Tổ chức bào chế, sản xuất thuốcy học cổ truyền theo quy định của Nhà nước và của Bộ Cụng an đỏp ứng nhu cầu chăm súc, bảo vệ sức khỏe cỏn bộ chiến sĩ và điều trị tại Bệnh viện.
- Quản lý tài chớnh trong bệnh viện được thể hiện bằng 02 nguồn sau:
+ Nguồn kinh phớ thường xuyờn ( Bệnh viện YHCT là bệnh viện của ngành Cụng an do vậy kinh phớ sẽ theo định mức và quy định của bộ. Căn cứ vào dự toỏn hàng năm Bộ sẽ cấp theo nghị định 25 của chớnh phủ quy định tiền thuốc và tiền húa chất vật tư tiờu hao; Lương của cỏn bộ chiến sĩ ăn theo cấp bậc được quyết toỏn ngõn sỏch; Kinh phớ duy tu bảo dưỡng sửa chữa cơ sở hạ tầng, trang thiết bị phục vụ cụng tỏc chuyờn mụn được cấp theo quy định. Cỏc nguồn kinh phớ được Bộ thụng bỏo vốn từ đầu năm. Căn cứ thụng bỏo vốn đơn vị lập quy chế chi tiờu nội bộ và gửi về cho cỏc khoa phũng liờn quan lập kế hoạch chi tiờu cho năm.) Hàng quý bệnh viện bỏo cỏo quyết toỏn gửi lờn đơn vị quản lý cấp trờn phờ duyệt quyết toỏn.
+ Nguồn kinh phớ khỏc bao gồm thu từ nguồn BHYT ,nguồn trụng giữ xe ụ tụ, xe mỏy và thu từ dịch vụ bỏn căng tin… Bệnh viện thực hiện chức năng khỏm chữa bệnh dịch vụ bảo hiểm y tế, kinh phớ được trớch lại theo quy định 30% trong 30% thu về bệnh viện được sử dụng 28% cũn 2% phải nộp về Bộ. Thực hiện chi tiờu theo quy chế chi tiờu nội bộ như chi cho mua sắm thiết bị phục vụ cụng tỏc chuyờn mụn, chi duy tu bảo dưỡng sửa chữa mỏy múc và cơ sở hạ tầng và chi cho cỏn bộ chiến sĩ ăn ca theo quy định.